New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5797718 | 55 (0.930) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 7.1% | coding (182/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
? | NC_002947 | = 5797772 | 52 (0.930) | coding (128/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
GATCTCGCGGTCCATGTTGGCGCGGGCAGCTTCGGCTTTGACCGGGTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTGCAGAAGGTGGTGGCTCGGCTCACCCGTCATATGGGCGATCAGGCCAAAACCACAGTTGTCCTT > NC_002947/5797570‑5797866 | gATCTCGGGGTCCATGTTGGCGCGGGCAGCTTCGGCTTTTACCGGGTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGA < 5:29718‑M1/149‑1 (MQ=255) gcgGTCCATGTTGGCGCGGGCAGCTTCGGCTTTGACCGGGTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAg < 3:220582/144‑1 (MQ=255) gcgGTCCATGTTGGCGCGGGCAGCTTCGGCTTTGACCGGGTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAg < 8:295343/144‑1 (MQ=255) gcgGTCCATGTTGGCGCGGGCAGCTTCGGCTTTGACCGGGTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGAc > 5:2828/1‑149 (MQ=255) gTTGGCGCGGGCAGCTTCGGCTTTGACCGGGTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCATACCGCAACCGt > 6:163725/1‑149 (MQ=255) cgcgGGCAGCTTCGGCTTTGACCGGGTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCg < 6:2828/149‑1 (MQ=255) atctaGCTTCGGCTTTGACCGGGTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGATCAGACCGCAACCGTCACCGGTc < 7:235221/145‑1 (MQ=255) gCAGCTTCGGCTTTGACCGGGTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCtt > 1:5752/1‑149 (MQ=255) gCTTCGGCTTTGACCGGGTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTc > 8:235221/1‑144 (MQ=255) cGGCTTTGACCGGGTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAcccaccgcggcggcatcaatgccgacggc > 2:29030‑M1/1‑117 (MQ=255) gCTTTGACCGGGTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCCCCGGTCTTGCCGTCgg > 6:173991/1‑148 (MQ=255) tttGACCGGGTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCAt > 1:38125/1‑149 (MQ=255) tttGACCGGGTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGA < 4:51415‑M1/113‑1 (MQ=255) tttGACCGGGTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGA > 3:51415‑M1/1‑113 (MQ=255) tttGACCGGGTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGACATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATTAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTATTGCCGTCGGcct > 8:327796/1‑147 (MQ=255) gACCGGGTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGa > 4:24308/1‑149 (MQ=255) aCCGGGTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGATGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGcc < 7:162068/137‑1 (MQ=255) aCCGGGTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGATGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGcc > 8:162068/1‑137 (MQ=255) aCCGGGTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGAt > 5:244701/1‑149 (MQ=255) cGGGTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATgc > 4:128924/1‑149 (MQ=255) gggTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGa > 7:293011/1‑145 (MQ=255) gggTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGa < 8:293011/145‑1 (MQ=255) gTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATgccgc > 2:67350/1‑149 (MQ=255) ccTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACTGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGccgccg < 6:48294/149‑1 (MQ=255) cTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGTGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATCAATGccgacg < 7:327796/148‑1 (MQ=255) cTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCcgccgc < 6:244701/149‑1 (MQ=255) gaagaaCACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTgg < 8:228138/148‑1 (MQ=255) gaaCACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGtca < 2:204716‑M2/149‑4 (MQ=255) aaCACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGtcat > 4:129659‑M2/1‑145 (MQ=255) cATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTcatgcatg > 3:368511/1‑149 (MQ=255) aTGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAcccaccgcggcggcatcaatgccgacggcaagaccggtgacggttgcggtctgctcatgcagaa < 1:29030‑M1/149‑65 (MQ=255) tGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTc < 3:24308/149‑1 (MQ=255) tGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTc < 2:38125/149‑1 (MQ=255) ggCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCAt < 6:161140/113‑1 (MQ=255) gTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTgg < 5:223568/127‑1 (MQ=255) gTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTgg > 6:223568/1‑127 (MQ=255) gTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCa < 3:128924/149‑1 (MQ=255) tACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCAt < 1:67350/149‑1 (MQ=255) cTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCa < 4:368511/148‑1 (MQ=255) gggCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGtt < 2:5752/148‑1 (MQ=255) aGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTg > 1:252072/1‑146 (MQ=255) tCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGACAGTTTGCAGAAg > 6:69547/1‑149 (MQ=255) gACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAcccaccgcggcggcatcaatgccgacggcaagaccggtgacggttgcggtctgctcatgc > 3:51583‑M1/1‑56 (MQ=255) gACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAcccaccgcggcggcatcaatgccgacggcaagaccggtgacggttgcggtctgctcatgc < 4:51583‑M1/116‑61 (MQ=255) aGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCAt > 7:222488/1‑129 (MQ=255) aGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCAt < 8:222488/129‑1 (MQ=255) aGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTGCAGAAggtggt > 4:212656/1‑149 (MQ=255) aGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTGCAGAAggtggt < 3:212656/149‑1 (MQ=255) gCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTGCAGAAGgtggtg < 1:146211/149‑1 (MQ=255) cTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTGCAGAAGGTGGTggctcgg < 2:168764/144‑1 (MQ=255) cTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTGCAGAAGGTGGTggctcgg > 1:168764/1‑144 (MQ=255) ccATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTGCAGAAg < 4:297135/127‑1 (MQ=255) ccATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTGCAGAAg > 3:297135/1‑127 (MQ=255) ccATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTGCAGAAGGTGGTGGCTCGGCTCACCCGt > 4:57443/1‑148 (MQ=255) ccATGGAACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATTAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTATTGACGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTGCATAAGGTGGTGGCTCGGCTCACCCGt > 6:168112/1‑148 (MQ=255) cATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTGCAGAAGGTGGTGGCTCGGCTCACCCGTCa < 3:57443/149‑1 (MQ=255) aTGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTGCAGAAGGTGGTGGCTCGGCTCACCCGTCat < 2:252072/149‑1 (MQ=255) cACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTGCAGAAGGTGGTGGCTCGGCTCACCCGTCATATgg > 4:268590/1‑149 (MQ=255) gCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTGCAGAAGGTGGTGGCTCGGCTCACCCGTCATATGGGc > 7:143454/1‑148 (MQ=255) gCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTGCAGAAGGTGGTGGCTCGGCTCACCCGTCATATGGGc > 8:327846/1‑148 (MQ=255) gAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGACAGTTTGCAGAAGGTGGTGGCTCGGCTCACCCGTCATATGGGCGATCa < 5:69547/149‑1 (MQ=255) aaTTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTGCAGAAGgtggtg < 8:98924/119‑1 (MQ=255) aaTTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTGCAGAAGgtggtg > 7:98924/1‑119 (MQ=255) ggCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTGCAGAAGGTGGTGGCTCGGCTCACCCGTCATATGGGCGATCAGGCCAAAAc > 4:138262/1‑148 (MQ=255) gCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTGCAGAAGGTGGTGGCTCGGCTCACCCGTCATATGGGCGATCAGGCCAAAACca < 7:327846/149‑1 (MQ=255) ttCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGtcatgcagaagcccgatcaattcctgcgtgccatggcccaggagcacttcgctgtcgagctgcccaagcagtacgccgtcggcat < 1:29030‑M2/149‑86 (MQ=255) ttCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTGCAGAAGGTGGTGGCTCGGCTCACCCGTCATATGGGCGATCAGGCCAAAACca > 2:316930/1‑147 (MQ=255) gCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGtcatgcagaagcccgatcaattcctgcgtgccatggcccaggagcacttcgctgtc > 3:51583‑M2/1‑60 (MQ=255) gCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGtcatgcagaagcccgatcaattcctgcgtgccatggcccaggagcacttcgctgtc < 4:51583‑M2/116‑57 (MQ=255) aTGAcccaccgcggcggcatcaatgccgacggcaagaccggtgacggttgcggtctgctcatgcagaagcccgatcaattcctgcgtgccatggcccaggagcacttcgctgtcgagctgcccaagcagtacgccgtcggcatggtgtt > 4:129659‑M1/1‑4 (MQ=255) tGAcccaccgcggcggcatcaatgccgacggcaagaccggtgacggttgcggtctgctcatgcagaagcccgatcaattcctgcgtgccatggcccaggagcacttcgctgtcgagctgcccaagcagtacgccgtcggcatggtgttc < 2:204716‑M1/149‑147 (MQ=255) tGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTGCAGAAGGTGGTGGCTCGGCTCACCCGTCATATGGGCGATCAGGCCAAAACCACAGTTGTcc < 3:138262/149‑1 (MQ=255) aGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTGCAGAAGGTGGTGGCTCGGCTCACCCGTCATATGGGCGATCAGGCCAAAACCACAGTTGTCCtt < 1:204716/149‑1 (MQ=255) | GATCTCGCGGTCCATGTTGGCGCGGGCAGCTTCGGCTTTGACCGGGTCCTGGTTGAAGAACACCATGCCGACGGCGTACTGCTTGGGCAGCTCGACAGCGAAGTGCTCCTGGGCCATGGCACGCAGGAATTGATCGGGCTTCTGCATGAGCAGACCGCAACCGTCACCGGTCTTGCCGTCGGCATTGATGCCGCCGCGGTGGGTCATGCATGTCAGCGCCTGCATGGCAGTTTGCAGAAGGTGGTGGCTCGGCTCACCCGTCATATGGGCGATCAGGCCAAAACCACAGTTGTCCTT > NC_002947/5797570‑5797866 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |