| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 2278188 = | 137 (2.330) | 8 (0.140) | 5/244 | NT | 6.1% | coding (392/1233 nt) | PP_2007 | P‑47‑like protein |
| ? | NC_002947 | 2278231 = | 117 (2.100) | coding (349/1233 nt) | PP_2007 | P‑47‑like protein | |||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
ATGGTCGCGAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGCCACTGGCCTCGAAAAAACCTGA > NC_002947/2278083‑2278378 | gcgcggttgccatcatcgaggtcaccctgtcgctgttgccacaaggcaacggccaggtgcagttgaagtcggccttcctgcacaaggccggagccactcaaccccTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAg > 4:156923‑M1/106‑149 (MQ=255)gcgcggttgccatcatcgaggtcaccctgtcgctgttgccacaaggcaacggccaggtgcagttgaagtcggccttcctgcacaaggccggagccactcaaccccTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAg > 4:156422‑M1/106‑149 (MQ=255) gcgAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGtt < 4:172011/148‑1 (MQ=255) gcgAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGtt > 1:349084/1‑148 (MQ=255) cgAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGa < 2:143221/149‑1 (MQ=255) gAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGTAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAg < 3:280483/149‑1 (MQ=255) catcatcgaggtcaccctgtcgctgttgccacaaggcaacggccaggtgcagttgaagtcggccttcctgcacaaggccggagccactcaaccccTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAgg < 8:249842‑M1/45‑1 (MQ=255) catcatcgaggtcaccctgtcgctgttgccacaaggcaacggccaggtgcagttgaagtcggccttcctgcacaaggccggagccactcaaccccTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAgg > 7:249842‑M1/96‑140 (MQ=255) catcatcgaggtcaccctgtcgctgttgccacaaggcaacggccaggtgcagttgaagtcggccttcctgcacaaggccggagccactcaaccccTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTg < 2:237524‑M1/54‑1 (MQ=255) tcgaggtcaccctgtcgctgttgccacaaggcaacggccaggtgcagttgaagtcggccttcctgcacaaggccggagccactcaaccccTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTcc > 1:237524‑M1/91‑149 (MQ=255) gTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGc > 4:197465/1‑149 (MQ=255) gTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGc > 7:14997/1‑149 (MQ=255) tGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGcc < 2:327757/149‑1 (MQ=255) gAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGTGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCt < 6:375110/149‑1 (MQ=255) aaCTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCtt < 6:35579/149‑1 (MQ=255) aaCTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCtt > 1:38748/1‑149 (MQ=255) aCTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCtt < 2:93562/148‑1 (MQ=255) aCTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTtg > 2:271310/1‑149 (MQ=255) 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8:45164/1‑149 (MQ=255) cGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGatgatg < 3:234679/149‑1 (MQ=255) gTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCTCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGTGTTGCTCCGGCGTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCGGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATgg < 2:110488/149‑1 (MQ=255) cactcaacccctgcagggcgacgaaggcggctggctgcgcggcattaccctgcaGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGatgatg < 2:237524‑M2/95‑1 (MQ=255) ccctgcagggcgacgaaggcggctggctgcgcggcattaccctgcaGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCCATGATGGAAACcgc > 1:6297‑M2/47‑149 (MQ=255) ctgcagggcgacgaaggcggctggctgcgcggcattaccctgcaGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCgcgc > 2:53647‑M2/45‑149 (MQ=255) tAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCagc > 4:358739/1‑149 (MQ=255) aTGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCagcga < 4:260009/149‑1 (MQ=255) aTGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCagc > 1:75774/1‑147 (MQ=255) gcgcAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGc > 8:13214/1‑149 (MQ=255) cagccGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGcc < 2:266869/149‑1 (MQ=255) agccGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCg > 6:231426/1‑128 (MQ=255) gtcg‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCagc < 6:79544/124‑1 (MQ=255) gtcg‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCagc > 5:79544/1‑124 (MQ=255) gtcg‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGCCACTGGCCTCg > 1:186398/1‑148 (MQ=255) cg‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGCCACTGGCCTCGaa > 5:180555/1‑148 (MQ=255) cctgcaGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGc > 4:131547‑M2/7‑132 (MQ=255) cctgcaGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGc < 3:131547‑M2/126‑1 (MQ=255) gtgcaGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCAGTTGCCTTGTGGCAACATCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGCCACTGGCCTCGAAAAAAc < 5:45920‑M2/144‑1 (MQ=255) ctgcaGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGCCACTGGCCTCGAAAAAAc < 7:220704‑M2/144‑1 (MQ=255) ctgcaGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCGTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGCCACTGGCCTCGAAAAAAc < 6:232971‑M2/144‑1 (MQ=255) gcaGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGCCACTGGCCTCGAAAAAACCt > 3:325512‑M2/4‑149 (MQ=255) caGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGCCACTg < 3:370364‑M2/131‑1 (MQ=255) caGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGCCACTGGCCTCGAAAAAAcc < 3:358739‑M2/145‑1 (MQ=255) aGGTGTTGAGTGGCTCCGGCGTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGAGCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGCCACTGGCCTCGAAAAAACCTGa < 2:48573‑M2/148‑1 (MQ=255) aGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGCCACTGGCCTCGAAAAAACCTGa < 7:23489‑M2/148‑1 (MQ=255) | ATGGTCGCGAAGGTATGGGTGAACTGTAGGGGATGCTCGACCAGGTAGTTGCAGATGCAGTCCAACACCACGGAGGCGAAAGGACCTAGCGAACCGTCGGGGTCTTGCAGGGTAATGCCGCGCAGCCAGCCGCCTTCGTCG‑CCCTGCAGGGGTTGAGTGGCTCCGGCCTTGTGCAGGAAGGCCGACTTCAACTGCACCTGGCCGTTGCCTTGTGGCAACAGCGACAGGGTGACCTCGATGATGGCAACCGCGCCGGCCAGCGAGCGGCTGGTGCCACTGGCCTCGAAAAAACCTGA > NC_002947/2278083‑2278378 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |