New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1508562 = | 52 (0.880) | 4 (0.070) | 4/252 | NT | 7.1% | coding (140/579 nt) | PP_1322 | lipoprotein |
? | NC_002947 | 1508615 = | 54 (0.940) | coding (87/579 nt) | PP_1322 | lipoprotein |
CTCCGCGAGGCTCTTGAGGTCGGCGCGTGGGGTCTGCCCGGCCAGCAGGACGATACCGTTGTAGCTGCTGACAACGATGTGCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGGCACAGGGTCAGGGCCATCAGGCCGAGGCGCATAGGGGTCATTCT > NC_002947/1508414‑1508704 | cTCCGCGAGGCTCTTGAGGTCGGCGCGTGGGGTCTGCCCGGCCAGCAGGACGATACCGTTGTAGCTGCTGACAACGATGTGCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAgt > 1:22850/1‑149 (MQ=255) gcgAGGCTCTTGAGGTCGGCGCGTGGGGTCTGCCCGGCCAGCAGGACGATACCGTTGTAGCTGCTGACAACGATGTGCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAgtcgtc < 8:108885/149‑1 (MQ=255) gcgAGGCTCTTGAGGTCGGCGCGTGGGGTCTGCCCGGCCAGCAGGACGATACCGTTGTAGCTGCTGACAACGATGTGCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAgtcgtc < 1:289037/149‑1 (MQ=255) gCTCTTGAGGTCGGCGCGTGGGGTCTGCCCGGCCAGCAGGACGATACCGTTGTAGCTGCTGACAACGATGTGCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAgtcgt > 4:151456/1‑143 (MQ=255) gCTCTTGAGGTCGGCGCGTGGGGTCTGCCCGGCCAGCAGGACGATACCGTTGTAGCTGCTGACAACGATGTGCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAgtcgt < 3:151456/143‑1 (MQ=255) ctctTGAGGTCGGCGCGTGGGGTCTGCCCGGCCAGCAGGACGATACCGTTGTAGCTGCTGACAACGATGTGCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCtt < 6:156257/149‑1 (MQ=255) ttGAGGTCGGCGCGTGGGGTCTGCCCGGCCAGCAGGACGATACCGTTGTAGCTGCTGACAACGATGTGCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTtgct > 3:246101/1‑149 (MQ=255) aGGTCGGCGCGTGGGGTCTGCCCGGCCAGCAGGACGATACCGTTGTAGCTGCTGACAACGATGTGCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTtgctgc < 1:103277/148‑1 (MQ=255) tgcgatctgatcgacagccaactgttcgggagtgaagaatgacccctatgcgcctcggcctgatggccctgaccctgtgcctgagcgtcaccggttgcagctcggtactcacctctacccgcaatTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTg < 3:143054‑M1/24‑1 (MQ=255) gTGGGGTCTGCCCGGCCAGCAGGACGATACCGTTGTAGCTGCTGACAACGATGTGCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTgcgc > 6:163406/1‑149 (MQ=255) ggggTCTGCCCGGCCAGCAGGACGATACCGTTGTAGCTGCTGACAACGATGTGCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATGTTGCTGCCGATGGTGCGCGt > 8:294886/1‑149 (MQ=255) tCTGCCCGGCCAGCAGGACGATACCGTTGTAGCTGCTGACAACGATGTGCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCcg > 2:243081/1‑149 (MQ=255) cTGCCCGGCCAGCAGGACGATACCGTTGTAGCTGCTGACAACGATGTGCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCcgc > 4:68599/1‑149 (MQ=255) gCCCGGCCAGCAGGACGATACCGTTGTAGCTGCTGACAACGATGTGCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGAGCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGa > 3:210080/1‑149 (MQ=255) cGATACCGTTGTAGCTGCTGACAACGATGTGCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGc < 6:266918/149‑1 (MQ=255) gATACCGTTGTAGCTGCTGACAACGATGTGCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCATTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGc > 1:117866/1‑148 (MQ=255) gagtgaagaatgacccctatgcgcctcggcctgatggccctgaccctgtgcctgagcgtcaccggttgcagctcggtactcacctctacccgcaatTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCg < 5:73784‑M1/52‑1 (MQ=255) ttGTAGCTGCTGACAACGATGTGCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCg < 2:22850/149‑1 (MQ=255) agaatgacccctatgcgcctcggcctgatggccctgaccctgtgcctgagcgtcaccggttgcagctcggtactcacctctacccgcaatTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCg > 4:143054‑M1/91‑149 (MQ=255) gaatgacccctatgcgcctcggcctgatggccctgaccctgtgcctgagcgtcaccggttgcagctcggtactcacctctacccgcaatTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCgg > 6:73784‑M1/90‑149 (MQ=255) ctgACAACGATGTGCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGTCCTTTGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGt < 8:264991/149‑1 (MQ=255) ctgACAACGATGTGCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGc > 6:25275/1‑132 (MQ=255) ctgACAACGATGTGCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGc < 5:25275/132‑1 (MQ=255) ctgACAACGATGTGCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGt < 4:65965/149‑1 (MQ=255) cGATGTGCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGAGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCAATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTAcc > 7:276319/1‑149 (MQ=255) gtgCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTaga > 8:242250/1‑135 (MQ=255) gtgCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCATTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTaga < 7:242250/135‑1 (MQ=255) tgCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGc > 7:259421/1‑120 (MQ=255) tgCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGc < 8:259421/120‑1 (MQ=255) gCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAAc < 7:294886/149‑1 (MQ=255) ccTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCg > 7:9609/1‑149 (MQ=255) ccTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCg > 7:85685/1‑149 (MQ=255) gTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGa > 4:288912/1‑149 (MQ=255) cAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAgtcgt < 8:174394/59‑1 (MQ=255) cAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAgtcgt > 7:174394/1‑59 (MQ=255) gggTTGGCTTTTTAAATGTTCAGGGCTGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGACGATGTTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCTATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGGc < 8:276319/148‑1 (MQ=255) gggTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGACGCGCAGGca > 8:354130/1‑149 (MQ=255) gTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATc > 8:120637/1‑84 (MQ=255) gTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATc < 7:120637/84‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGa < 7:308772/136‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGa > 8:308772/1‑136 (MQ=255) tttGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGGCACAGGGt > 7:64416/1‑147 (MQ=255) tttGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGGCACAGGGt > 8:126974/1‑147 (MQ=255) tttGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGGCACAGCGt > 4:126409/1‑147 (MQ=255) tttGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGAACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGGcaca > 7:234073/1‑143 (MQ=255) tttGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGAACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGGcaca < 8:234073/143‑1 (MQ=255) tGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGACACAGGGTCAgg > 8:65377/1‑149 (MQ=255) aaaTGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGGCACAGGGTCAGGGcc < 3:68599/149‑1 (MQ=255) aaaTGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGGCACAGGGTCAGGGc > 5:181492/1‑148 (MQ=255) tGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGGCACAGGGTCAGGGCCATc < 5:163406/149‑1 (MQ=255) ttCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGGCACAGGGTCAGGGCCATCAg > 3:169558/1‑149 (MQ=255) aCGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGGCACAGGGTCAGGGCCATCAGGc < 6:181492/148‑1 (MQ=255) gcCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATGTTGCTGCCGATGGGGCGCGTGCCGCGTTCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTTGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACGGGTGACGCTCAGGCACTGGGTCAGGGCCATCAGGCCGAGgcg < 2:117866/149‑1 (MQ=255) cTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGGCACAGGGTCAggg > 2:11559/1‑131 (MQ=255) cTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGGCACAGGGTCAggg < 1:11559/131‑1 (MQ=255) cTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGGCACAGGGTCAGGGCCATCAGGCCGAg > 4:84734/1‑144 (MQ=255) cTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGGCACAGGGTCAGGGCCATCAGGCCGAg < 3:84734/144‑1 (MQ=255) cTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGGCACAGGGTCAGGGCCATCAGGCCGAGGCGCa > 2:55732/1‑149 (MQ=255) gTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGGCACAGGGTCAGGGCCATCAGGCCGAGGCGCATAgg > 1:161057/1‑149 (MQ=255) gATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGGCACAGGGTCAGGGCCATCAGGCCGAGGCGCATAGGGGTCa > 3:289490/1‑149 (MQ=255) tCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGGCACAGGGTCAggg < 6:102593/120‑1 (MQ=255) tCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGGCACAGGGTCAggg > 5:102593/1‑120 (MQ=255) aGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGGCACAGGGTCAGGGCCATCAGGCCGAGGCGCATAGGGGTCAttct > 4:94842/1‑149 (MQ=255) | CTCCGCGAGGCTCTTGAGGTCGGCGCGTGGGGTCTGCCCGGCCAGCAGGACGATACCGTTGTAGCTGCTGACAACGATGTGCGAGCCCTTGTCCAGGTTTGGGTTGGCTTTGGAAATGTTCACGGCGGCCTTGGTCTCGATCAGCGAGTCGTCGATCTTGCTGCCGATGGTGCGCGTGCCGCGATCGTCCTCGATCGGCGAATTGCGGGTAGAGGTGAGTACCGAGCTGCAACCGGTGACGCTCAGGCACAGGGTCAGGGCCATCAGGCCGAGGCGCATAGGGGTCATTCT > NC_002947/1508414‑1508704 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |