New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5907241 = | 74 (1.310) | 5 (0.090) | 5/242 | NT | 7.2% | coding (726/1095 nt) | spuE | spermidine/putrescine ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | 5907301 = | 61 (1.160) | coding (666/1095 nt) | spuE | spermidine/putrescine ABC transporter substrate‑binding protein |
AACCAGAGGTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGTTGAGCACCGCTGGCAGCATTTCGTCCGCCGAGTCGAGGAAGG > NC_002947/5907155‑5907449 | aaCCAGAGGTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACtt > 6:84640/1‑149 (MQ=255) aaCCAGAGGTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACtt > 6:216233/1‑149 (MQ=255) aCCAGAGGTTGCCGCCTTCCTTTGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTg > 6:183718/1‑149 (MQ=255) aCCAGAGGTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTg < 2:91483/149‑1 (MQ=255) agagGTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CTCCATTGGCCAGGTCGGTTATGTACTTGGaa > 3:71000/1‑148 (MQ=255) cgaccccaaggattacgccaaggccgagcagaagctgctggccgtgcgcccgtacgtgacctacttccactcgtccaagTACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAg > 6:109736‑M1/80‑149 (MQ=255) gTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGt < 6:75098/149‑1 (MQ=255) gTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGt < 6:112662/149‑1 (MQ=255) gccgccTTCCTTGGTAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCGTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCTCGACGCTGATGT‑CGCGATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTgg < 6:200670/148‑1 (MQ=255) gccgccTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTgg < 5:108118/148‑1 (MQ=255) gccgccTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTgg < 2:314191/148‑1 (MQ=255) ccgccTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTgg > 4:145987/1‑147 (MQ=255) ccgccTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGaa < 2:314244/149‑1 (MQ=255) ccgccTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGa < 7:97193/148‑1 (MQ=255) ccaaggattacgccaaggccgagcagaagctgctggccgtgcgcccgtacgtgacctacttccactcgtccaagTACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTg < 3:340020‑M1/64‑1 (MQ=255) ccaaggattacgccaaggccgagcagaagctgctggccgtgcgcccgtacgtgacctacttccactcgtccaagTACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTg > 4:340020‑M1/75‑138 (MQ=255) cgccTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAg > 7:115862/1‑149 (MQ=255) gccTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGt < 5:305186/149‑1 (MQ=255) cttccttGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAg < 5:84640/149‑1 (MQ=255) ccttGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGTCCGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAg < 1:68661/147‑1 (MQ=255) ccttGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAgg < 6:301127/147‑1 (MQ=255) cttGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATTCATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTc < 7:235018/148‑1 (MQ=255) gccaaggccgagcagaagctgctggccgtgcgcccgtacgtgacctacttccactcgtccaagTACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACCCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACt < 5:21891‑M1/62‑1 (MQ=255) ggAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGt < 3:352669/148‑1 (MQ=255) ttCACACCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCcagcag > 5:242864/1‑149 (MQ=255) cacCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTc > 4:281146/1‑149 (MQ=255) ccgtggatcGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCt < 8:267161/141‑1 (MQ=255) cccTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑GGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGt < 1:253488/119‑1 (MQ=255) cccTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGt > 2:253488/1‑119 (MQ=255) ccTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCGTGGAAAACATAACCCGACAAACCTGCCCCCCCCCACATGT‑CGCAATTGCCCAGGACGGTCAAGACATAGGACGAGTGGAATTAGTTCACTTACGGCCGAACGGCCAGCAGCTTCTg > 4:201153/1‑148 (MQ=255) ccTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGc > 1:363392/1‑149 (MQ=255) ccTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGc > 7:34666/1‑149 (MQ=255) ttagCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGACAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTAGGc > 5:184618/4‑149 (MQ=255) tcGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGAc < 1:145735/98‑1 (MQ=255) tcGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGAc > 2:145735/1‑98 (MQ=255) tcGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAAACTGCCGCGACGAAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGTACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGCCGCACGTCCAGCAGCTTCTGCTCGGcc > 5:231836/1‑149 (MQ=255) cttcttCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTg < 8:34666/149‑1 (MQ=255) gcgGGCCTTGGCCTGGAATACATCACGCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCt > 1:8848/1‑149 (MQ=255) gtgCCTTGTCCTGGAATACATCACCAGAGAAACCTGACTCGACGCATATGT‑CTCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTTGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCAAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTg < 6:184618/147‑1 (MQ=255) gggCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTg > 1:185412/1‑149 (MQ=255) gCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTggg > 1:97034/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTg < 1:268609/146‑1 (MQ=255) ccTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTg > 2:268609/1‑146 (MQ=255) ctcgtccaagtacatcaccgacctggccaatggcgacatctgcgtcgcggcaggtttctcgggtgatgtaCTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCg > 6:109736‑M2/71‑149 (MQ=255) gCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGACGTAATCCTTGGGGTCGGt > 1:313540/1‑149 (MQ=255) ccTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTg < 8:115862/149‑1 (MQ=255) tGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTggg > 4:9881/1‑140 (MQ=255) tGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTggg < 3:9881/140‑1 (MQ=255) gAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTgg < 5:356187/137‑1 (MQ=255) gAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTgg > 6:356187/1‑137 (MQ=255) caagtacatcaccgacctggccaatggcgacatctgcgtcgcggcaggtttctcgggtgatgtaCTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTgg > 4:340020‑M2/65‑138 (MQ=255) caagtacatcaccgacctggccaatggcgacatctgcgtcgcggcaggtttctcgggtgatgtaCTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTgg < 3:340020‑M2/74‑1 (MQ=255) agtacatcaccgacctggccaatggcgacatctgggtcgcggcaggtttctcgggtgatgtaCTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGc < 5:21891‑M2/63‑1 (MQ=255) CATCACCCGAGATAACTGCAGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCGATGTCGGTGATGTACTTGTACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACTGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTTGGGTATGTTCTGTTCgg > 4:71000‑M1/1‑148 (MQ=255) CATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCATAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCgg > 5:216233‑M1/1‑148 (MQ=255) CATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CACCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCggg < 7:201337‑M1/149‑1 (MQ=255) TCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGtt < 8:95645‑M1/149‑1 (MQ=255) ACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CACCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGa > 8:201337‑M1/1‑149 (MQ=255) CCCGAGACACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGTTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAg > 8:327542‑M1/1‑149 (MQ=255) CCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGACGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAg > 2:313540‑M1/1‑149 (MQ=255) CCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAgg > 5:97506‑M1/1‑149 (MQ=255) cgacctggccaatggcgacatctgcgtcgcggcaggtttctcgggtgatgtaCTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAgg < 5:109736‑M2/97‑1 (MQ=255) cGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGc < 2:363392/149‑1 (MQ=255) gagaAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGc > 3:286709/1‑148 (MQ=255) agaAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGccc < 3:145987/149‑1 (MQ=255) aaaCCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCAt < 6:242864/149‑1 (MQ=255) cTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAg < 5:183718/149‑1 (MQ=255) cTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAg < 2:185412/149‑1 (MQ=255) cTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAg < 3:201153/149‑1 (MQ=255) cTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAg < 2:8848/149‑1 (MQ=255) gcgACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGtt < 8:196891/146‑1 (MQ=255) gcgACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGtt > 7:196891/1‑146 (MQ=255) aGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCtt < 5:210988/103‑1 (MQ=255) aGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCtt > 6:210988/1‑103 (MQ=255) t‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGTTGAGCACCGCTGgca < 3:281146/148‑1 (MQ=255) gCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTgg < 2:259722/98‑1 (MQ=255) gCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTgg > 1:259722/1‑98 (MQ=255) gCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGTTGAGCACCGCTGgcagca > 2:128566/1‑149 (MQ=255) ccATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCgg < 7:165637/79‑1 (MQ=255) ccATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCgg > 8:165637/1‑79 (MQ=255) ccATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGTTGAGCACCGCTGGCAGCAt > 7:199619/1‑149 (MQ=255) gCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGTTGAGCACCGCTGGCAGCATTTCGTc > 1:191612/1‑149 (MQ=255) atgtaCTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGTTGAGCACCGCTGGCAGCATTTCGTCCGCCGAGTCGa < 8:199619‑M2/143‑1 (MQ=255) tgtaCTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGTTGAGCACCGCTGGCAGCATTTCGTCCGCCGAGTCGAgg < 1:128566‑M2/145‑1 (MQ=255) cTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGTTGAGCACCGCTGGCAGCATTTCGTCCGCCGAGTCGAGGAAgg > 5:160239/1‑149 (MQ=255) | AACCAGAGGTTGCCGCCTTCCTTGGGAATGGCGTAGGCCAGGTTCACACCCTTCTTCGCTTCTTCAGCGCGGGCCTTGGCCTGGAATACATCACCCGAGAAACCTGCCGCGACGCAGATGT‑CGCCATTGGCCAGGTCGGTGATGTACTTGGACGAGTGGAAGTAGGTCACGTACGGGCGCACGGCCAGCAGCTTCTGCTCGGCCTTGGCGTAATCCTTGGGGTCGGTGCTGTTCGGGTTGAGGCCCATGTAGTTGAGCACCGCTGGCAGCATTTCGTCCGCCGAGTCGAGGAAGG > NC_002947/5907155‑5907449 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |