New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3045182 = | 46 (0.780) | 6 (0.110) | 5/250 | NT | 11.6% | coding (724/969 nt) | pstC | phosphate ABC transporter permease |
? | NC_002947 | 3045215 = | 47 (0.820) | coding (757/969 nt) | pstC | phosphate ABC transporter permease |
GGCGGTTTCCCAGGATGCGCTGACCAGCGTACCTATGAAAACCAAGCAGGCTGCCTACGGCATGGGTACTACCCACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGCCAACACCCTGGCGGCGCTGCTGGCGCTGAACTTCCCGGAAGCCGGCCCGAACGAGGTCGAAG > NC_002947/3045034‑3045326 | tgatgaacatcagtaccagtgccgcgtacatcagcacttcgacctcgttcgggccggcttccgggaagttcagcgccagcagcgccgccagggtgttggccggtgcgaacaaggacagggaaatggtgttggcgttgccgaccagcatg > 5:152699‑M1/149‑149 (MQ=255) tgatgaacatcagtaccagtgccgcgtacatcagcacttcgacctcgttcgggccggcttccgggaagttcagcgccagcagcgccgccagggtgttggccggtgcgaacaaggacagggaaatggtgttggcgttgccgaccagcatg < 5:138534‑M1/1‑1 (MQ=255) gatgaacatcagtaccagtgccgcgtacatcagcacttcgacctcgttcgggccggcttccgggaagttcagcgccagcagcgccgccagggtgttggccggtgcgaacaaggacagggaaatggtgttggcgttgccgaccagcatgg < 1:169958‑M1/2‑1 (MQ=255) atgaacatcagtaccagtgccgcgtacatcagcacttcgacctcgttcgggccggcttccgggaagttcagcgccagcagcgccgccagggtgttggccggtgcgaacaaggacagggaaatggtgttggcgttgccgaccagcatGGc > 3:344802‑M1/147‑149 (MQ=255) tttCCCAGGATGCGCTGACGAGCGTACCTATGAAAACCAAGCAGGCTGCCTACGGCATGGGTACTACCCACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGt < 2:238521/149‑1 (MQ=255) tCCCAGGATGCGCTGACCAGCGTACCTATGAAAACCAAGCAGGCTGCCTACGGCATGGGTACTACCCACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTTGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTg < 3:116231/148‑1 (MQ=255) cagtaccagtgccgcgtacatcagcacttcgacctcgttcgggccggcttccgggaagttcagcgccagcagcgccgccagggtgttggccggtgcgaacaaggacagggaaatggtgttggcgttgccgaccagcatGGCCGTGCACt < 3:336093‑M1/11‑1 (MQ=255) gATGCGCTGACCAGCGTACCTATGAAAACCAAGCAGGCTGCCTACGGCATGGGTACTACCCACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCgg > 6:127861/1‑149 (MQ=255) aTGCGCTGACCAGCGTACCTATGAAAACCAAGCAGGCTGCCTACGGCATGGGTACTACCCACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCAGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCACGGCCCAGGCCCAGCAccagcg < 5:183423/149‑6 (MQ=255) tGACCAGCGTACCTATGAAAACCAAGCAGGCTGCCTACGGCATGGGTACTACCCACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAAc > 1:238700/1‑148 (MQ=255) ccAGCGTACCTATGAAAACCAAGCAGGCTGCCTACGGCATGGGTACTACCCACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATg < 4:198697/149‑1 (MQ=255) aGCGTACCTATGAAAACCAAGCAGGCTGCCTACGGCATGGGTACTACCCACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGgc > 3:286731/1‑149 (MQ=255) gcacttcgacctcgttcgggccggcttccgggaagttcagcgccagcagcgccgccagggtgttggccggtgcgaacaaggacagggaaatggtgttggcgttgccgaccagcatGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCa < 7:75789‑M1/34‑1 (MQ=255) tGAAAACCAAGAAGGCTGCCTACGGCATGGGTACTACCAACTGGGAAGCCATCATCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGATACCGGCATCTTCGGTTCGCTGTTGCAGGGCCTGGCCCGAGCAAACGGTGAAACCATGGAGCTGGCCATg > 6:70098/1‑149 (MQ=255) cttcgacctcgttcgggccggcttccgggaagttcagcgccagcagcgccgccagggtgttggccggtgcgaacaaggacagggaaatggtgttggcgttgccgaccagcatGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGc > 8:75789‑M1/113‑149 (MQ=255) cttcgacctcgttcgggccggcttccgggaagttcagcgccagcagcgccgccagggtgttggccggtgcgaacaaggacagggaaatggtgttggcgttgccgaccagcatGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGc > 4:336093‑M1/113‑149 (MQ=255) ttcgacctcgttcgggacggcttccgggaagttcagcgccagcagcgccgccagggtgttggccggtgcgaacaaggacagggaaatggtgttggcgttgccgaccagcatGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCt > 7:125936‑M1/112‑149 (MQ=255) aaaCCAAGCAGGCTGCCTACGGCATGGGTACTACCCACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑g > 6:234529/1‑149 (MQ=255) aaaCCAAGCAGGCTGCCTACGGCATGGGTACTACCCACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑g < 3:318119/149‑1 (MQ=255) gacctcgttcgggccggcttccgggaagttcagcgccagcagcgccgccagggtgttggccggtgcgaacaaggacagggaaatggtgttggcgttgccgaccagcatGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑gg > 4:305385‑M1/109‑148 (MQ=255) ccAAGCAGGCTGCCTACGGCATGGGTACTACCCACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTc < 5:127861/149‑1 (MQ=255) ccAAGCAGGCTGCCTACGGCATGGGTACTACCCACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTc < 5:234529/149‑1 (MQ=255) ccAAGCAGGCTGCCTACGGCATGGGTACTACCCACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTAGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTc > 3:1428/1‑149 (MQ=255) cAGGCTGCCTACGGCATGGGTACTACCCACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCaa > 1:56384/1‑149 (MQ=255) tGCCTACGGCATGGGTACTACCCACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGcc > 2:70528/1‑148 (MQ=255) ccTACGGCATGGGTACTACCCACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGa > 4:270773/1‑112 (MQ=255) ccTACGGCATGGGTACTACCCACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGa < 3:270773/112‑1 (MQ=255) ccTACGGCATGGGTACTACCCACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCaa > 3:115282/1‑148 (MQ=255) gTACTACCCACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTg > 2:174374/1‑149 (MQ=255) ctacCCACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTc < 4:342276/148‑1 (MQ=255) cccACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTg < 4:1428/149‑1 (MQ=255) cccACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTg > 2:169958/1‑149 (MQ=255) cccACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTg > 6:26338/1‑149 (MQ=255) aCTGGGAAGCCATCCTCAAGGTTATGGTGCCCTCGGCTGATACCGTCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCTTGGACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTc < 8:264977/149‑1 (MQ=255) ggAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTCGCAc > 1:370543/1‑149 (MQ=255) tCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGCCAac < 2:238700/149‑1 (MQ=255) tCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGCCAACAcc > 4:236897/1‑149 (MQ=255) ggTGCTGGTGCCCTCGTCGGCTACCGTCATCTTCTGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCTTTTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGCCAACACCCTgg < 5:70098/149‑1 (MQ=255) tGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGTCCATGCT‑GGTCGCCACCGCCAACACCAATTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGACAACACCCTggcg > 5:375530/1‑149 (MQ=255) aTGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGCCAACACCCTggcggc < 2:56384/149‑1 (MQ=255) gTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAAACATTGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGCCAACACCCTGGCGGCgct > 6:168986/1‑149 (MQ=255) ccTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGCCAACACCCTGGCGGCGctgctg > 1:85675/1‑149 (MQ=255) cTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGCCAACACCCTGGCGGCGCTGCTgg < 5:26338/149‑1 (MQ=255) gcTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGCCAACACCCTGGCGGCGCTGCTGGCGCTGaa < 1:70528/149‑1 (MQ=255) cTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGCCAACACCCTGGCGGCGCTGCTGGCGCTGAAc < 4:115282/149‑1 (MQ=255) cGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGCCAACACCCTGGCGGCGCTGCTGGCGCTGAACTTcc > 6:285456/1‑149 (MQ=255) gCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTTGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGCCAACACCCTGGCGGCGCTGCTGGCGCTGAACTTCCCg < 4:286731/149‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGCCAACACCCTGGCGGCGCTGCTGGCGCTGAACTTCCCGGAAGCCGGcc < 2:370543/149‑1 (MQ=255) tGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGCCAACACCCTGGCGGCGCTGCTGGCGCTGAACTTCCCGGAAGCCGGCCCGAAc > 8:2537/1‑149 (MQ=255) gTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGCCAACACCCTGGCGGCGCTGCTGGCGCTGAACTTCCCGGAAGCCGGCCCGAAc < 7:2537/147‑1 (MQ=255) tgggcctgggccGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGCCAACACCCTGGCGGCGCTGCTGGCGCTGAACTTCCCGGAAGCCGGCCCGAACGAGGTc > 7:128357/1‑149 (MQ=255) tgggcctgggccGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGCCAACACCCTGGCGGCGCTGCTGGCGCTGAACTTCCCGGAAGCCGGCCCGAACGAGGTc > 8:51741/1‑149 (MQ=255) gggcctgggccGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGCCAACACCCTGGCGGCGCTGCTGGCGCTGAACTTccc < 5:126004/126‑1 (MQ=255) gggcctgggccGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGCCAACACCCTGGAGGCGCTGCTGGCGCTGAACTTccc > 6:126004/1‑126 (MQ=255) ggcctgggccGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGCCAACACCCTGGCGGCGCTGCTGGCGCTGAACTTCCCGGAAGCCGGCCCGAACGAGGTc < 3:236897/147‑1 (MQ=255) ggcctgggccGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGCCAACACCCTGGCGGCGCTGCTGGCGCTGAACTTCCCGGAAGCCGGCCCGAACGAGGTCg > 8:152659/1‑148 (MQ=255) ctgggccGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCTGGGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGCCAACACCCTGGCGGCGCTGCTGGCGCTGAACTTCCCGGAAGCCGGCCCGAACGAGGTCGAAg > 1:70566/1‑149 (MQ=255) | GGCGGTTTCCCAGGATGCGCTGACCAGCGTACCTATGAAAACCAAGCAGGCTGCCTACGGCATGGGTACTACCCACTGGGAAGCCATCCTCAAGGTGATGGTGCCCTCGGCGGCTACCGGCATCTTCGGTTCGCTGGTGCTGGGCCTGGGCCGTGCACTCGGTGAAACCATGGCGCTGGCCATGCT‑GGTCGGCAACGCCAACACCATTTCCCTGTCCTTGTTCGCACCGGCCAACACCCTGGCGGCGCTGCTGGCGCTGAACTTCCCGGAAGCCGGCCCGAACGAGGTCGAAG > NC_002947/3045034‑3045326 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |