New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2833634 | 48 (0.820) | 4 (0.070) | 4/250 | NT | 6.9% | coding (210/1125 nt) | PP_2486 | Oye family NADH‑dependent flavin oxidoreductase |
? | NC_002947 | = 2833660 | 62 (1.090) | coding (184/1125 nt) | PP_2486 | Oye family NADH‑dependent flavin oxidoreductase |
TGTGCGACACGCGGCCTACATGCCAAAGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTACGATACGGTTCTTGAGGGTGTATGGGCC > NC_002947/2833513‑2833807 | tgtgCGACACGCGGCCTACATGCCAAAGTTGATCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGGCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGAt < 2:308477/148‑1 (MQ=255) cGACACGCGGCCTACATGCCAAAGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATctgg > 1:150020‑M2/1‑144 (MQ=255) gcgGCCTACATGCCAAAGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATctg > 4:30138‑M2/1‑138 (MQ=255) gcgGCCTACATGCCAAAGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATctg < 3:30138‑M2/141‑4 (MQ=255) gcgGCCTACATGCCAAAGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCt > 2:300465/1‑149 (MQ=255) tGCCAAAGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGACTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCAt > 4:209220/1‑149 (MQ=255) cAAAGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATg > 4:228918/1‑147 (MQ=255) aaaGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATct < 6:35855‑M2/126‑3 (MQ=255) aaaGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATct > 5:35855‑M2/1‑124 (MQ=255) aTCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCAcc > 1:163350/1‑129 (MQ=255) aTCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCAcc < 2:163350/129‑1 (MQ=255) aTCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACcgctgcg < 4:151634/149‑1 (MQ=255) ccccccTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GAc > 1:188885/1‑149 (MQ=255) ccccccTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GAc > 5:97494/1‑149 (MQ=255) cccccTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGaa > 4:47139/1‑128 (MQ=255) cccccTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGaa < 3:47139/128‑1 (MQ=255) cccccTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACg > 1:48192/1‑149 (MQ=255) ccccTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATctgg < 6:40049‑M2/107‑5 (MQ=255) ccccTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATctgg > 5:40049‑M2/1‑103 (MQ=255) cccTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACgg > 1:308246/1‑148 (MQ=255) cTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTaa < 1:46298/149‑1 (MQ=255) gggTGAACAGCGTCGGTGTCCTTACGCCAGCGTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGt < 6:97494/147‑1 (MQ=255) aCAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCAt > 3:110502/1‑149 (MQ=255) cGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAgg < 2:308246/149‑1 (MQ=255) gttaCCTTCCGCCAGCCTTGTATCTGTGCTGGGCTATTAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGGCCCCGGGGTTCTAGCT‑GGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑c < 5:241451/146‑1 (MQ=255) cTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGt < 8:100631/143‑1 (MQ=255) cTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGt > 7:100631/1‑143 (MQ=255) cTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCaa > 2:28922/1‑149 (MQ=255) ttACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAAt > 8:19826/1‑149 (MQ=255) ccAGACTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATCGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGc < 3:209220/149‑1 (MQ=255) gTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGtt < 3:228918/147‑1 (MQ=255) tATCTGTTCTGGGCTATCAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGGTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAACCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATCGGTGTCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTgg < 8:118674/148‑1 (MQ=255) tCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAgg < 3:143348/122‑1 (MQ=255) tCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAgg > 4:143348/1‑122 (MQ=255) tCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAg > 3:328907/1‑149 (MQ=255) gTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTg > 1:276465/1‑149 (MQ=255) ttCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGata > 1:243961/1‑144 (MQ=255) tATGAATGCCCGGTGTCCAGCCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGATGGGAGCTGCGCGAAcgc > 2:287519/1‑149 (MQ=255) tGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAAcgc < 2:48192/147‑1 (MQ=255) tGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGt < 4:328907/149‑1 (MQ=255) gAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAAc > 6:315352/1‑144 (MQ=255) gAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAAc < 5:315352/144‑1 (MQ=255) gAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGt > 7:338247/1‑148 (MQ=255) gAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGt > 7:333407/1‑148 (MQ=255) gAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CACAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTgcgc > 3:103874/1‑140 (MQ=255) gAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CACAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTgcgc < 4:103874/140‑1 (MQ=255) tGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCAGGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGt > 2:56390/1‑149 (MQ=255) gggTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCTTCAGACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTg < 1:300465/149‑1 (MQ=255) gggTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTggcg < 7:19826/149‑1 (MQ=255) ggTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATctggacacccggcattcatagcccagaacagatacaaggctggcgtaaggtcaccgacgctgttcacgccgaagggggggtgatctttgctcaactttggcatgtaggccgcgt < 8:242406‑M2/149‑115 (MQ=255) ggTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTggcgg < 8:333407/149‑1 (MQ=255) ggTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGGTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTggcgg < 8:338247/149‑1 (MQ=255) cAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATctggacacccggcattcatagcccagaacagatacaaggctggcgtaaggtcaccgacgctgttcacgccgaagggggggtgatctttg > 5:5473‑M2/1‑29 (MQ=255) cAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATctggacacccggcattcatagcccagaacagatacaaggctggcgtaaggtcaccgacgctgttcacgccgaagggggggtgatctttg < 6:5473‑M2/118‑90 (MQ=255) cAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTAc > 6:37167/1‑149 (MQ=255) cAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTAc > 5:363991/1‑149 (MQ=255) gCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTACGa > 5:130577/1‑148 (MQ=255) gTAACCCTTTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCTCCATGAATCCAGCACCGCGGGGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTTGCGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTACGATa < 1:287519/149‑1 (MQ=255) gTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTgg > 4:305780/1‑112 (MQ=255) gTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTgg < 3:305780/112‑1 (MQ=255) cccTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTACGATACGGtc > 8:315706/1‑148 (MQ=255) ccTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCGTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGCTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTACGATACGGTTc > 2:183624/1‑149 (MQ=255) cTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCAACGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTACGATACGGTTCt < 4:110502/149‑1 (MQ=255) tGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTACGAt > 3:8328/1‑140 (MQ=255) tGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTACGAt < 4:8328/140‑1 (MQ=255) gTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTACGATACGGTTCTTg > 7:255979/1‑149 (MQ=255) tCCCCGGGGTTCGATctggacacccggcattcatagcccagaacagatacaaggctggcgtaaggtcaccgacgctgttcacgccgaagggggggtgatctttgctcaactttggcatgtaggccgcgtgtcgcacacatcgctgca > 7:242406‑M2/1‑15 (MQ=255) tCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTACGATACGGTTCtt < 2:188885/147‑1 (MQ=255) tCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTACGATACGGTTCTTGa < 1:28922/149‑1 (MQ=255) cccGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTACGATACGGTTCTTGAgg > 2:283605/1‑149 (MQ=255) cccGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTACGATACGGTTCTTGAgg < 6:363991/149‑1 (MQ=255) cGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTACGATACGGTTCTTGAGGgt < 2:276465/149‑1 (MQ=255) ggTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGc < 3:266259/88‑1 (MQ=255) ggTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGc > 4:266259/1‑88 (MQ=255) gATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTACGATACGGTTCTTGAgg < 7:339215/139‑1 (MQ=255) gATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTACGATACGGTTCTTGAgg > 8:339215/1‑139 (MQ=255) aTCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCATTGGCGGCAGTACGATACGGTTCTTGAGGGTGTATgcgcg > 8:352036/1‑148 (MQ=255) aTCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTACGATACGGTTCTTGAGGGTGTATGGGcc > 6:279301/1‑149 (MQ=255) tCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTACGATACGGTTCTTGAGGGTGTATGGGcc > 1:215095/1‑148 (MQ=255) | TGTGCGACACGCGGCCTACATGCCAAAGTTGAGCAAAGATCACCCCCCCTTCGGCGTGAACAGCGTCGGTGACCTTACGCCAGCCTTGTATCTGTTCTGGGCTATGAATGCCGGGTGTCCAGGCGTAACCCTGTCCCCGGGGTTCGATCTGGGTGCCCTCGGTCACCATGAAGCCAGCACCGCTGCGCT‑‑‑GACGGTAATAGGTGGCCATGAGGTCGTT‑CGCAATGTTGCCGGGTTGGGAGCTGCGCGAACGCGTCAGTGGCGGCAGTACGATACGGTTCTTGAGGGTGTATGGGCC > NC_002947/2833513‑2833807 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |