| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2833634 | 48 (0.820) | 4 (0.070) | 4/250 | NT | 6.9% | coding (210/1125 nt) | PP_2486 | Oye family NADH‑dependent flavin oxidoreductase |
| ? | NC_002947 | = 2833660 | 62 (1.090) | coding (184/1125 nt) | PP_2486 | Oye family NADH‑dependent flavin oxidoreductase | |||||
GCGCTTCACCACCGGGCTGCAGCGATGTGTGCGACACGCGGCCTACATGCCAAAGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTCGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTAC > NC_002947/2833486‑2833780 | gcgcTTCACCACCGGGCTGCAGCGATGTGTGCGACACGCGGCCTACATGCCAAAGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAG > 4:101495‑M1/1‑149 (MQ=255) ttCACCACCGGGCTGCAGCGATGTGTGCGACACGCGGCCTACATGCCAAAGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCg > 2:46298/1‑148 (MQ=255) accaccGGGCTGCAGCGATGTGTGCGACACGCGGCCTACATGCCAAAGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAAc > 2:150020/1‑149 (MQ=255) tGCAGCGATGTGTGCGACACGCGGCCTACATGCCAAAGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGatcgaaccccgggga > 7:242406‑M1/1‑132 (MQ=255) cAGCGATGTGTGCGACACGCGGCCTACATGCCAAAGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCggg < 3:101495/149‑1 (MQ=255) tgtgCGACACGCGGCCTACATGCCAAAGTTGATCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGGCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGAt < 2:308477/148‑1 (MQ=255) cGACACGCGGCCTACATGCCAAAGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATctgg > 1:150020‑M2/1‑144 (MQ=255) acGCGGCCTACATGCCAAAGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGatcgaaccccggggacagggttacgcctggacacc < 8:242406‑M1/149‑36 (MQ=255) gcgGCCTACATGCCAAAGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATctg > 4:30138‑M2/1‑138 (MQ=255) gcgGCCTACATGCCAAAGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATctg < 3:30138‑M2/141‑4 (MQ=255) gcgGCCTACATGCCAAAGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCt > 2:300465/1‑149 (MQ=255) tGCCAAAGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGACTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCAt > 4:209220/1‑149 (MQ=255) cAAAGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGc < 8:32699/101‑1 (MQ=255) cAAAGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATg > 4:228918/1‑147 (MQ=255) aaaGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATct < 6:35855‑M2/126‑3 (MQ=255) aaaGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATct > 5:35855‑M2/1‑124 (MQ=255) aGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCg > 7:181999/1‑120 (MQ=255) aGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCg < 8:181999/120‑1 (MQ=255) cAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGatcgaaccccggggacagggttacgcctg < 6:5473‑M1/118‑30 (MQ=255) cAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGatcgaaccccggggacagggttacgcctg > 5:5473‑M1/1‑89 (MQ=255) aTCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCAcc < 2:163350/129‑1 (MQ=255) aTCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCAcc > 1:163350/1‑129 (MQ=255) aTCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACcgctgcg < 4:151634/149‑1 (MQ=255) ccccccTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GAc > 1:188885/1‑149 (MQ=255) ccccccTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GAc > 5:97494/1‑149 (MQ=255) cccccTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGaa < 3:47139/128‑1 (MQ=255) cccccTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGaa > 4:47139/1‑128 (MQ=255) cccccTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACg > 1:48192/1‑149 (MQ=255) ccccTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATctgg > 5:40049‑M2/1‑103 (MQ=255) ccccTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATctgg < 6:40049‑M2/107‑5 (MQ=255) cccTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACgg > 1:308246/1‑148 (MQ=255) cTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTaa < 1:46298/149‑1 (MQ=255) gggTGAACAGCGTCGGTGTCCTTACGCCAGCGTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGt < 6:97494/147‑1 (MQ=255) aCAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCAt > 3:110502/1‑149 (MQ=255) cGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAgg < 2:308246/149‑1 (MQ=255) gttaCCTTCCGCCAGCCTTGTATCTGTGCTGGGCTATTAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGGCCCCGGGGTTCTAGCT‑GGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTc < 5:241451/146‑1 (MQ=255) cTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGt > 7:100631/1‑143 (MQ=255) cTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGt < 8:100631/143‑1 (MQ=255) cTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTCGCaa > 2:28922/1‑149 (MQ=255) ttACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTCGCAAt > 8:19826/1‑149 (MQ=255) ccAGACTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATCGGTGGCCATGAGGTCGTTCGCAATGTTGc < 3:209220/149‑1 (MQ=255) gTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTCGCAATGTTGCCGGGtt < 3:228918/147‑1 (MQ=255) tATCTGTTCTGGGCTATCAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGGTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAACCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATCGGTGTCCATGAGGTCGTTCGCAATGTTGCCGGGTTgg < 8:118674/148‑1 (MQ=255) tCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAgg < 3:143348/122‑1 (MQ=255) tCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAgg > 4:143348/1‑122 (MQ=255) tCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTCGCAATGTTGCCGGGTTGGGAg > 3:328907/1‑149 (MQ=255) gTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTCGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTg > 1:276465/1‑149 (MQ=255) ttCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTCGCAATGTTGCCGGGTTGGGata > 1:243961/1‑144 (MQ=255) tATGAATGCCCGGTGTCCAGCCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTCGCAATGTTGCCGGGATGGGAGCTGCGCGAAcgc > 2:287519/1‑149 (MQ=255) tGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTCGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAAcgc < 2:48192/147‑1 (MQ=255) tGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTCGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGt < 4:328907/149‑1 (MQ=255) gAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTCGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAAc < 5:315352/144‑1 (MQ=255) gAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTCGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAAc > 6:315352/1‑144 (MQ=255) gAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTCGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGt > 7:338247/1‑148 (MQ=255) gAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTCGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGt > 7:333407/1‑148 (MQ=255) gAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTCACAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTgcgc > 3:103874/1‑140 (MQ=255) gAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTCACAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTgcgc < 4:103874/140‑1 (MQ=255) tGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCAGGAGGTCGTTCGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGt > 2:56390/1‑149 (MQ=255) gggTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCTTCAGACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTCGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTg < 1:300465/149‑1 (MQ=255) gggTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTCGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTggcg < 7:19826/149‑1 (MQ=255) ggTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATctggacacccggcattcatagcccagaacagatacaaggctggcgtaaggtcaccgacgctgttcacgccgaagggggggtgatctttgctcaactttggcatgtaggccgcgt < 8:242406‑M2/149‑115 (MQ=255) ggTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTCGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTggcgg < 8:333407/149‑1 (MQ=255) ggTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGGTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTCGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTggcgg < 8:338247/149‑1 (MQ=255) ccAGatcgaaccccggggacagggttacgcctggacacccggcattcatagcccagaacagatacaaggctggcgtaaggtcaccgacgctgttcacgccgaagggggggtgatctttgctcaactttggcatgtaggccgcgtgtcg > 1:150020‑M1/1‑4 (MQ=255) ccAGatcgaaccccggggacagggttacgcctggacacccggcattcatagcccagaacagatacaaggctggcgtaaggtcaccgacgctgttcacgccgaagggg < 6:40049‑M1/107‑104 (MQ=255) ccAGatcgaaccccggggacagggttacgcctggacacccggcattcatagcccagaacagatacaaggctggcgtaaggtcaccgacgctgttcacgccgaagggg > 5:40049‑M1/1‑4 (MQ=255) cAGatcgaaccccggggacagggttacgcctggacacccggcattcatagcccagaacagatacaaggctggcgtaaggtcaccgacgctgttcacgccgaagggggggtgatctttgctcaactttggcatgtaggccgc > 4:30138‑M1/1‑3 (MQ=255) cAGatcgaaccccggggacagggttacgcctggacacccggcattcatagcccagaacagatacaaggctggcgtaaggtcaccgacgctgttcacgccgaagggggggtgatctttgctcaactttggcatgtaggccgc < 3:30138‑M1/141‑139 (MQ=255) cAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATctggacacccggcattcatagcccagaacagatacaaggctggcgtaaggtcaccgacgctgttcacgccgaagggggggtgatctttg < 6:5473‑M2/118‑90 (MQ=255) cAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATctggacacccggcattcatagcccagaacagatacaaggctggcgtaaggtcaccgacgctgttcacgccgaagggggggtgatctttg > 5:5473‑M2/1‑29 (MQ=255) cAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTCGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTAc > 6:37167/1‑149 (MQ=255) cAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTCGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTAc > 5:363991/1‑149 (MQ=255) aGatcgaaccccggggacagggttacgcctggacacccggcattcatagcccagaacagatacaaggctggcgtaaggtcaccgacgctgttcacgccgaagggggggtgatctttgctcaacttt < 6:35855‑M1/126‑125 (MQ=255) aGatcgaaccccggggacagggttacgcctggacacccggcattcatagcccagaacagatacaaggctggcgtaaggtcaccgacgctgttcacgccgaagggggggtgatctttgctcaacttt > 5:35855‑M1/1‑2 (MQ=255) | GCGCTTCACCACCGGGCTGCAGCGATGTGTGCGACACGCGGCCTACATGCCAAAGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTCGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTAC > NC_002947/2833486‑2833780 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |