New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5380510 | 48 (0.820) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 5.8% | coding (92/405 nt) | fur | ferric iron uptake global transcriptional repressor Fur |
? | NC_002947 | = 5380557 | 52 (0.920) | coding (45/405 nt) | fur | ferric iron uptake global transcriptional repressor Fur |
TCGAACACTGCATGACCGCCGTCGAAGTTGTGGCGAACCACCAGACCCGCCGCCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCATGGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGG > NC_002947/5380363‑5380657 | tCGAACACTGCATGACCGCCGTCGAAGTTGTGGCGAACCACCAGACCCGCCGCCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACg > 6:312/1‑149 (MQ=255) tCGAACACTGCATGACCGCCGTCGAAGTTGTGGCGAACCACCAGACCCGCCGCCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGAC > 3:112365‑M1/1‑148 (MQ=255) gAACACTGCATGACCGCCGTCGAAGTTGTGGCGAACCACCAGACCCGCCGCCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACg‑c < 8:305572/148‑1 (MQ=255) gAACACTGCATGACCGCCGTCGAAGTTGTGGCGAACCACCAGACCCGCCGCCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGAC < 4:112365‑M1/146‑1 (MQ=255) tGCATGACCGCCGTCGAAGTTGTGGCGAACCACCAGACCCGCCGCCGCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCgg > 3:321331/1‑149 (MQ=255) cATGACCGCCGTCGAAGTTGTGGCGAACCACCAGACCCGCCGCCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCCCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCgg > 2:278592/1‑147 (MQ=255) cgccgTCGAAGTTGTGGCGAACCACCAGACCCGCCGCCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTc > 2:26036/1‑148 (MQ=255) ccgTCGAAGTTGTGGCGAACCACCAGACCCGCCGCCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAg > 8:345803/1‑149 (MQ=255) gTTGTGGCGAACCACCAGACCCGCCGCCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTTACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGaa < 1:26036/149‑1 (MQ=255) gTTGTGGCGAACCACCAGACCCGCCGCCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGaa < 4:321331/149‑1 (MQ=255) ttGTGGCGAACCACCAGACCCGCCGCCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAg > 5:111374/1‑149 (MQ=255) cGAACCACCAGACCCGCCGCCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCtt < 5:144231/149‑1 (MQ=255) gAACCACCAGACCCGCCGCCTCGAACT‑GGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGa < 4:51206/149‑1 (MQ=255) caccaGACCCGCCGCCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACcctgcctcgagtcaagatccttcagatgctcgactctac > 4:124972‑M1/1‑110 (MQ=255) caccaGACCCGCCGCCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATc < 3:291159/142‑1 (MQ=255) caccaGACCCGCCGCCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATc > 4:291159/1‑142 (MQ=255) caGACCCGCCGCCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAg < 4:345768/149‑1 (MQ=255) aCCCGCCGCCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTc < 8:183150/143‑1 (MQ=255) aCCCGCCGCCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTc > 7:183150/1‑143 (MQ=255) ccgccgCCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGaa > 3:117554/1‑129 (MQ=255) ccgccgCCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGaa < 4:117554/129‑1 (MQ=255) ccgccgCCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAgg < 7:345803/149‑1 (MQ=255) ccgccgCCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAgg < 6:287736/149‑1 (MQ=255) cgccgcCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGg < 5:206229‑M2/149‑2 (MQ=255) gccTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACcctgcctcgagtcaagatccttcagatgctcgactctaccgagcagcgtcac < 3:124972‑M1/149‑53 (MQ=255) cTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCACCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACGTCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATGTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCAcc < 1:278592/149‑1 (MQ=255) gAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTTCACTCATGTGACcctgcctcgagtcaagatccttcagatgctcgactctaccgagcagcgtcacatga < 6:267817‑M1/148‑57 (MQ=255) gAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTga < 6:206229/149‑1 (MQ=255) gAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTga < 1:351509/149‑1 (MQ=255) gCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTg > 3:176689/1‑149 (MQ=255) gcgATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTgcgc > 8:291034/1‑148 (MQ=255) aTAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTGCGCAAtt < 6:111374/149‑1 (MQ=255) aTAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTGCGCAAtt < 5:291510/149‑1 (MQ=255) tAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTGCGCAATTc > 7:316690/1‑149 (MQ=255) aCGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGa > 6:101530/1‑111 (MQ=255) aCGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGa < 5:101530/111‑1 (MQ=255) ggTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAgg < 6:20575/111‑1 (MQ=255) ggTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAgg > 5:20575/1‑111 (MQ=255) gCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCt > 2:210373/1‑97 (MQ=255) gCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCt < 1:210373/97‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTGCGCAATTCGCTAtttt > 4:333188/1‑148 (MQ=255) tCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGCGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAAGGTCAGCtt > 3:210803/1‑149 (MQ=255) ccTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCATGGTCAGCTTTCTCGcc < 2:319055/149‑1 (MQ=255) tCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCATGGTCAGCTTTCTCGCCGAtgct > 6:95120/1‑149 (MQ=255) ttGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCaa > 4:13243/1‑115 (MQ=255) ttGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCaa < 3:13243/115‑1 (MQ=255) gACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCATGGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTtc > 1:90683/1‑149 (MQ=255) cATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCATGGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTtctc < 3:333188/149‑1 (MQ=255) aTCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCATGGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTctct > 5:244769/1‑149 (MQ=255) aTCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCATGGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTctct > 2:245188/1‑149 (MQ=255) ccTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCATgg > 6:309111/1‑111 (MQ=255) cACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCATGGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATAc < 1:245188/147‑1 (MQ=255) cACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCATGGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACgg < 8:316690/149‑1 (MQ=255) cTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCATGGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACggg > 7:82253/1‑148 (MQ=255) tCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGgtcacatgagtgaagaggatgtctacaaggcgctgatggaggctggcgaggatgtaggcctggccaccgtctatcgcgtgctgacccagttc < 6:267817‑M2/148‑93 (MQ=255) aTGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCATg < 6:3756/99‑1 (MQ=255) aTGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCATg > 5:3756/1‑99 (MQ=255) gtgACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGgtcacatgagtgcagaggatgtctacaaggcgctgatggaggctggcgaggatgtaggcctggccaccgtctatcgcgtgctgacccagttcgaggc < 3:124972‑M2/149‑98 (MQ=255) gtgACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCATGGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGAt > 2:340595/1‑149 (MQ=255) ccctgcctcgagtcaagatccttcagatgctcgactctaccgagcagcgtcacatgagtgcagaggatgtctacaaggcgctgatggaggctggcgaggatgtaggcctggccaccgtctatcgcgtgctgacccagttcgaggcggcg < 5:206229‑M1/149‑149 (MQ=255) | TCGAACACTGCATGACCGCCGTCGAAGTTGTGGCGAACCACCAGACCCGCCGCCTCGAACTGGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGCACTCATGTGACG‑CTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGAGGCAGGGTCACCTTGAGACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCATGGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGG > NC_002947/5380363‑5380657 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |