New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 2303118 | 105 (1.780) | 6 (0.110) | 6/238 | NT | 5.9% | intergenic (‑203/+92) | PP_mr30/PP_2027 | C4 ncRNA/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2303178 | 96 (1.770) | intergenic (‑263/+32) | PP_mr30/PP_2027 | C4 ncRNA/hypothetical protein |
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
CCGGAAACGTTATCCGTGAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCA‑GCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGTTCTCGCCCGCCGGCAGCAACACCTG > NC_002947/2302970‑2303266 | ccGGAAACGTTATCCGTGAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCA‑GCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGTGGGCA > 5:116886‑M1/1‑149 (MQ=255) gAAACGTTATCCGTGAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCA‑GCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGc < 7:219369/149‑1 (MQ=255) cGTTATCCGTGAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCA‑GCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGc < 5:324081/149‑1 (MQ=255) gTTATCCGTGAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCA‑GCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCCCGGGCACGCCCGCt < 7:319406/149‑1 (MQ=255) ttATCCGTGAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCA‑GCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTc < 4:41869/149‑1 (MQ=255) ccGTGAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCA‑GCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCca > 8:157842/1‑148 (MQ=255) gtgtTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCA‑GCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTTTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACg > 4:232373/1‑149 (MQ=255) tttCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCA‑TAGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGTTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGACGGTGTTCTCTTGCAtgcccgctcacactgacagcgta > 3:15999‑M1/1‑126 (MQ=255) tCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCAGGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGgcg > 1:15706/1‑148 (MQ=255) tCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCA‑GCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCCCGCCCGCTCCCACAGGTACGgcgc > 2:178320/1‑148 (MQ=255) tCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCA‑GCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGgcgc < 5:353067/148‑1 (MQ=255) cccGACAACAGCGATAGTTCGGCA‑GCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAg > 8:190303/1‑149 (MQ=255) cccGACAACAGCGATAGTTCGGCA‑GCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAg < 2:15706/149‑1 (MQ=255) ccGACAACAGCGATAGTTCGGCA‑GCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAgg > 2:129956/1‑149 (MQ=255) ccGACAACAGCGATAGTTCGGCA‑GCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAgg > 6:199869/1‑149 (MQ=255) acaGCGATAGTTCGGCA‑GCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCg < 7:185502/149‑1 (MQ=255) caGCGATAGTTCGGCA‑GCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACg < 6:134361/134‑1 (MQ=255) caGCGATAGTTCGGCA‑GCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACg > 5:134361/1‑134 (MQ=255) 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2:118601/1‑129 (MQ=255) gcgcCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAgcggc < 1:118601/129‑1 (MQ=255) cGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGTTCTcgcccgcc > 3:49491/1‑149 (MQ=255) ggTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCAtgcccgc > 3:324565‑M2/1‑74 (MQ=255) ggTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCAtgcccgc < 4:324565‑M2/81‑8 (MQ=255) gtgtTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGTTCTCGCCCGCCgg > 2:308971/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGTTCTcgc < 7:95073/139‑1 (MQ=255) gagcgggCAtgcccgctcccactgaccgcgtacgccgagaaccttgcgccgtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaacaccggcgcagctaccaccgtaagatatttctgaacctgcaacccaatgcttcagaatcaacccgcttag > 8:65743‑M1/3‑9 (MQ=255) cgcgGGCAtgcccgctcccactgaccgcgtacgccgagaaccttgcgccgtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaacaccggcgcagctaccaccgtaagatatttctgaacctgcaacccaatgcttcagaatcaacccgcttag < 8:182092‑M1/148‑141 (MQ=255) gcgGGCAtgcccgctcccactgaccgcgtacgccgagaaccttgcgccgtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaacaccggcgcagctaccaccgtaagatatttctgaacctgcaacccaatgcttcagaatcaacccgcttagga < 6:351851‑M1/149‑143 (MQ=255) gcgGGCAtgcccgctcccactgaccgcgtacgccgagaaccttgcgccgtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaacaccggcgcagctaccaccgtaagatatttctgaacctgcaacccaatgcttcagaatcaacccgcttagg > 1:129956‑M1/1‑7 (MQ=255) gcgGGCAtgcccgctcccactgaccgcgtacgccgagaaccttgcgccgtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaacacc < 4:324565‑M1/81‑75 (MQ=255) gcgGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGTTCTCGCCCGCCGGCAGCaa > 6:265294/1‑149 (MQ=255) cgGGCAtgcccgctcccactgaccgcgtacgccgagaaccttgcgccgtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaacaccggcgcagctaccaccgtaagatatttctgaacctgcaacccaatgcttcagaatcaacccgcttaggaa < 7:326900‑M1/149‑144 (MQ=255) gCAtgcccgctcccactgaccgcgtacgccgagaaccttgcgccgtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaacaccggcgcagctaccaccgtaagatatttctgaacctgcaacc < 4:352879‑M1/117‑115 (MQ=255) gCAtgcccgctcccactgaccgcgtacgccgagaaccttgcgccgtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaacaccggcgcagctaccaccgtaagatatttctgaacctgcaacc > 3:352879‑M1/1‑3 (MQ=255) gCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCacttactt < 1:5302/100‑1 (MQ=255) cACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGTTCTCGCCCGCCGGCAGCAACACCt > 3:18624/1‑149 (MQ=255) atgcccgctcccactgaccgcgtacgccgagaaccttgcgccgtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaacaccggcgcagctaccaccgtaagatatttctgaacctgcaacccaatgcttcagaatcaacccgcttaggaattacc > 3:104032‑M1/1‑1 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGc > 7:74672/1‑118 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGc < 8:74672/118‑1 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGTTCTcg > 3:92929/1‑129 (MQ=255) | CCGGAAACGTTATCCGTGAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCA‑GCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGTTCTCGCCCGCCGGCAGCAACACCTG > NC_002947/2302970‑2303266 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |