| New junction evidence | |||||||||||
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CCGTGCGACTAGAGAAAGGAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAA > NC_002947/106091‑106383 | ccGTGCGACTAGAGAAAGGAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCa > 1:167002/1‑148 (MQ=255) tGCGACTAGAGAAAGGAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAg < 3:31270/149‑1 (MQ=255) aCTAGAGAAAGGAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCt > 5:301182/1‑149 (MQ=255) cTAGAGAAAGGAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTg < 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aGGAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTgg < 7:134772/149‑1 (MQ=255) agaAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGa < 5:268727/139‑1 (MQ=255) agaAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGa > 6:268727/1‑139 (MQ=255) aaCACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTAt < 6:301182/149‑1 (MQ=255) acacGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATc < 5:226955‑M2/149‑2 (MQ=255) ggTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATcggcg < 5:50707‑M2/149‑6 (MQ=255) gTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATcggcgg > 3:119866‑M2/1‑143 (MQ=255) tGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATcggcggc > 1:133345‑M2/1‑142 (MQ=255) aaCATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTTGTCTTCCTTGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGataatcccagtaatcaggccttttgccggcggcat < 2:232391‑M1/149‑36 (MQ=255) aCATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGCCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGataatcccagtaatcaggccttttgccggcggcatg < 5:319658‑M1/149‑37 (MQ=255) 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gTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCt > 6:289275/1‑90 (MQ=255) gTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCt < 5:289275/90‑1 (MQ=255) gTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCt < 5:284285/90‑1 (MQ=255) ttGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGt < 7:1854/149‑1 (MQ=255) cTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGtcgtcg < 3:82580/118‑1 (MQ=255) cTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGtcgtcg > 4:82580/1‑118 (MQ=255) cTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATcgcc > 1:369005/1‑137 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |