New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5273028 | 43 (0.730) | 3 (0.050) | 3/244 | NT | 6.1% | coding (175/1125 nt) | rlmG | ribosomal RNA large subunit methyltransferase G |
? | NC_002947 | = 5273084 | 51 (0.920) | coding (231/1125 nt) | rlmG | ribosomal RNA large subunit methyltransferase G |
GACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAGGCCC > NC_002947/5272887‑5273176 | gACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCg > 6:349547/1‑148 (MQ=255) cTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAg > 5:110779/1‑149 (MQ=255) gATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGcc > 1:159346/1‑149 (MQ=255) gCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCa < 6:110779/149‑1 (MQ=255) cAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACCCGATCAGGCTCCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCTATGACCGCTTCGGTGCCCTGGCCGCCAGCCTTGCggg > 8:158998/1‑149 (MQ=255) gCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGcc < 5:190332/149‑1 (MQ=255) ggAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGc < 5:4800/149‑1 (MQ=255) cAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAggtgg > 4:72635/1‑149 (MQ=255) aaCGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTg < 2:112783/130‑1 (MQ=255) aaCGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTg > 1:112783/1‑130 (MQ=255) aaCGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAggtggt < 5:349547/149‑1 (MQ=255) cGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAggtggt > 2:91023/1‑147 (MQ=255) ccGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTcagcag > 4:310810/1‑149 (MQ=255) aGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTTCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGAc < 3:288594/149‑1 (MQ=255) aGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGAc > 3:357440/1‑149 (MQ=255) cTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCcaggtgcgagtcaccgctgctgaccacctgcagctggcctgcaaggcttgc > 4:213039‑M1/1‑98 (MQ=255) cGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCACTGACAGCTTCGGTGCCCAGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCAcc > 7:352198/1‑149 (MQ=255) tGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGg > 3:72635‑M2/1‑148 (MQ=255) ccgccgACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGgg > 3:310810‑M2/1‑146 (MQ=255) cgacgaGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGgggcacc > 5:147948‑M2/1‑142 (MQ=255) gacgaGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCt < 2:159346/149‑1 (MQ=255) cgaGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCcaggtgcgagtcaccgctgctgaccacctgcagctggcctgcaaggcttgcggccagggcaccgaa < 3:213039‑M1/149‑67 (MQ=255) gactaccTGCTTGCGCAGGTACACGATCAGGCACCCGACGGCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCcaggtgcgtgtcaccgctgctgaccacctgcagctggcctgcaaggcttgcggccagggcaccgaag < 8:130664‑M1/146‑68 (MQ=255) ccTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTg > 8:3452/1‑148 (MQ=255) cTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTg > 7:183462/1‑141 (MQ=255) cTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTg < 8:183462/141‑1 (MQ=255) cTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTgg > 7:233745/1‑148 (MQ=255) cTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCGCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTgg > 6:259728/1‑148 (MQ=255) aGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTg < 8:233745/149‑1 (MQ=255) cacGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGgcgcg > 3:57842/1‑149 (MQ=255) acGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGTAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGgcgcg > 4:350503/1‑148 (MQ=255) acGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGTAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGgcgcg > 4:345185/1‑148 (MQ=255) acGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGgcgcg > 8:192040/1‑148 (MQ=255) tCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAAt < 4:57842/148‑1 (MQ=255) tCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATg < 7:192040/149‑1 (MQ=255) ggCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGcc > 1:307697/1‑149 (MQ=255) cccGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTTGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGcc < 1:91023/149‑1 (MQ=255) ccGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCg > 8:79127/1‑149 (MQ=255) ccGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCg > 2:226935/1‑149 (MQ=255) ccGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCg > 2:342014/1‑149 (MQ=255) aaCTGGTGGTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTc < 2:287274/148‑1 (MQ=255) aaTGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAg > 2:189219/1‑149 (MQ=255) tGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGc > 5:368237/1‑148 (MQ=255) aGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGACAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAaca > 7:162755/1‑149 (MQ=255) cTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACACGCACCTGgggcaccgaagctgtcattgagcaccagtacccggcaattgccgtcgggtgcctgatcgtgtacctgcgcaagcaggtagtc < 8:130664‑M2/149‑83 (MQ=255) ttCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGgggcaccgaagctgtcattgagcaccagtacccggcaattggcgtcgggtgcctgatcgtgtagctgcgcaagcaggtactcg < 3:213039‑M2/149‑84 (MQ=255) tCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTgg > 3:84710/1‑149 (MQ=255) cGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAg < 7:29653/85‑1 (MQ=255) cGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAg > 8:29653/1‑85 (MQ=255) ggTGCCCcaggtgcgagtcaccgctgctgaccacctgcagctggcctgcaaggcttgcggccagggcaccgaagctgtcattgagcaccagtacccggcaattggcgtcgggtgcctgatcgtgtagctgcgcaagcaggtactcgtcg > 5:147948‑M1/1‑7 (MQ=255) ggTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGTAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGc < 3:345185/148‑1 (MQ=255) ggTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGTAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGc < 3:350503/148‑1 (MQ=255) cccaggtgcgagtcaccgctgctgaccacctgcagctggcctgcaaggcttgcggccagggcaccgaagctgtcattgagcaccagtacccggcaattggcgtcgggtgcctgatcgtgtagctgcgcaagcaggtactcgtcggcgg > 3:310810‑M1/1‑2 (MQ=255) ccaggtgcgagtcaccgctgctgaccacctgcagctggcctgcaaggcttgcggccagggcaccgaagctgtcattgagcaccagtacccggcaattggcgtcgggtgcctgatcgtgtagctgcgcaagcaggtactcgtcggcggca > 3:72635‑M1/1‑1 (MQ=255) | GACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTACACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCGCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGGCGCGCAATGGCCTGCCGTTCGACAGTGTGCCGTTCGTACCGGCCAGCGAACACTGGCAAGGCCC > NC_002947/5272887‑5273176 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |