New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5474528 = | 49 (0.830) | 3 (0.050) | 3/244 | NT | 5.8% | coding (267/1272 nt) | proA | gamma‑glutamyl phosphate reductase |
? | NC_002947 | 5474579 = | 51 (0.920) | coding (216/1272 nt) | proA | gamma‑glutamyl phosphate reductase |
GCTGGCGGCATCAATGGTCACGTTCGGACGCGATTCATAGATGATCCCGATCACCCCCAGCGGGGTACGCATCTTGCCTACCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGCGGCCGGCGGCCAGGTCCAGCTCGTTGGCAGCGGTGAGCTCGGCACGGGCAGCATCCAGCGCGT > NC_002947/5474381‑5474676 | gCTGGCGGCATCAATGGTCACGTTCGGACGCGATTCATAGATGATCCCGATCACCCCCAGCGGGGTACGCATCTTGCCTACCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCt > 4:219208/1‑149 (MQ=255) gccgtgccagcaccgcgcagaagaaccgcgccctgcaagccgccgccgccgcgctggatgctgcccgtgccgagctcaccgctgccaacgagctggacctggccgccggccgcgccagtggcctggagcccgcactgctcgatcgtCTg < 3:240962‑M1/3‑1 (MQ=255) cggcATCAATGGTCACGTTCGGACGCGATTCATAGATGATCCCGATCACCCCCAGCGGGGTACGCATCTTGCCTACCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGgcgc < 4:139037/149‑1 (MQ=255) aTGGTCACGTTCGGACGCGATTCATAGATGATCCCGATCACCCCCAGCGGGGTACGCATCTTGCCTACCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGt > 5:128805/1‑149 (MQ=255) cGTTCGGACGCGATTAATAGATGAGCCCTATCTCCGCCAGCGGGGTACGCATCTTGCCTACCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATTGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATg < 6:263246/149‑1 (MQ=255) cgATTCATAGATGATCCCGATCACCCCCAGCGGGGTACGCATCTTGCCTACCTGAATGCCCGATGGACGGTATCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATAc < 7:155902/149‑1 (MQ=255) aTAGATGATCCCGATCACCCCCAGCGGGGTACGCATCTTGCCTACCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCg > 8:126829/1‑149 (MQ=255) atgatCCCGATCACCCCCAGCGGGGTACGCATCTTGCCTACCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGt > 8:325921/1‑149 (MQ=255) gatCCCGATCACCCCCAGCGGGGTACGCATCTTGCCTACCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGt > 5:14557/1‑147 (MQ=255) gATCACCCCCAGCGGGGTACGCATCTTGCCTACCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCa < 3:304437/149‑1 (MQ=255) cgcgctggatgctgcccgtgccgagctcaccgctgccaacgagctggacctggccgccggccgcgccagtggcctggagcccgcactgctcgatcgtCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGa > 6:49973‑M1/98‑149 (MQ=255) cACCCCCAGCGGGGTACGCATCTTGCCTACCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGa < 2:350412/148‑1 (MQ=255) ccccAGCGGGGTACGCATCTTGCCTACCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGAt > 3:175828/1‑149 (MQ=255) ccccAGCGGGGTACGCATCTTGCCTACCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGAt > 5:378378/1‑149 (MQ=255) ccccAGCGGGGTACGCATCTTGCCTACCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGAt > 3:310269/1‑149 (MQ=255) ccAGCGGGGTACGCATCTTGCCTACCTGAATGCCCGTTGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATc > 1:247884/1‑148 (MQ=255) cAGCGGGGTACGCATCTTGCCTACCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGa < 7:325921/149‑1 (MQ=255) aGCGGGGTACGCATCTTGCCTACCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAg < 6:14557/149‑1 (MQ=255) tACGCATCTTGCCTACCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCg > 4:316764/1‑149 (MQ=255) cTTGCCTACCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTc > 6:334580/1‑147 (MQ=255) ttGCCTACCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAg > 4:70946/1‑149 (MQ=255) gCCTACCGGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGa > 6:209082/1‑131 (MQ=255) gCCTACCGGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGa < 5:209082/131‑1 (MQ=255) ccTACCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGc < 3:70946/148‑1 (MQ=255) cTACCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCAt > 4:126889/1‑91 (MQ=255) cTACCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGTCAGACGATc < 3:330130/127‑1 (MQ=255) cTACCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGTCAGACGATc > 4:330130/1‑127 (MQ=255) aCCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACt > 4:212213/1‑149 (MQ=255) ccTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCAc < 3:219208/147‑1 (MQ=255) ccTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCAc < 7:126829/147‑1 (MQ=255) cTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTgg > 4:240962/1‑149 (MQ=255) caacgagctggacctggccgccggccgcgccagtggcctggagcccgcactgctcgatcgtCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAg > 6:68920‑M1/62‑112 (MQ=255) caacgagctggacctggccgccggccgcgccagtggcctggagcccgcactgctcgatcgtCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAg < 5:68920‑M1/51‑1 (MQ=255) gCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGcggc > 5:358573/1‑149 (MQ=255) gCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGcggc > 7:93395/1‑149 (MQ=255) ccGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCTGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGcggccg > 1:156146/1‑149 (MQ=255) cGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGcggccgg < 6:358573/149‑1 (MQ=255) aTGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCCCCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGCGGCcggcg > 6:272346/1‑149 (MQ=255) aTGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGCGGCcggcg < 8:93395/149‑1 (MQ=255) tAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCg < 1:219758/114‑1 (MQ=255) tAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCg > 2:219758/1‑114 (MQ=255) tAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGCGGCCGGCGGCCAGGTc < 2:247884/149‑1 (MQ=255) cTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGCGGCCGGCGGCCAGGTCCAg > 8:105083/1‑149 (MQ=255) aTGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGCGGCCGGCGGCCAGGTCCAGCTc > 6:206778/1‑149 (MQ=255) aTGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGCGGCCGGCGGCCAGGTCCAGCTc < 5:206778/149‑1 (MQ=255) tCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGCGGCCGGCGGCCAGGTCCAGCTCGtt < 6:128805/149‑1 (MQ=255) gcgGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCTGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGCGGCCGGCGGCCAGGTCCAGCTCGTTgg < 2:156146/149‑1 (MQ=255) cACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGCGGCCGGCGGCCAGGTCCAGCTCGTTGGCAGCGGTg < 3:212213/149‑1 (MQ=255) aCCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGCGGCCGGCGGCCAGGTCCAGCTCGTTGGCAGCGGt > 4:328807/1‑147 (MQ=255) cGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGCGGCCGGCGGCCAGGTCCAGCTCGTTGGCAGCGGTGAGc > 2:23696/1‑149 (MQ=255) ggTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGCGGCCGGCGGCCAGGTCCAGCTCGTTGGCAGCGGTGAGCt > 5:244098/1‑144 (MQ=255) ggTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGCGGCCGGCGGCCAGGTCCAGCTCGTTGGCAGCGGTGAGCt < 6:244098/144‑1 (MQ=255) tCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGCGGCCGGCGGCCAGGTCCAGCTCGTTGGCAGCGGTGAGCTCGGCACg < 1:23696/149‑1 (MQ=255) aGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGCGGCCGGCGGCCAGGTCCAGCTCGTTGGCAGCGGTGAGCTCGGCACGGgcagc < 3:316764/149‑1 (MQ=255) gCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGCGGCCGGCGGCCAGGTCCAGCTCGTTGGCAGCGGTGAGCTCCGCACGGGCAGCATCCAg > 8:329883/1‑149 (MQ=255) ccACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGCGGCCGGCGGCCAGGTCCAGCTCGTTGGCAGCGGTGAGCTCGGCACGGGCAGCATCCAgc > 3:156229/1‑149 (MQ=255) CTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGTCGCGGCCGGCGGCCAGGTCCAGCTCGTTGGCAGCGGTGAGCTCGGCACGGGCAGCATCCa < 2:218860‑M1/143‑1 (MQ=255) CTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGTCGCGGCCGGCGGCCAGGTCCAGCTCGTTGGCAGCGGTGAGCTCGGCACGGGCAGCATCCa > 1:218860‑M1/1‑143 (MQ=255) CTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGCGGCCGGCGGCCAGGTCCAGCTCGTTGGCAGCGGTGAGCTCGGCACGGGCAGCATCCAGCGCGt > 3:328807‑M1/1‑149 (MQ=255) | GCTGGCGGCATCAATGGTCACGTTCGGACGCGATTCATAGATGATCCCGATCACCCCCAGCGGGGTACGCATCTTGCCTACCTGAATGCCCGATGGACGGTAGCTCATGTCGCGGATGGCACCGACTGGGTCCGGCAGGCTGGCCACCTGGCGCAAGCCGGTGATCATGCCGTCGATACGCGCCGGGGTCAGCGCCAGACGATCGAGCAGTGCGGGCTCCAGGCCACTGGCGCGGCCGGCGGCCAGGTCCAGCTCGTTGGCAGCGGTGAGCTCGGCACGGGCAGCATCCAGCGCGT > NC_002947/5474381‑5474676 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |