| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5882284 = | 58 (0.990) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 5.4% | coding (845/1230 nt) | serA | bifunctional D‑3‑phosphoglycerate dehydrogenase/alpha‑ketoglutarate reductase |
| ? | NC_002947 | 5882314 = | 49 (0.870) | coding (875/1230 nt) | serA | bifunctional D‑3‑phosphoglycerate dehydrogenase/alpha‑ketoglutarate reductase | |||||
TCCTGATCAACGCCGCCCGTGGCACCGTGGTCGAGCTGGACCACCTGGCCGCTGCCATCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTGGAAGTGGCCGAGAAACTGGTCAAGTACAGCGACAACGGTACCTCGGTGTCCTCGGTCAACTTCCCGGAAGTGG > NC_002947/5882140‑5882430 | tCCTGATCAACGCCGCCCGTGGCACCGTGGTCGAGCTGGACCACCTGGCCGCTGCCATCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGc < 3:278294/149‑1 (MQ=255)tCCTGATCAACGCCGCCCGTGGCACCGTGGTCGAGCTGGACCACCTGGCCGCTGCCATCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGc < 2:190859/149‑1 (MQ=255) gacggtgtttgcctgggtgcgctggcagggccacttccgggaagttgaccgaggacaccgaggtaccgttgtcgctgtacttgaccagtttctcggccacttccaggccgatgttggcctgggcttcggcggtggaaccaccaatgtG‑c > 7:91928‑M1/148‑149 (MQ=255) tGATCAACGCCGCCCGTGGCACCGTGGTCGAGCTGGACCACCTGGCCGCTGCCATCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTc > 5:346925/1‑149 (MQ=255) ggtgtttgcctgggtgcgctggcagggccacttccgggaagttgaccgaggacaccgaggtaccgttgtcgctgtacttgaccagtttctcggccacttccaggccgatgttggcctgggcttcggcggtggaaccaccaatgtG‑CGGc < 3:357803‑M1/5‑1 (MQ=255) aTCAACGCCGCCCGTGGCACCGTGGTCGAGCTGGACCACCTGGCCGCTGCCATCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTc < 7:106940/147‑1 (MQ=255) aTCAACGCCGCCCGTGGCACCGTGGTCGAGCTGGACCACCTGGCCGCTGCCATCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTc < 6:302200/147‑1 (MQ=255) cgccgcCCGGGGCACCGCGCGCGAGCTGCACCACCTGGCCGCTCCCATCAACGACCAGCACCCGATCGGCGCCGCCATCGCCGTGCGCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGCCGAGC‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTCCG‑CGGC‑CTCGACAACg < 6:119688/149‑1 (MQ=255) ccGTGGCACCGTGGTCGAGCTGGACCACCTGGCCGCTGCCATCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATcc > 5:304000/1‑149 (MQ=255) cGTGGCACCGTGGTCGAGCTGGACCACCTGGCCGCTGCCATCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCt < 7:49780/149‑1 (MQ=255) tgcgctggcagggccacttccgggaagttgaccgaggacaccgaggtaccgttgtcgctgtacttgaccagtttctcggccacttccaggccgatgttggcctgggcttcggcggtggaaccaccaatgtG‑Cg < 3:212820‑M1/3‑1 (MQ=255) tgcgctggcagggccacttccgggaagttgaccgaggacaccgaggtaccgttgtcgctgtacttgaccagtttctcggccacttccaggccgatgttggcctgggcttcggcggtggaaccaccaatgtG‑Cg > 4:212820‑M1/131‑133 (MQ=255) gTGGCACCGTGGTCGAGCTGGACCACCTGGCCGCTGCCATCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCCAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑CCCCGCTGCG‑CGGG‑CTCGACAACGTGATCCTg > 5:40434/1‑149 (MQ=255) cGTGGTCGAGCTGGACCACCTGGCCGCTGCCATCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGAcgccg > 6:194779/1‑148 (MQ=255) gAGCTGGACCACCTGGCCGCTGCCATCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATtg < 6:346925/148‑1 (MQ=255) gAGCTGGACCACCTGGCCGCTGCCATCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATtg < 6:230404/148‑1 (MQ=255) aGCTGGACCACCTGGCCGCTGCCATCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGTACATtggt < 5:194779/149‑1 (MQ=255) aGCTGGACCACCTGGCCGCTGCCATCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATtggt > 2:16732/1‑149 (MQ=255) aGCTGGACCACCTGGCCGCTGCCATCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATtggt < 7:102266/149‑1 (MQ=255) aGCTGGACCACCTGGCCGCTGCCATCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATtggt > 5:255376/1‑149 (MQ=255) ccgggaagttgaccgaggacaccgaggtaccgttgtcgctgtacttgaccagtttctcggccacttccaggccgatgttggcctgggcttcggcggtggaaccaccaatgtG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATtgg > 4:357803‑M1/112‑148 (MQ=255) accaccTGGCCGCTGCCATCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTcc < 1:16732/149‑1 (MQ=255) ccaccTGGCCGCTGCCATCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGAt > 7:19236/1‑123 (MQ=255) ccaccTGGCCGCTGCCATCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGAt < 8:19236/123‑1 (MQ=255) ccGCTGCCATCAAGGACAAGCACCTGAGCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCGCGGTCGAGCCAGGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGATA‑‑‑GCCGGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGACGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGaa < 5:281110/149‑1 (MQ=255) ccgaggacaccgaggtaccgttgtcgctgtacttgaccagtttctcggccacttccaggccgatgttggcctgggcttcggcggtggaaccaccaatgtG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGcac < 6:202050‑M1/32‑1 (MQ=255) ccgaggacaccgaggtaccgttgtcgctgtacttgaccagtttctcggccacttccaggccgatgttggcctgggcttcggcggtggaaccaccaatgtG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGcac > 5:202050‑M1/100‑131 (MQ=255) ccATCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCGACGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑ccc < 1:287104/148‑1 (MQ=255) aTCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGc > 3:252872/1‑149 (MQ=255) aTCAAGGACAAGCAACTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGCTCCACGCTACAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCACGCAGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCCCCGACGAAG‑CCCATGc > 8:54197/1‑149 (MQ=255) tCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACAt > 5:125039/1‑121 (MQ=255) tCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACAt < 6:125039/121‑1 (MQ=255) ggACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGATACGGCCCATCCG‑CGTCGCTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGc > 1:115005/1‑148 (MQ=255) aCAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATc > 1:103111/1‑149 (MQ=255) aCAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATc > 5:317866/1‑149 (MQ=255) cAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCg < 6:317866/149‑1 (MQ=255) cAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCg < 2:102398/149‑1 (MQ=255) aaGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCgg > 2:38815/1‑149 (MQ=255) ccTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTg > 1:178442/1‑148 (MQ=255) tGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTg > 2:355722/1‑146 (MQ=255) tGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTg < 1:355722/146‑1 (MQ=255) cGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTGGAAGTgg > 3:330602/1‑149 (MQ=255) ccgccATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGTGTCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTGGAAGTGGcc > 1:86304/1‑147 (MQ=255) ccgccATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAGCCCCAGGCCAACATCGGCCTGGAAGTGGCCga < 1:38815/149‑1 (MQ=255) ccgccATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTGGAAGTGGCCgag < 5:38895/149‑1 (MQ=255) ccATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTAGAAGTGGCCGAGaaa > 8:99530/1‑149 (MQ=255) aTCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATtggt > 2:292842/1‑96 (MQ=255) aTCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATtggt < 1:292842/96‑1 (MQ=255) cGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCg > 7:127296/1‑125 (MQ=255) cGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCg < 8:127296/125‑1 (MQ=255) aCGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTGGAAGTGGCCGAGAAACTGGTc < 2:178442/149‑1 (MQ=255) aCGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTGGAAGTGGCCGAGAAACTGGTc < 4:252872/149‑1 (MQ=255) ccGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTGGAAGTGGCCGAGAAACTGGTCAAGTACa < 6:255376/148‑1 (MQ=255) ccGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTGGAAGTGGCCGAGAAACTGGTCAAGTACAg > 3:89476/1‑149 (MQ=255) cGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTGGAAGTGGCCGAGAAACTGATCAAGTACAGc < 2:115005/149‑1 (MQ=255) ccACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTGGAAGTGGCCGAGAAACTGGTCAAGTACAGCGACAACgg > 8:291319/1‑149 (MQ=255) ccACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTGGAAGTGGCCGAGAAACTGGTCAAGTACAGCGACAACgg > 1:18473/1‑149 (MQ=255) cGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTGGAAGTGGCCGAGAAACTGGTCAAGTACAGCGACAACGGTAc < 2:18473/149‑1 (MQ=255) tCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTGGAAGTGGCCGAGAAACTGGTCAAGTACAGCGACAACGGTACCTc > 2:173257/1‑149 (MQ=255) cAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGGG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTGGAAGTGGCCGAGAAACTGGTCAAGTACAGCGACAACGGTACCTCg < 6:40434/148‑1 (MQ=255) cAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTGGAAGTGGCCGAGAAACTGGTCAAGTACAGCGACAACGGTACCTCgg > 6:108625/1‑149 (MQ=255) aaCGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTGGAAGTGGCCGAGAAACTGGTCAAGTACAGCGACAACGGTACCTCGgt < 7:188686/149‑1 (MQ=255) gaAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATcc > 4:196666/1‑43 (MQ=255) gaAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATcc < 3:196666/43‑1 (MQ=255) t‑tCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTAGAAGTGGCCGAGAAACTGGTCAAGTACAGCGACAACGGTACCTCGGTGTCCTCGGTCaa < 7:99530/149‑1 (MQ=255) gaga‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTGGAAGTGGCCGAGAAACTGGTCAAGTACAGCGACAACGGTACCTCGGTGTCCTCGGTCAACtt > 2:31138/1‑149 (MQ=255) cGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTGGAAGTGGCCGAGAAACTGGTCAAGTACAGCGACAACGGTACCTCGGTGTCCTCGGTCAACTTCCCGGaa < 5:108625/149‑1 (MQ=255) cTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTGGAAGTGGCCGAGAAACTGGTCAAGTACAGCGACAACGGTACCTCGGTGTCCTCGGTCAACTTCCCGGAAGt < 7:291319/149‑1 (MQ=255) cTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTGGAAGTGGCCGAGAAACTGGTCAAGTACAGCGACAACGGTACCTCGGTGTCCTCGGTCAACTTCCCGGAAGt < 2:103111/149‑1 (MQ=255) cg‑cgGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTGGAAGTGGCCGAGAAACTGGTCAAGTACAGCGACAACGGTACCTCGGTGTCCTCGGTCAACTTCCCGGAAGTgg < 2:86304/148‑1 (MQ=255) | TCCTGATCAACGCCGCCCGTGGCACCGTGGTCGAGCTGGACCACCTGGCCGCTGCCATCAAGGACAAGCACCTGATCGGCGCCGCCATCGACGTGTTCCCGGTCGAGCCACGCTCCAACGACGAAGAGT‑TCGAGA‑‑‑GCCCGCTGCG‑CGGC‑CTCGACAACGTGATCCTGACGCCGCACATTGGTGGTTCCACCGCCGAAG‑CCCAGGCCAACATCGGCCTGGAAGTGGCCGAGAAACTGGTCAAGTACAGCGACAACGGTACCTCGGTGTCCTCGGTCAACTTCCCGGAAGTGG > NC_002947/5882140‑5882430 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |