New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1694311 | 68 (1.160) | 4 (0.070) | 3/248 | NT | 5.7% | coding (277/1275 nt) | wspC | biofilm formation methyltransferase WspC |
? | NC_002947 | = 1694333 | 66 (1.170) | coding (299/1275 nt) | wspC | biofilm formation methyltransferase WspC |
ACTGGCTGCGCCTGCAGCAATCGGCAGATGAGCAACAGGCGCTGATCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCTTGTTTGACGCCGGCATGGCGCCTGGGGCATTCCTTGTCGATGGAATGGACATCAGCCCAAGTTCGGTAGCC > NC_002947/1694168‑1694454 | aCTGGCTGCGCCTGCAGCAATCGGCAGATGAGCAACAGGCGCTGATCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGgcgcg > 6:167441/1‑149 (MQ=255) gCTGCGCCTGCAGCAATCGGCAGATGAGCAACAGGCGCTGATCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGcc > 6:202540/1‑149 (MQ=255) gcCTGCAGCAATCGGCAGATGAGCAACAGGCGCTGATCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTg > 4:277020/1‑149 (MQ=255) cTGCAGCAATCGGCAGATGAGCAACAGGCGCTGATCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGc > 3:155139/1‑148 (MQ=255) tGCAGCAATCGGCAGATGAGCAACAGGCGCTGATCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGa > 2:313732/1‑149 (MQ=255) cagcaATCGGCAGATGAGCAACAGGCGCTGATCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGAtt > 8:339955/1‑149 (MQ=255) agcaATCGGCAGATGAGCAACAGGCGCTGATCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTg < 5:167441/149‑1 (MQ=255) aaTCGGCAGATGAGCAACAGGCGCTGATCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCt > 4:191340/1‑148 (MQ=255) ggCAGATGAGCAACAGGCGCTGATCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTcagcc < 2:103939‑M2/149‑6 (MQ=255) ggCAGATGAGCAACAGGCGCTGATCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTcagcc < 2:216022‑M2/149‑6 (MQ=255) cAGATGAGCAACAGGCGCTGATCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTg < 7:339955/149‑1 (MQ=255) aGATGAGCAACAGGCGCTGATCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGACTCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGagcaatcgcagcgggcgcgcgccagccagt < 5:354875‑M1/149‑31 (MQ=255) aGATGAGCAACAGGCGCTGATCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGagcaatcgcagcgggcgcgcgccagccagt < 1:139446‑M1/149‑31 (MQ=255) aGATGAGCAACAGGCGCTGATCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGc > 2:8473/1‑149 (MQ=255) aTGAGCAACAGGCGCTGATCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACtggctggc < 2:72237/119‑1 (MQ=255) aTGAGCAACAGGCGCTGATCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACtggctggc > 1:72237/1‑119 (MQ=255) aGCAACAGGCGCTGATCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑c < 1:313732/149‑1 (MQ=255) gCAACAGGCGCTGATCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑ct > 6:279782/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCTGATCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTAc > 3:364998/1‑149 (MQ=255) cgcTGATCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGc < 2:94030/149‑1 (MQ=255) cTGATCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCga < 8:10973/149‑1 (MQ=255) tCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCgaggag < 1:103939/149‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGGTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGcc < 3:277020/149‑1 (MQ=255) aaGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATGCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGagcagtcgcagcgggcgcgcgccagccagtt > 1:262624‑M1/1‑96 (MQ=255) aaGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGagcagtcgcagcgggcgcgcgccagccagtt < 2:262624‑M1/127‑32 (MQ=255) aaGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGccc < 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gAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGc > 1:213159/1‑149 (MQ=255) aaaCCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGcc < 6:251421/149‑1 (MQ=255) aCCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCtt > 7:22959/1‑149 (MQ=255) aCCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCtt < 2:213159/149‑1 (MQ=255) gTTTTTCCGGTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCTTGttt < 8:286092/148‑1 (MQ=255) 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ttCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTcagcc < 5:97991‑M2/76‑6 (MQ=255) ttCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCTTGTTTGACGCCGGCATGGCGCCTgggg > 6:225688/1‑148 (MQ=255) ttCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCTTGTTTGACGCCGGCATGGCGCCTgggg > 6:33575/1‑148 (MQ=255) ttCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCTTGTTTGACGCCGGCATGGCGCCTgggg > 2:219415/1‑148 (MQ=255) ttCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCTTGTTTGACGCCGGCATGGCGCCTgggg > 2:248694/1‑148 (MQ=255) ttCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCTTGTTTGACGCCGGCATGGCGCCAgggg > 4:93028/1‑148 (MQ=255) cACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCTTGTTTGACGCCGGCATGGCGCCTgggg < 5:225688/146‑1 (MQ=255) cTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCt < 1:136316/106‑1 (MQ=255) cTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCt > 2:136316/1‑106 (MQ=255) cTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCTTGTTTGACGCCGGCATGGCGCCTGGGGCATTc < 5:145142/149‑1 (MQ=255) cgcTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCTTGTTTGACGCCGGCATGGCGCCTGGGGCATTcc < 5:279782/147‑1 (MQ=255) cgcTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCTTGTTTGACGCCGGCATGGCGCCTGGGGCATTcc < 1:248694/147‑1 (MQ=255) 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ccTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCTTGTTTGACGCCGGCATGGCGCCTGGGGCATTCCTTGTCGatggaa < 2:202523/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCTTGTTTGACGCCGGCATGGCGCCTGGGGCATTCCGTGTCGatggaa > 5:137844/1‑149 (MQ=255) cGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCTTGTTTGACGCCGGCATGGCGCCTGGGGCATTCCTTGTCGATGGAATGGACATCAGccc < 5:205549/149‑1 (MQ=255) cGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCTTGTTTGACGCCGGCATGGCGCCTGGGGCATTCCTTGTCGATGGAATGGACATCAGccc < 6:137844/149‑1 (MQ=255) tCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTGACTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGATGGCCATGGCCTTGTTTGACGCCGGCATGGCGCCTGGGGCATTCGTTGTCGATGGAATGGACATCAGCCCAAGTTCg > 1:262483/1‑149 (MQ=255) aaCTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCTTGTTTGACGCCGGCATGGCGCCTGGGGCATTCCTTGTCGATGGAATGGACATCAGCCCAAGTTCgg > 7:202276/1‑147 (MQ=255) aaCTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCTTGTTTGACGCCGGCATGGCGCCTGGGGCATTCCTTGTCGATGGAATGGACATCAGCCCAAGTTCGGTa < 3:93028/149‑1 (MQ=255) aaCTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGACTGCTcagccagttgagccagccgtttatgggccaggctggccagcgcagtgaaggattcggggtaacggaaaaaccaggtttccgggacgatcaccgctt < 2:262624‑M2/127‑97 (MQ=255) aaCTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGACTGCTcagccagttgagccagccgtttatgggccaggctggccagcgcagtgaagcattcggggtaacggaaaaaccaggtttccgggacgatcaccgctt > 1:262624‑M2/1‑31 (MQ=255) aCTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTcagccagttgagccagccgtttatgggccaggctggccagcgcagtgaaggattcggggtaacggaaaaaccaggtttccgggacgatcaccgcttcgatcagcgcctgttgctcatct < 1:139446‑M2/149‑120 (MQ=255) aCTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTcagccagttgagccagccgtttatgggccaggctggccagcgcagtgaaggagtcggggtaacggaaaaaccaggtttccgggacgatcaccgcttcgatcagcgcctgttgctcatct < 5:354875‑M2/149‑120 (MQ=255) ctggctggCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCTTGTTTGACGCCGGCATGGCGCCTGGGGCATTCCTTGTCGatggaatg < 5:151864/126‑1 (MQ=255) ctggctggCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCTTGTTTGACGCCGGCATGGCGCCTGGGGCATTCCTTGTCGatggaatg > 6:151864/1‑126 (MQ=255) ggCTGagcaatcgcagcgggcgcgcgccagccagttgagccagccgtttatgggccaggctggccagcgcagtgaaggattcggggtaacggaaaaaccaggtttccgggacgatcaccgcttcgatcagcgcctgttgctcatctgcc < 2:216022‑M1/149‑145 (MQ=255) ggCTGagcaatcgcagcgggcgcgcgccagccagttgagccagccgtttatgggccaggctggccagcgcagtgaaggattcggggtaacggaaaaaccaggtttccgggacgatcaccgcttcgatcagcgcctgttgctcatctgcc < 2:103939‑M1/149‑145 (MQ=255) ggCTGagcaatcgcagcgggcgcgcgccagccagttgagccagccgtttatgggccaggctggccagcgcagtgaa > 6:97991‑M1/1‑5 (MQ=255) ggCTGagcaatcgcagcgggcgcgcgccagccagttgagccagccgtttatgggccaggctggccagcgcagtgaa < 5:97991‑M1/76‑72 (MQ=255) gctggcGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCTTGTTTGACGCCGGCATGGCGCCTGGGGCATTcc < 6:180560/109‑1 (MQ=255) gctggcGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCTTGTTTGACGCCGGCATGGCGCCTGGGGCATTcc > 5:180560/1‑109 (MQ=255) | ACTGGCTGCGCCTGCAGCAATCGGCAGATGAGCAACAGGCGCTGATCGAAGCGGTGATCGTCCCGGAAACCTGGTTTTTCCGTTACCCCGAATCCTTCACTGCGCTGGCCAGCCTGGCCCATAAACGGCTGGCTCAACTGGCTGGCGCGCGCCCGCTGCGATTGCTCAGCCTGCCGTG‑CTCTACCGGCGAGGAGCCCTATTCGCTGGCCATGGCCTTGTTTGACGCCGGCATGGCGCCTGGGGCATTCCTTGTCGATGGAATGGACATCAGCCCAAGTTCGGTAGCC > NC_002947/1694168‑1694454 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |