| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 2278188 = | 137 (2.330) | 8 (0.140) | 5/244 | NT | 6.1% | coding (392/1233 nt) | PP_2007 | P‑47‑like protein |
| ? | NC_002947 | 2278231 = | 117 (2.100) | coding (349/1233 nt) | PP_2007 | P‑47‑like protein | |||||
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
TCGCGGTCTGGCCCATTCCGGGGCAGTGGCTTTGCTGAAGTTGATGGTCGCGAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGG > NC_002947/2278040‑2278326 | tcaggttttttcgaggccagtggcaccagccgctcgctggccggcgcggttgccatcatcgaggtcaccctgtcgctgttgccacaaggcaacggccaggtgcagttgaagtcggccttcctgcacaaggccggagccactcaacccct < 7:23489‑M1/1‑1 (MQ=255)tcaggttttttcgaggccagtggcaccagccgctcgctggccggcgcggttgccatcatcgagctcaccctgtcgctgttgccacaaggcaacggccaggtgcagttgaagtcggccttcctgcacaacgccggagccactcaacacct < 2:48573‑M1/1‑1 (MQ=255) cgcgGTCTGGCCCATTCCGGGGCAGTGGCTTTGCTGAAGTTGATGGTCGCGAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGtttt < 5:27063/148‑1 (MQ=255) aggttttttcgaggccagtggcaccagccgctcgctggccggcgcggttgccatcatcgaggtcaccctgtcgctgttgccacaaggcaacggccaggtgcagttgaagtcggccttcctgcacaaggccggagccactcaaccccTg > 5:217303‑M1/147‑148 (MQ=255) cgGTCTGGCCCATTCCGGGGCAGTGGCTTTGCTGAAGTTGATGGTCGCGAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGCCCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTg > 3:76095/1‑147 (MQ=255) gttttttcgaggccagtggcaccagccgctcgctggccggcgcggttgccatcatcgaggtcaccctgtcgctgttgccacaaggcaacggccaggtgcagttgaagtcggccttcctgcacacggccggagccactcaaccccTGCAg < 6:232971‑M1/5‑1 (MQ=255) gttttttcgaggccagtggcaccagccgctcgctggccggcgcggttgccatcatcgaggtcaccctgtcgctgttgccacaaggcaacggccaggtgcagttgaagtcggccttcctgcacaaggccggagccactcaaccccTGCAg < 7:220704‑M1/5‑1 (MQ=255) gttttttcgaggccagtggcaccagccgctcgctggccggcgcggttgccatcatcgaggtcaccctgtcgatgttgccacaaggcaactgccaggtgcagttgaagtcggccttcctgcacaaggccggagccactcaaccccTGcac < 5:45920‑M1/5‑2 (MQ=255) gCCCATTCCGGGGCAGTGGCTTTGCTGAAGTTGATGGTCGCGAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAAt > 5:340769/1‑149 (MQ=255) ccAATCCGGGGCAGTGGCTTTGCTGAAGTTGATGGTCGCGAAGCTATGGGTGAACTGTAGGAGATCCTCGAACAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGTCGAAAGGACCAACCGAACCGTCGCCGACTTGAAgggagatc > 2:350968/1‑143 (MQ=255) cagtggcaccagccgctcgctggccggcgcggttgccatcatcgaggtcaccctgtcgctgttgccacaaggcaacggccaggtgcagttgaagtcggccttcctgcacaaggccggagccactcaaccccTg > 4:370364‑M1/132‑133 (MQ=255) cGGGGCAGTGGCTTTGCTGAAGTTGATGGTCGCGAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCcgcg > 3:325196/1‑147 (MQ=255) gcaccagccgctcgctggccggcgcggttgccatcatcgaggtcaccctgtcgctgttgccacaaggcaacggccaggtgcagttgaagtcggccttcctgcacaaggccggagccactcaaccccTGCAgg > 4:131547‑M1/127‑132 (MQ=255) gcaccagccgctcgctggccggcgcggttgccatcatcgaggtcaccctgtcgctgttgccacaaggcaacggccaggtgcagttgaagtcggccttcctgcacaaggccggagccactcaaccccTGCAgg < 3:131547‑M1/6‑1 (MQ=255) cTTTGCTGAAGTTGATGGTCGCGAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGTAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCt > 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aTGGTCGCGAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCa < 6:144572/148‑1 (MQ=255) gTCGCGAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAgggg < 1:236528/149‑1 (MQ=255) gTCGCGAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAggg < 2:257561/148‑1 (MQ=255) gcgAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGtt > 1:349084/1‑148 (MQ=255) gcgAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGtt < 4:172011/148‑1 (MQ=255) cgAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGa < 2:143221/149‑1 (MQ=255) aaGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGt < 5:120060/149‑1 (MQ=255) catcatcgaggtcaccctgtcgctgttgccacaaggcaacggccaggtgcagttgaagtcggccttcctgcacaaggccggagccactcaaccccTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAgg > 7:249842‑M1/96‑140 (MQ=255) catcatcgaggtcaccctgtcgctgttgccacaaggcaacggccaggtgcagttgaagtcggccttcctgcacaaggccggagccactcaaccccTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAgg < 8:249842‑M1/45‑1 (MQ=255) catcatcgaggtcaccctgtcgctgttgccacaaggcaacggccaggtgcagttgaagtcggccttcctgcacaaggccggagccactcaaccccTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTg < 2:237524‑M1/54‑1 (MQ=255) 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ccTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCGGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGCCAGGGTGAc > 1:297384/1‑149 (MQ=255) cTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGaa > 7:28902/1‑94 (MQ=255) tAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCt > 3:345314/1‑149 (MQ=255) aGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCtt < 2:58261/83‑1 (MQ=255) aGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCtt > 1:58261/1‑83 (MQ=255) aGCGAACCGTCGGGGTCTTACAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTc > 2:20011/1‑149 (MQ=255) gCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAgg > 3:220678/1‑93 (MQ=255) gCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAgg < 4:220678/93‑1 (MQ=255) cGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCga < 1:271310/149‑1 (MQ=255) gAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACGGGGTGACCTCgat < 8:4424/149‑1 (MQ=255) aaCCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCaa < 8:249754/127‑1 (MQ=255) aaCCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCaa > 7:249754/1‑127 (MQ=255) aaCCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCgat > 6:318923/1‑148 (MQ=255) cGTCGGGTTCGTGCTGGTTAATGCCGCGCAGCCATCCTCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGTTTGGCTCCGTCCTTGTGCAGTAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGatgatg < 8:232252/149‑1 (MQ=255) cGTCGGGGTCTTGGATGGTAATGCGGGGCAGCCAGCCGGCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGGTCCGGGGTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACGTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGatgatg < 8:26103/149‑1 (MQ=255) cGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTTTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGattatg < 3:189692/149‑1 (MQ=255) gTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTACTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCAACGGCCTTGTGCACGAAGGCCGACATCAACTGCACCTGGCCGTTTCCATGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTAGATGAAgg > 1:48573/1‑149 (MQ=255) | TCGCGGTCTGGCCCATTCCGGGGCAGTGGCTTTGCTGAAGTTGATGGTCGCGAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGG > NC_002947/2278040‑2278326 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |