| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1176374 | 40 (0.680) | 3 (0.050) | 3/246 | NT | 6.4% | coding (805/1470 nt) | guaB | IMP dehydrogenase and single strand DNA binding factor |
| ? | NC_002947 | = 1176433 | 49 (0.870) | coding (864/1470 nt) | guaB | IMP dehydrogenase and single strand DNA binding factor | |||||
GCGCCGCCGTCGGCACCGGCAAGGACACCGGCGAGCGCGTTGCTGCCCTGGTGGCGGCTGGCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCA > NC_002947/1176228‑1176521 | gcgcCGCCGTCGGCACCGGCAAGGACACCGGCGAGCGCGTTGCTGCCCTGGTGGCGGCTGGCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCCCTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAACCCTACCCGC > 8:201740‑M1/1‑147 (MQ=255)gcgcCGCCGTCGGCACCGGCAAGGACACCGGCGAGCGCGTTGCTGCCCTGGTGGCGGCTGGCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCaa < 3:223957/149‑1 (MQ=255) ccgTCGGCACCGGCAAGGACACCGGCGAGCGCGTTGCTGCCCTGGTGGCGGCTGGCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAg < 3:181575/149‑1 (MQ=255) ccgTCGGCACCGGCAAGGACACCGGCGAGCGCGTTGCTGCCCTGGTGGCGGCTGGCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAg < 7:314429/149‑1 (MQ=255) gCACCGGCAAGGACACCGGCGAGCGCGTTGCTGCCCTGGTGGCGGCTGGCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATc < 7:67400/149‑1 (MQ=255) aGGACACCGGCGAGCGCGTTGCTGCCCTGGTGGCGGCTGGCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCaa > 4:186773/1‑148 (MQ=255) ggACACCGGCGAGCGCGTTGCTGCCCTGGTGGCGGCTGGCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACa > 6:267715/1‑149 (MQ=255) acCGGCGAGCGCGTTGCTGCCCTGGTGGCGGCTGGCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGc < 5:267715/149‑1 (MQ=255) acCGGCGAGCGCGTTGCTGCCCTGGTGGCGGCTGGCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGCAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGc > 2:326799/1‑149 (MQ=255) cccTGGTGGCGGCTGGCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGgc < 2:278745/137‑1 (MQ=255) cccTGGTGGCGGCTGGCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGgc > 1:278745/1‑137 (MQ=255) ggtggCGGCTGGCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCCGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGccc > 4:265936/1‑149 (MQ=255) gtggCGGCTGGCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCt < 2:14053/149‑1 (MQ=255) ggcTGGCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGcc > 3:306697/1‑148 (MQ=255) tGGCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACTGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACGCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCt < 6:310703/141‑1 (MQ=255) tGGCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCt > 5:310703/1‑141 (MQ=255) ggCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGCAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAgc > 1:326799‑M2/1‑147 (MQ=255) gCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAg > 3:186773‑M2/1‑146 (MQ=255) cGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAgcgg > 3:299912‑M2/1‑145 (MQ=255) ttGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAgcgggt > 1:255145‑M2/1‑143 (MQ=255) aTGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTTCCCGCttcggccagggccttggcggcagcgccggtggcgatgttgccgccgatcacctgcacttgcgggtag < 7:84752‑M1/148‑68 (MQ=255) tcgtcgtcgACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGAcgcg < 3:265936/149‑1 (MQ=255) cacTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGAc < 1:284407/136‑1 (MQ=255) cacTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGAc > 2:284407/1‑136 (MQ=255) cacTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCg < 4:152252/149‑1 (MQ=255) acTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAg > 2:368307/1‑72 (MQ=255) acTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAg < 1:368307/72‑1 (MQ=255) tGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTa > 4:342903/1‑149 (MQ=255) aCGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGc > 2:82997/1‑149 (MQ=255) aCGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGc > 5:13124/1‑149 (MQ=255) ggCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGccc > 3:73158/1‑149 (MQ=255) tCCAAAGGTGAGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGGGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGctc > 5:262745/1‑149 (MQ=255) cAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCTGGGGTGAAGGAAACCTACCCGCttcggccagggccttggcggcagcgccggtggcgatgttgccgccgatcacctgcacttgcgggtaggtttccttcaccca > 1:215532‑M1/1‑48 (MQ=255) cAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCttcggccagggccttggcggcagcgccggtggcgatgttgccgccgatcacctgcacttgcgggtaggtttccttcaccca < 2:215532‑M1/128‑82 (MQ=255) cAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGctc < 1:82997/147‑1 (MQ=255) cAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTa > 2:203115/1‑149 (MQ=255) gtgtGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTg > 5:303892/1‑148 (MQ=255) aTCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGcaccac > 8:265519/1‑149 (MQ=255) aCCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGAcgc < 3:54128/106‑1 (MQ=255) aCCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGAcgc > 4:54128/1‑106 (MQ=255) ccGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTa > 1:89187/1‑149 (MQ=255) gcgTACGCT‑TGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTTATcggcg < 6:10873/48‑1 (MQ=255) gcgTACGCT‑GGGTGAAGGAAACATACCCGCAAGTGCAGGTGATcggcg > 5:10873/1‑48 (MQ=255) cGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGc < 4:306697/149‑1 (MQ=255) t‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAgcgggtaggtttccttcaccccagcgtacgcggtcgatcacacctttg > 1:215532‑M2/1‑81 (MQ=255) t‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAgcgggtaggtttccttcacccagcgtacgcggtcgatcacacctttg < 2:215532‑M2/128‑48 (MQ=255) tGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTc > 4:357940/1‑149 (MQ=255) ggAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAgcgggt > 4:363465‑M2/1‑73 (MQ=255) ggAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAgcgggt > 4:357747‑M2/1‑73 (MQ=255) ggAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAgcgggt < 3:363465‑M2/79‑7 (MQ=255) ggAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAgcgggt < 3:357747‑M2/79‑7 (MQ=255) ggAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCg > 7:120326/1‑149 (MQ=255) aaaCCTACCCGCAAGTGCAGGTGAGCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGGCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTg < 7:201740/149‑1 (MQ=255) cTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAgcgggaaggtttccttcacccagcgtacgcggtcgatcacacctttggagtggccgtgggcagtgtcgacgacgacgacat < 7:84752‑M2/148‑82 (MQ=255) tACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCt < 1:325136/102‑1 (MQ=255) tACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCt > 2:325136/1‑102 (MQ=255) aCCCGCttcggccagggccttggcggcagcgccggtggcgatgttgccgccgatcacctgcacttgcgggtaggtttccttcacccagcgtacgcggtcgatcacacctttggagtggccgtgggcagtgtcgacgacgacgacatcaa > 1:255145‑M1/1‑6 (MQ=255) aCCCGCttcggccagggccttggcggcagcgccggtggcgatgttgccgccgatcacctgcacttgcgggtaggtttcc > 4:363465‑M1/1‑6 (MQ=255) aCCCGCttcggccagggccttggcggcagcgccggtggcgatgttgccgccgatcacctgcacttgcgggtaggtttcc < 3:357747‑M1/79‑74 (MQ=255) aCCCGCttcggccagggccttggcggcagcgccggtggcgatgttgccgccgatcacctgcacttgcgggtaggtttcc < 3:363465‑M1/79‑74 (MQ=255) aCCCGCttcggccagggccttggcggcagcgccggtggcgatgttgccgccgatcacctgcacttgcgggtaggtttcc > 4:357747‑M1/1‑6 (MQ=255) ccGCttcggccagggccttggcggcagcgccggtggcgatgttgccgccgatcacctgcacttgcgggtaggtttccttcacccagcgtacgcggtcgatcacacctttggagtggccgtgggcagtgtcgacgacgacgacatcaacg > 3:299912‑M1/1‑4 (MQ=255) ccGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTgg > 3:103793/1‑58 (MQ=255) ccGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTgg < 4:103793/58‑1 (MQ=255) gCttcggccagggccttggcggcagcgccggtggcgatgttgccgccgatcacctgcacttgcgggtaggtttgcttcacccagcgtacgcggtcgatcacacctttggagtggccgtgggcagtgtcgacgacgacgacatcaacgcc > 1:326799‑M1/1‑2 (MQ=255) cttcggccagggccttggcggcagcgccggtggcgatgttgccgccgatcacctgcacttgcgggtaggtttccttcacccagcgtacgcggtcgatcacacctttggagtggccgtgggcagtgtcgacgacgacgacatcaacgc > 3:186773‑M1/1‑1 (MQ=255) | GCGCCGCCGTCGGCACCGGCAAGGACACCGGCGAGCGCGTTGCTGCCCTGGTGGCGGCTGGCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCT‑GGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCA > NC_002947/1176228‑1176521 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |