New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4652318 = | 77 (1.310) | 4 (0.070) | 3/246 | NT | 5.7% | coding (90/804 nt) | PP_4115 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 4652370 = | 60 (1.070) | coding (142/804 nt) | PP_4115 | hypothetical protein |
TATAATTTATAGCCTACAAGATAAACCAGGATAATACGACCGTCCGCAACAGTGCCGGCGTGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTGCCCGCCCTGCAGGCCTTCATCGGCAAGGACGGCACGGTCAGCGCCTTCGAGAACAAAC > NC_002947/4652170‑4652463 | tataATTTATAGCCTACAAGATAAACCAGGATAATACGACCGTCCGCAACAGTGCCGGCGTGATCCAGATCTGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTc < 2:92231/149‑1 (MQ=255) gcagcagggcgcgcaggtcgtcgatgcgctcggggctggcgttgacgatcagtttgttctcgaaggcgctgaccgtgccgtccttgccgatgaaggcctgcagggcgggcagcagttcggcgctgctgcgatgctgaagtggcaccacc < 7:179929‑M1/4‑1 (MQ=255) taGCCTACAAGATAAACCAGGATAATACGACCGTCCGCAACAGTGCCGGCGTGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTg > 3:90937/1‑149 (MQ=255) taGCCTACAAGATAAACCAGGATAATACGACCGTCCGCAACAGTGCCGGCGTGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTg > 6:136209/1‑149 (MQ=255) cTACAAGATAAACCAGGATAATACGACCGTCCGCAACAGTGCCGGCGTGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGc > 1:196174/1‑149 (MQ=255) taaaaGATAAACCAGGATAATACGACCGTCCGCAACAGTGACGAAGTGATCCAGATCCGGCAAAAACTCAGCAAATTTGCCATAATCTTTATTACACCAGCGGAGATCATGGACATGCAGCTACGCCCCCTTTTCACAACCCTGTTACt > 2:249325/4‑149 (MQ=255) tACAAGATAAACCAGGATAATACGACCGTCCGCAACAGTGCCGGCGTGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGc > 4:360264/1‑148 (MQ=255) tACAAGATAAACCAGGATAATACGACCGTCCGCAACAGTGCCGGCGTGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCt > 5:207221/1‑149 (MQ=255) cAAGATAAACCAGGATAATACGACCGTCCGCAACAGTGCCGGCGTGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGc < 3:360264/146‑1 (MQ=255) aGATAAACCAGGATAATACGACCGTCCGCAACAGTGCCGGCGTGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTc > 7:76950/1‑149 (MQ=255) aGATAAACCAGGATAATACGACCGTCCGCAACAGTGCCGGCGTGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTc < 2:261355/149‑1 (MQ=255) aaaCCAGGATAATACGACCGTCCGCAACAGTGCCGGCGTGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCa < 2:351754/149‑1 (MQ=255) aagcAGGATAATACGACCGTCCGCAAGAGTGCGGGCGTGATCCTGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTTCCATCATGTTGATTACACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCa < 1:249325/145‑1 (MQ=255) ataataCGACCGTCCGCAACAGTGCCGGCGTGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCAcc > 5:152392/1‑149 (MQ=255) taCGACCGTCCGCAACAGTGCCGGCGTGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGt < 1:353522/132‑1 (MQ=255) taCGACCGTCCGCAACAGTGCCGGCGTGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGt > 2:353522/1‑132 (MQ=255) taCGACCGTCCGCAACAGTGCCGGCGTGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATATTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGcc > 3:217422/1‑148 (MQ=255) tCCGCAACAGTGCCGGCGTGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCAcc > 2:218988/1‑137 (MQ=255) tCCGCAACAGTGCCGGCGTGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCAcc < 1:218988/137‑1 (MQ=255) 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aCAGTGCCGGCGTGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATATTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAg < 4:217422/149‑1 (MQ=255) gatcagtttgttctcgaaggcgctgaccgtgccgtccttgccgatgaaggcctgcagggcgggcagcagttcggcgctgctgcgatgctgaagtggcacCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAgg < 7:91357‑M1/50‑1 (MQ=255) agtttgttctcgaaggcgctgaccgtgccgtccttgccgatgaaggcctgcagggcgggcagcagttcggcgctgctgcgatgctgaagtggcacCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAggtggt > 8:91357‑M1/96‑149 (MQ=255) ccGGCGTGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACTGAGgtggtg > 7:124239/1‑149 (MQ=255) ccGGCGTGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAggtggt < 3:44297/148‑1 (MQ=255) cGGCGTGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAggtg < 7:199719/145‑1 (MQ=255) cGGCGTGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAggtg > 8:199719/1‑145 (MQ=255) gTGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACt < 4:90937/149‑1 (MQ=255) tGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACtt < 6:207221/149‑1 (MQ=255) cAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAggtg < 6:219803/135‑1 (MQ=255) cAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAggtg > 5:219803/1‑135 (MQ=255) tCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCgc < 6:152392/149‑1 (MQ=255) gCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCgcag > 5:94903/1‑147 (MQ=255) gCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGACGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCgcagca > 4:96147/1‑149 (MQ=255) cAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCa > 8:222010/1‑97 (MQ=255) cAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCa < 7:222010/97‑1 (MQ=255) aaaaGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTgg > 6:202489/1‑89 (MQ=255) aaaaGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTgg < 5:202489/89‑1 (MQ=255) aaaGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTCCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCACATTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGACAGCCTCACAGCCCATCCCGCCACCGAGGTGGTGCCAATACAGAATCGCAGCAgcgc > 8:12803/1‑149 (MQ=255) aaGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGcc < 6:94903/149‑1 (MQ=255) aaGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGcc < 2:121829/149‑1 (MQ=255) gTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCg > 6:357325/1‑148 (MQ=255) aGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAAct > 4:155368/1‑149 (MQ=255) 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gCAAATTTGCAATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCACCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCAACAGAGGTCGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAAct > 8:304484/1‑148 (MQ=255) aaaTTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAActgct > 6:144383/1‑149 (MQ=255) aTTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACtgctgc < 5:357325/149‑1 (MQ=255) cgatgaaggcctgcagggcgggcagcagttcggcgctgctgcgatgctgaagtggcacCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCgaggtggtac < 5:56618‑M1/56‑3 (MQ=255) cgatgaaggcctgcagggcgggcagcagttcggcgctgctgcgatgctgaagtggcacCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCgaggtggtac > 6:56618‑M1/59‑112 (MQ=255) catcatGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTgcccgccc > 1:48021/1‑149 (MQ=255) atcatGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTGCCCGCCCt > 8:86838/1‑149 (MQ=255) tcatGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCATCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTGCCCGCCCTg < 4:302224/149‑1 (MQ=255) tGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCAGCCACCGAGGTGCTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTGCCCGCCCTGCAGGcc > 8:179929/1‑149 (MQ=255) aTTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTGCCCGCCCTGCAGGCCt < 3:155368/148‑1 (MQ=255) aTTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTGCCCGCCCTGCAGGCCt < 2:236837/148‑1 (MQ=255) ttCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTGCCCGCCCTGCAGGCCTTc < 5:211096/149‑1 (MQ=255) cACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTGCCCGCCCTGCAGGCCTTCATc > 7:50380/1‑149 (MQ=255) cACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTGCCCGCCCTGCAGGCCTTCATc < 2:61667/149‑1 (MQ=255) aCCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTGCCCGCCCTGTAGGCCTTCATCg < 8:163921/149‑1 (MQ=255) aCCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTGCCCGCCCTGCAGGCCTTCATCg < 7:304484/149‑1 (MQ=255) 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gACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTGCCCGCCCTGCAGGCCTTCATCGGCAAGGACGGCACgg < 4:88822/148‑1 (MQ=255) aTGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTGCCCGCCCTGCAGGCCTTCATCGGCAAGGACGGCACGGTCAg < 3:353124/149‑1 (MQ=255) tGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTGCCCGCCCTGCAGGCCTTCATCGGCAAGGACGGCACGGTCAgc < 2:48021/149‑1 (MQ=255) gCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTGCCCGCCCTGCAGGCCTTCATCGGCAAGGAc > 2:126645/1‑136 (MQ=255) gCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTGCCCGCCCTGCAGGCCTTCATCGGCAAGGAc < 1:126645/136‑1 (MQ=255) gCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGGTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTGCCCGCCCTGCAGGCCTTCATCGGCAAGGACGGCACGGTCAGCGCCt < 7:12803/149‑1 (MQ=255) cGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTGCCCGCCCTGCAGGCCTTCATCGGCAAGGACGGCACGGTCAGCGCCTTc < 8:148991/147‑1 (MQ=255) ccccTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTGCCCGCCCTGCAGGCCTTCATCGGCAAGGACGGCACGGTCAGCGCCTTCGAGaa > 6:327682/1‑149 (MQ=255) ccTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTGCCCGCCCTGCAGGCCTTCATCGGCAAGGACGGCACGGTCAGCGCCTTCGAGAACa < 5:73273/149‑1 (MQ=255) ttttCACCTGCCTGTTGCGGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAAc < 3:5744/87‑1 (MQ=255) ttCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTGCCCGCCCTGCAGGCCTTCATCGGCAAGGACGGCACGGTCAGCGCCTTCGAGAACAAAc < 3:121403/148‑1 (MQ=255) tCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTGCCCGCCCTGCAGGCCTTCATCGGCAAGGACGGCACGGTCAGCGCCTTCGAGAACAAAc < 5:288527/147‑1 (MQ=255) | TATAATTTATAGCCTACAAGATAAACCAGGATAATACGACCGTCCGCAACAGTGCCGGCGTGATCCAGATCCGGCAAAAAGTCAGCAAATTTGCCATCATGTTGATTCCACCTGCGGAGATCATGGACATGCCGCTACGCCCCCTTTTCACCTCCCTGTTGCTGGTCGCCAGCCTCACCGCCCATGCCGCCACCGAGGTGGTGCCACTTCAGCATCGCAGCAGCGCCGAACTGCTGCCCGCCCTGCAGGCCTTCATCGGCAAGGACGGCACGGTCAGCGCCTTCGAGAACAAAC > NC_002947/4652170‑4652463 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |