New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1176374 | 40 (0.680) | 3 (0.050) | 3/246 | NT | 6.4% | coding (805/1470 nt) | guaB | IMP dehydrogenase and single strand DNA binding factor |
? | NC_002947 | = 1176433 | 49 (0.870) | coding (864/1470 nt) | guaB | IMP dehydrogenase and single strand DNA binding factor |
GGCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCTGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCGCCAACGTCGCAGCAGCACTGGAAGGCACTGGTGTGCCACTGATCGCT > NC_002947/1176287‑1176577 | ggCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCTGGGTGAAGCAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAgc > 1:326799‑M2/1‑147 (MQ=255) gCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCTGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAg > 3:186773‑M2/1‑146 (MQ=255) cGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCTGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAgcgg > 3:299912‑M2/1‑145 (MQ=255) ttGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCTGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAgcgggt > 1:255145‑M2/1‑143 (MQ=255) tcgtcgtcgACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCTGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGAcgcg < 3:265936/149‑1 (MQ=255) cacTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCTGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGAc > 2:284407/1‑136 (MQ=255) cacTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCTGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGAc < 1:284407/136‑1 (MQ=255) cacTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCTGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCg < 4:152252/149‑1 (MQ=255) tGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCTGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTa > 4:342903/1‑149 (MQ=255) aCGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCTGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGc > 2:82997/1‑149 (MQ=255) aCGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCTGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGc > 5:13124/1‑149 (MQ=255) ggCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCTGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGccc > 3:73158/1‑149 (MQ=255) tCCAAAGGTGAGATCGACCGCGTACGCTGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGGGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGctc > 5:262745/1‑149 (MQ=255) cAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCTGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGctc < 1:82997/147‑1 (MQ=255) cAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCTGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTa > 2:203115/1‑149 (MQ=255) gtgtGATCGACCGCGTACGCTGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTg > 5:303892/1‑148 (MQ=255) aTCGACCGCGTACGCTGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGcaccac > 8:265519/1‑149 (MQ=255) aCCGCGTACGCTGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGAcgc < 3:54128/106‑1 (MQ=255) aCCGCGTACGCTGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGAcgc > 4:54128/1‑106 (MQ=255) ccGCGTACGCTGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTa > 1:89187/1‑149 (MQ=255) cGCTGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGc < 4:306697/149‑1 (MQ=255) tGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAgcgggtaggtttccttcaccccagcgtacgcggtcgatcacacctttg > 1:215532‑M2/1‑81 (MQ=255) tGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAgcgggtaggtttccttcacccagcgtacgcggtcgatcacacctttg < 2:215532‑M2/128‑48 (MQ=255) tGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTc > 4:357940/1‑149 (MQ=255) ggAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAgcgggt < 3:357747‑M2/79‑7 (MQ=255) ggAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAgcgggt > 4:357747‑M2/1‑73 (MQ=255) ggAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAgcgggt < 3:363465‑M2/79‑7 (MQ=255) ggAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAgcgggt > 4:363465‑M2/1‑73 (MQ=255) ggAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCg > 7:120326/1‑149 (MQ=255) aaaCCTACCCGCAAGTGCAGGTGAGCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGGCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTg < 7:201740/149‑1 (MQ=255) cTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAgcgggaaggtttccttcacccagcgtacgcggtcgatcacacctttggagtggccgtgggcagtgtcgacgacgacgacat < 7:84752‑M2/148‑82 (MQ=255) tACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCt > 2:325136/1‑102 (MQ=255) tACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCt < 1:325136/102‑1 (MQ=255) tGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCTACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAgcgc > 6:111219/1‑148 (MQ=255) tGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGgtgt > 4:307891/1‑127 (MQ=255) gCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGGCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCa > 1:360666/1‑149 (MQ=255) cAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATc > 3:150986/1‑141 (MQ=255) cAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATc < 4:150986/141‑1 (MQ=255) aGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATc > 1:297501/1‑149 (MQ=255) ggTGATCGGCGGCAACATCGCCACAGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCg > 4:1671/1‑149 (MQ=255) aTCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCGCCaa < 1:203115/149‑1 (MQ=255) aTCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCGCCa < 6:262745/148‑1 (MQ=255) ggcggcAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCGCCAACGt > 5:55801/1‑149 (MQ=255) ggcggcAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGACTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCGCCAACGt > 3:151136/1‑149 (MQ=255) cggcAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCGCCAACGTCg < 8:120326/149‑1 (MQ=255) cggcAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCGCCAACGTCg < 4:73158/149‑1 (MQ=255) ggcAACATCGCTACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCGCCAACGTCgc < 5:111219/149‑1 (MQ=255) gcAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCGCCAACGTCg > 1:93034/1‑147 (MQ=255) ccGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCGCCAACGTCGCAGCAGCACTGGaa < 6:13124/149‑1 (MQ=255) gcgcTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCGCCAACGTCGCAGCAGCACTGGAAgg > 7:132599/1‑148 (MQ=255) ccgccAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCGCCAACGTCGCAGCAGCACTGGAAGGCACTg < 6:303892/147‑1 (MQ=255) ccgccAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCGCCAACGTCGCAGCAGCACTGGAAGGCACTGgt > 3:145981/1‑149 (MQ=255) gccAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCGCCAACGTCGCAGCAGCACTGGAAGGCACTGgtgt < 3:357940/149‑1 (MQ=255) ccAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCGCCAACGTCGCAGCAGCACTGGAAGGCACTGGtgtg > 4:324223/1‑149 (MQ=255) aGGCCCTGGTCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCGCCAACGTCGCAGCAGCACTGGAAGGCACTGGTGTGCCa < 2:360666/149‑1 (MQ=255) ggCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCGCCAACGTCGCAGCAGCACTGGAAGGCACTGGTGTGCCAc < 2:93034/149‑1 (MQ=255) ggCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCGCCAACGTCGCAGCAGCACTGGAAGGCACTGGTGTGCCAc > 3:257770/1‑149 (MQ=255) cccTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCGCCAACGTCGCAGCAGCACTGGAAGGCACTGGTGTGCCACt > 1:170640/1‑148 (MQ=255) ccTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCGCCAACGTCGCAGCAGCACTGGAAGGCACTGGTGTGCCACTg < 7:247959/148‑1 (MQ=255) ccTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCGCCAACGTCGCAGCAGCACTGGAAGGCACTGGTGTGCCACTg > 8:247959/1‑148 (MQ=255) ccGAAGCGGGTGCAGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCGCCAACGTCGCAGCAGCACTGGAAGGAACTGGTGTGCCACTGATAGCt > 7:207193/1‑149 (MQ=255) | GGCGTTGATGTCGTCGTCGTCGACACTGCCCACGGCCACTCCAAAGGTGTGATCGACCGCGTACGCTGGGTGAAGGAAACCTACCCGCAAGTGCAGGTGATCGGCGGCAACATCGCCACCGGCGCTGCCGCCAAGGCCCTGGCCGAAGCGGGTGCCGACGCGGTCAAGGTCGGTATCGGCCCTGGCTCTATCTGCACCACCCGTATCGTTGCCGGTGTCGGCGTGCCGCAAATCAGCGCCATCGCCAACGTCGCAGCAGCACTGGAAGGCACTGGTGTGCCACTGATCGCT > NC_002947/1176287‑1176577 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |