New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4586321 | 60 (1.020) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 6.9% | coding (1494/1683 nt) | PP_4063 | long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
? | NC_002947 | = 4586353 | 52 (0.930) | coding (1462/1683 nt) | PP_4063 | long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
ACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTCGCCGCCGCGAATGATCATGTCCTTGTTG > NC_002947/4586174‑4586468 | aCGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCt > 2:198582/1‑149 (MQ=255) gCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCtt > 8:222523/1‑148 (MQ=255) tGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCTTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGTCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATc < 1:269030/149‑1 (MQ=255) ggAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAg < 3:338968/149‑1 (MQ=255) ggAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAg > 8:134041/1‑149 (MQ=255) cTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGcga > 4:161052/1‑149 (MQ=255) cTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGcga > 4:193191/1‑149 (MQ=255) ttCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGcgac > 5:214014/1‑149 (MQ=255) ttCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGcgac > 7:102684/1‑149 (MQ=255) tGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAg < 8:229552/141‑1 (MQ=255) tGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAg > 7:229552/1‑141 (MQ=255) gCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCcgctatggcgaa > 7:190405‑M1/1‑131 (MQ=255) gCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGAtc > 3:118117/1‑149 (MQ=255) gCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTc < 8:102684/147‑1 (MQ=255) ggTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGgc < 3:153245‑M2/149‑3 (MQ=255) gTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGgct > 7:202404‑M2/1‑146 (MQ=255) tCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGgctgcac > 4:118117‑M2/1‑142 (MQ=255) gggTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGTGTGCAGCt < 5:8656/109‑1 (MQ=255) gggTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCt > 6:8656/1‑109 (MQ=255) gggTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCcgctatggcgaagagatcgtcgcctggatcaagctgcacc < 8:190405‑M1/148‑41 (MQ=255) gggTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACgg < 1:198582/149‑1 (MQ=255) ggTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACgg > 7:63846/1‑148 (MQ=255) gTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGaa < 7:134041/149‑1 (MQ=255) tcgtcgACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTc < 6:90031/125‑1 (MQ=255) tcgtcgACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTc > 5:90031/1‑125 (MQ=255) tcgtcgACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGcc > 6:89292/1‑149 (MQ=255) tcgtcgACAAAACGTATATACCGCGGCACCATGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGcc > 7:76661/1‑149 (MQ=255) tcgtcgACAAAACGTATATACCGCGGCAACTTGAATTGTGAGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTACTAGACCCTGGCGCTGTGC‑CCCGTGTGCAGCTTGATCCAGGCGAGGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGcc > 1:234568/1‑149 (MQ=255) gtcgACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGcc < 7:222523/147‑1 (MQ=255) gtcgACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCg < 6:214014/148‑1 (MQ=255) gtcgACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGa > 5:164651/1‑149 (MQ=255) gtcgACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGa > 6:347232/1‑149 (MQ=255) gACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATc < 8:76661/148‑1 (MQ=255) aCAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCcgctatggcgaagagatcgtcgcctggatcaagct > 1:234292‑M1/1‑96 (MQ=255) aCAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCcgctatggcgaagagatcgtcgcctggatcaagct < 2:234292‑M1/131‑36 (MQ=255) aaCGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTgc < 5:347232/149‑1 (MQ=255) taCCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCgg < 6:164651/148‑1 (MQ=255) taCCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCgg < 3:193191/148‑1 (MQ=255) cgcgGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCAc < 2:23440/149‑1 (MQ=255) ccTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCgg > 6:169352/1‑148 (MQ=255) ccTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCgg < 5:169352/148‑1 (MQ=255) cTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCgggt < 7:109940/149‑1 (MQ=255) gAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCgggtgg < 5:311663/148‑1 (MQ=255) gAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCgggtgg < 6:267351/148‑1 (MQ=255) gtgtGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGggtgggtg > 3:277164/1‑148 (MQ=255) tgCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGAt < 3:85666/81‑1 (MQ=255) tgCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGAt > 4:85666/1‑81 (MQ=255) cGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGaaa < 3:161052/149‑1 (MQ=255) gATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGACGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGaaa > 6:324516/1‑148 (MQ=255) gTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑ACCGGGTGCAGCTTGATCCTTGCGTCGATCTCTTCGCCATATCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAATctcc < 2:234568/149‑1 (MQ=38) tGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCg < 2:77749/79‑1 (MQ=255) tGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCg > 1:77749/1‑79 (MQ=255) tGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCgggtgg < 6:274014/133‑1 (MQ=255) tGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCgggtgg > 5:274014/1‑133 (MQ=255) gCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATc < 7:238756/105‑1 (MQ=255) gCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATc > 8:238756/1‑105 (MQ=255) gCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGaaa < 5:329072/136‑1 (MQ=255) gCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGaaa > 6:329072/1‑136 (MQ=255) aCCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCa > 6:339138/1‑149 (MQ=255) aCCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCa > 2:362281/1‑149 (MQ=255) aCCAGCCCTGCAGCTCCTAGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCa > 2:128739/1‑149 (MQ=255) aGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCAcgc < 5:89292/149‑1 (MQ=255) ccTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGCTCCCGGGTGCAGATTGAACCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGATTGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCCCCGGGTGGGTGAAGAAAAAGTCCACCAGCTAACGCgg > 1:27008/1‑149 (MQ=255) aGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAAt < 4:153245/149‑1 (MQ=255) tcctcGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAAt < 3:203669/146‑1 (MQ=255) tcctcGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAAt > 4:203669/1‑146 (MQ=255) cctcGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTtc > 2:26911/1‑149 (MQ=255) aCCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTcgcc < 4:277164/149‑1 (MQ=255) ccGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTGCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTcgccg > 1:142665/1‑149 (MQ=255) c‑cccGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTCGCCGCCGCGAATGATCa > 3:150530/1‑149 (MQ=255) ggTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGgctgcacccggggcacagcgccacggtcgaggagctgcagggctggtgcaaggcacgcatcgcacacttcaaggtgccgcggtatatacgttttgtcgacgagtaccc < 8:190405‑M2/148‑109 (MQ=255) gTGCAGCcgctatggcgaagagatcgtcgcctggatcaagctgcacccggggcacagcgccacggtcgaggagctgcagggctggtgcaaggcacgcatcgcacacttcaaggtgccgcggtatatacgttttgtcgacgagtacccga > 4:118117‑M1/1‑7 (MQ=255) gTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTCGCCGCCGCGAATGATCATGTCCt < 1:128739/149‑1 (MQ=255) aGCcgctatggcgaagagatcgtcgcctggatcaagctgcacccggggcacagcgccacggtcgaggagctgcagggctggtgcaaggcacgcatcgcacacttcaaggtgccgcggtatatacgttttgtcgacgagtacccgatgac > 7:202404‑M1/1‑3 (MQ=255) aGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGgctgcacccggggcacagcgccacggtcgaggagctgcagggctggtgcaaggcacgcatcgcacacttcaaggtgccgcggtatatacgttttgt > 1:234292‑M2/1‑35 (MQ=255) aGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGgctgcacccggggcacagcgccacggtcgaggagctgcagggctggtgcaaggcacgcatcgcacacttcaaggtgccgcggtatatacgttttgt < 2:234292‑M2/131‑97 (MQ=255) aGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTCGCCGCCGCGAATGATCATGTCCttgtt < 1:362281/149‑1 (MQ=255) aGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTCGCCGCCGCGAATGATCATGTCCttgtt < 8:63846/149‑1 (MQ=255) gCcgctatggcgaagagatcgtcgcctggatcaagctgcacccggggcacagcgccacggtcgaggagctgcagggctggtgcaaggcacgcatcgcacacttcaaggtgccgcggtatatacgttttgtcgacgagtacccgatgacc < 3:153245‑M1/149‑148 (MQ=255) gCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTCGCCGCCGCGAATGATCATGTCCttgttg > 4:319405/1‑149 (MQ=255) cTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAAt < 8:307067/114‑1 (MQ=255) | ACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTCGCCGCCGCGAATGATCATGTCCTTGTTG > NC_002947/4586174‑4586468 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |