New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3975820 = | 60 (1.020) | 4 (0.070) | 4/246 | NT | 6.9% | intergenic (‑44/+34) | PP_3505/PP_3506 | hypothetical protein/magnesium chelatase subunit ChII |
? | NC_002947 | 3975854 = | 50 (0.890) | coding (1014/1014 nt) | PP_3506 | magnesium chelatase subunit ChII |
CTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTGGCTACCGGCTGTGCCGGTAATGCCCCCCAGTCGCCCTGCCCGCCCCGCTCACCCGGGTTGC > NC_002947/3975680‑3975960 | ctTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGcc > 5:261375/1‑149 (MQ=255) acagccgcctgaccagcagcctggcgccggcaacccgggtgagcggggcgggcagggcgactggggggcattaccggcacagccggtagccagcggcgcccgccgcgaggtgccgaactgggcaaaaaagccctgaGCATCCGCCCCtt < 7:304674‑M1/13‑1 (MQ=255) tgcCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTtgg > 5:42093/1‑145 (MQ=255) tgcCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTtgg < 6:42093/145‑1 (MQ=255) ccAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTtggctggt < 7:306687/148‑1 (MQ=255) ccAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTtggctgg < 8:268181/147‑1 (MQ=255) ccAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCCTtggctggt < 4:153279/148‑1 (MQ=255) gCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTtgg > 2:72929/1‑140 (MQ=255) gCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTtgg < 1:72929/140‑1 (MQ=255) caGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTggg < 6:261375/149‑1 (MQ=255) ggTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTgggg > 6:193104/1‑148 (MQ=255) gTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGa > 1:233541/1‑149 (MQ=255) gTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGa > 7:202632/1‑149 (MQ=255) gTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGa > 7:269461/1‑149 (MQ=255) cTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATg < 8:202632/148‑1 (MQ=255) tGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCt > 7:221947/1‑149 (MQ=255) gTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCt > 2:243804/1‑148 (MQ=255) gTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCt > 1:279573/1‑148 (MQ=255) gCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑ACCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAg < 4:91788/148‑1 (MQ=255) ccggcaacccgggtgagcggggcgggcagggcgactggggggcattaccggcacagccggtagccagcggcgcccgccgcgaggtgccgaactgggcaaaaaagccctgaGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAgg > 8:304674‑M1/111‑149 (MQ=255) ggcaacccgggtgagcggggcgggcagggcgactggggggcattaccggcacagccggtagccagcggcgcccgccgcgaggtgccgaactgggcaaaaaagccctgaGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCa < 7:251707‑M1/37‑1 (MQ=255) ggcaacccgggtgagcggggcgggcagggcgactggggggcattaccggcacagccggtagccagcggcgcccgccgcgaggtgccgaactgggcaaaaaagccctgaGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCa > 8:251707‑M1/109‑145 (MQ=255) tCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCa < 5:193104/149‑1 (MQ=255) tCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCa < 8:221947/149‑1 (MQ=255) tttGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGtt > 3:357606/1‑149 (MQ=255) tttGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGtt > 3:186200/1‑149 (MQ=255) tGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGtt < 7:299663/147‑1 (MQ=255) gAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCgg > 4:273538/1‑149 (MQ=255) gCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTAAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCa > 8:143277/1‑149 (MQ=255) aGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGcggcgg < 2:211650/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCggcggg > 3:297773/1‑149 (MQ=255) cAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCggcgggc‑g > 5:49398/1‑149 (MQ=255) gCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCACTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGc‑gccg > 7:41051/1‑149 (MQ=255) cTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTTAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGc‑gccgc < 7:143277/149‑1 (MQ=255) aCCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTg > 4:163250/1‑149 (MQ=255) cccGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCTTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTgg < 1:243804/149‑1 (MQ=255) cccGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCt < 8:269461/147‑1 (MQ=255) cccGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTgg < 2:279573/149‑1 (MQ=255) cccggccggCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGcggcgg > 3:41351/2‑136 (MQ=255) cccggccggCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGcggcgg < 4:41351/135‑1 (MQ=255) ccggcc‑gCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTGGCTAcc < 2:233541/149‑1 (MQ=255) ggcc‑gCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTGGCTACCgg < 6:364673/149‑1 (MQ=255) cATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTGGCTACCGGCTGTGCCg > 1:190488/1‑149 (MQ=255) cATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCCTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTGGCTACCGGCTGTGCCg < 7:346362/149‑1 (MQ=255) gCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTGGCTACCGGCACAGCCGGTagc < 3:273538/148‑3 (MQ=255) aCGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCt > 3:319310/1‑124 (MQ=255) aCGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCt < 4:319310/124‑1 (MQ=255) aCGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCAGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTGGCTACCGGCTGTGCCGGTAATGcc > 2:77165/1‑149 (MQ=255) aGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTGGCTACCGGCTGTGCCGGTAATGccccc < 2:190488/149‑1 (MQ=255) gcggGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTGGCTACCGGCTGTGCCGGTAATGCCCCCCAGTCGcc < 6:49398/149‑1 (MQ=255) ggTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGCAGCCGCTGGCTACCGGCTGTGCCGGTAATGCCCCCCAGTCGCCCt < 1:77165/149‑1 (MQ=255) ccGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTGGCTACCGGCTGTGCCGGTAATGCCCCCCAGTCGCCCTgccc < 4:342796/148‑1 (MQ=255) cGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTGGCTACCGGCTGTGCCGGTAATGCCCCCCAGTCGCCCTgcccgc > 1:79904/1‑149 (MQ=255) cGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTGGCTACCGGCTGTGCCGGTAATGCCCCCCAGTCGCCCTgcccgc < 1:65035/149‑1 (MQ=255) gCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTGGCTACCGGCTGTGCCGGTAATGCCCCCCAGTCGcc > 8:6677/1‑131 (MQ=255) gCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTGGCTACCGGCTGTGCCGGTAATGCCCCCCAGTCGcc < 7:6677/131‑1 (MQ=255) ccTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTGGCTACCGGCTGTGCCGGTAATGCCCCCCAGTCGCCCTGCCCGCCCCGCTCAccc > 6:352816/1‑149 (MQ=255) cTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTGGCTACCGGCTGTGCCGGTAATGCCCCCCAGTCGCCCTGCCCGCCCCGCTCACCCg > 1:82948/1‑149 (MQ=255) tATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTg < 8:252650/93‑1 (MQ=255) tATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTg > 7:252650/1‑93 (MQ=255) tGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTGGCTACCGGCTGTGCCGGTAATGCCCCCCAGTCGCCCTGCCCGCCCCGCTCACCCgg < 4:44089/147‑1 (MQ=255) ccGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCTGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTGGCTACCGGCTGTGCCGGTAATGCCCCCCAGTc < 1:301342/120‑1 (MQ=255) ccGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTGGCTACCGGCTGTGCCGGTAATGCCCCCCAGTc > 2:301342/1‑120 (MQ=255) ccGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTGGCTACCGGCTGTGCCGGTAATGCCCCCCAGTCGCCCTGCCCGCCCCGCTCACCCGGGTTGc > 3:22235/1‑149 (MQ=255) | CTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCC‑GCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGC‑GCCGCTGGCTACCGGCTGTGCCGGTAATGCCCCCCAGTCGCCCTGCCCGCCCCGCTCACCCGGGTTGC > NC_002947/3975680‑3975960 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |