New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4586321 | 60 (1.020) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 6.9% | coding (1494/1683 nt) | PP_4063 | long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
? | NC_002947 | = 4586353 | 52 (0.930) | coding (1462/1683 nt) | PP_4063 | long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
GGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTCGCCGCCGCGAATGATCATGTCCTTGTTGCGCCCGACGATGCGCACATAGCCCTGCTC > NC_002947/4586207‑4586497 | ggTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGgc < 3:153245‑M2/149‑3 (MQ=255) gTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGgct > 7:202404‑M2/1‑146 (MQ=255) tCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGgctgcac > 4:118117‑M2/1‑142 (MQ=255) gggTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACgg < 1:198582/149‑1 (MQ=255) ggTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACgg > 7:63846/1‑148 (MQ=255) gTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGaa < 7:134041/149‑1 (MQ=255) tcgtcgACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGcc > 6:89292/1‑149 (MQ=255) tcgtcgACAAAACGTATATACCGCGGCACCATGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGcc > 7:76661/1‑149 (MQ=255) tcgtcgACAAAACGTATATACCGCGGCAACTTGAATTGTGAGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTACTAGACCCTGGCGCTGTGC‑CCCGTGTGCAGCTTGATCCAGGCGAGGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGcc > 1:234568/1‑149 (MQ=255) gtcgACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGcc < 7:222523/147‑1 (MQ=255) gtcgACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCg < 6:214014/148‑1 (MQ=255) gtcgACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGa > 6:347232/1‑149 (MQ=255) gtcgACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGa > 5:164651/1‑149 (MQ=255) gACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATc < 8:76661/148‑1 (MQ=255) aaCGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTgc < 5:347232/149‑1 (MQ=255) taCCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCgg < 6:164651/148‑1 (MQ=255) taCCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCgg < 3:193191/148‑1 (MQ=255) cgcgGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCAc < 2:23440/149‑1 (MQ=255) ccTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCgg > 6:169352/1‑148 (MQ=255) ccTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCgg < 5:169352/148‑1 (MQ=255) cTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCgggt < 7:109940/149‑1 (MQ=255) gAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCgggtgg < 6:267351/148‑1 (MQ=255) gAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCgggtgg < 5:311663/148‑1 (MQ=255) gtgtGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGggtgggtg > 3:277164/1‑148 (MQ=255) cGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGaaa < 3:161052/149‑1 (MQ=255) gATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGACGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGaaa > 6:324516/1‑148 (MQ=255) gTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑ACCGGGTGCAGCTTGATCCTTGCGTCGATCTCTTCGCCATATCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAATctcc < 2:234568/149‑1 (MQ=38) tGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCgggtgg > 5:274014/1‑133 (MQ=255) tGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCgggtgg < 6:274014/133‑1 (MQ=255) gCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATc > 8:238756/1‑105 (MQ=255) gCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATc < 7:238756/105‑1 (MQ=255) gCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGaaa > 6:329072/1‑136 (MQ=255) gCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGaaa < 5:329072/136‑1 (MQ=255) aCCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCa > 6:339138/1‑149 (MQ=255) aCCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCa > 2:362281/1‑149 (MQ=255) aCCAGCCCTGCAGCTCCTAGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCa > 2:128739/1‑149 (MQ=255) aGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCAcgc < 5:89292/149‑1 (MQ=255) ccTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGCTCCCGGGTGCAGATTGAACCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGATTGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCCCCGGGTGGGTGAAGAAAAAGTCCACCAGCTAACGCgg > 1:27008/1‑149 (MQ=255) aGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAAt < 4:153245/149‑1 (MQ=255) tcctcGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAAt > 4:203669/1‑146 (MQ=255) tcctcGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAAt < 3:203669/146‑1 (MQ=255) cctcGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTtc > 2:26911/1‑149 (MQ=255) aCCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTcgcc < 4:277164/149‑1 (MQ=255) ccGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTGCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTcgccg > 1:142665/1‑149 (MQ=255) c‑cccGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTCGCCGCCGCGAATGATCa > 3:150530/1‑149 (MQ=255) ggTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGgctgcacccggggcacagcgccacggtcgaggagctgcagggctggtgcaaggcacgcatcgcacacttcaaggtgccgcggtatatacgttttgtcgacgagtaccc < 8:190405‑M2/148‑109 (MQ=255) gTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTCGCCGCCGCGAATGATCATGTCCt < 1:128739/149‑1 (MQ=255) aGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGgctgcacccggggcacagcgccacggtcgaggagctgcagggctggtgcaaggcacgcatcgcacacttcaaggtgccgcggtatatacgttttgt < 2:234292‑M2/131‑97 (MQ=255) aGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGgctgcacccggggcacagcgccacggtcgaggagctgcagggctggtgcaaggcacgcatcgcacacttcaaggtgccgcggtatatacgttttgt > 1:234292‑M2/1‑35 (MQ=255) aGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTCGCCGCCGCGAATGATCATGTCCttgtt < 1:362281/149‑1 (MQ=255) aGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTCGCCGCCGCGAATGATCATGTCCttgtt < 8:63846/149‑1 (MQ=255) gCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTCGCCGCCGCGAATGATCATGTCCttgttg > 4:319405/1‑149 (MQ=255) cTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAAt < 8:307067/114‑1 (MQ=255) ccAGGCGACGATCTCTTCACCAAAGCCGCTGCACGGAATGCCGATAACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGAGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTCGAAGCCTCGAATGATCATGTCCTTGTTGCGCCcga > 2:195548/1‑149 (MQ=255) cAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTCGCCGCCGCGAATGATCATGTCCTTGTTGCGCCcgac > 6:141896/1‑149 (MQ=255) ggCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTCGCCGCCGCGAATGATCATGTCCTTGTTGCGCCcgacga > 6:189993/1‑149 (MQ=255) gCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTCGCCGCCGCGTATGATCATGTCCTTGTTGCGCCCGACGAt < 1:26911/149‑1 (MQ=255) tctcTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTCGCCGCCGCGAATGATCATGTCCTTGTTGCGCCCGACGATGCGcaca > 8:254157/1‑149 (MQ=255) ctTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTCGCCGCCGCGAATGATCATGTCCTTGTTGCGCCCGACGATGCGCACATAg > 1:353520/1‑149 (MQ=255) ttCGCCATAGCGgctgcacccggggcacagcgccacggtcgaggagctgcagggctggtgcaaggcacgcatcgcacacttcaaggtgccgcggtatatacgttttgtcgacgagtacccgatgaccgtgaccggcaaggtgc > 7:190405‑M2/1‑12 (MQ=255) gCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTCGCCGCCGCGAATGATCATGTCCTTGTTGCGCCcga < 7:338626/131‑1 (MQ=255) gCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTCGCCGCCGCGAATGATCATGTCCTTGTTGCGCCcga > 8:338626/1‑131 (MQ=255) tAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTCGCCGCCGCGAATGATCATGTCCTTGTTGCGCCCGACGATGCGCACATAGCCCTGCTc < 4:150530/149‑1 (MQ=255) | GGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGCCTTGCACCAGCCCTGCAGCTCCTCGACCGTGGCGCTGTGC‑CCCGGGTGCAGCTTGATCCAGGCGACGATCTCTTCGCCATAGCGGCTGCACGGAATGCCGATCACCTGCGCATCGGCCACCGCCGGGTGGGTGTAGAAAAACTCCTCCAGCTCACGCGGGTAAATGTTCTCGCCGCCGCGAATGATCATGTCCTTGTTGCGCCCGACGATGCGCACATAGCCCTGCTC > NC_002947/4586207‑4586497 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |