New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2115901 | 57 (0.970) | 3 (0.050) | 3/244 | NT | 5.0% | coding (1421/1806 nt) | PP_1883 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2115920 | 60 (1.080) | coding (1440/1806 nt) | PP_1883 | hypothetical protein |
ACACGCCTGTTCACGGTGCCGCGGTCGGCCATGGCCGCCAATCTGGGTAGACGTCTGTGGGTGTACTACACCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTCATGGCAGAAGGGCAATTGCTGGGTATCGAGGCGCTAGGCCGTT > NC_002947/2115780‑2116068 | acacGCCTGTTCACGGTGCCGCGGTCGGCCATGGCCGCCAATCTGGGTAGACGTCTGTGGGTGTACTACACCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTa > 4:338912/1‑149 (MQ=255) cacGCCTGTTCACGGTGCCGCGGTCGGCCATGGCCGCCAATCTGGGTAGACGTCTGTGGGTGTACTACACCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTAc < 3:338912/149‑1 (MQ=255) gCCTGTTCACGGTGCCGCGGTCGGCCATGGCCGACAATCTGGGTAGACGTCTGTGGGTGTACTACACCG‑TCACCCGCGCCGGA‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTAcc < 8:244436/147‑1 (MQ=255) cTGTTCACGGTGCCGCGGTCGGCCATGGCCGCCAATCTGGGTAGACGTCTGTGGGTGTACTACACCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAGCCTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGa < 1:252957/149‑1 (MQ=255) tGTTCACGGTGCCGCGGTCGGCCATGGCCGCCAATCTGGGTAGACGTCTGTGGGTGTACTACACCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGAt > 1:306439/1‑148 (MQ=255) ttCACGGTGCCGCGGTCGGCCATGGCCGCCAATCTGGGTAGACGTCTGTGGGTGTACTACACCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAAt > 7:208661/1‑149 (MQ=255) cACGGTGCCGCGGTCGGCCATGGCCGCCAATCTGGGTAGACGTCGGTGGGTGTACTACACCG‑TCACCCGCGCCGTC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAAtt < 7:154174/148‑1 (MQ=255) tgTGCGGGGGTCTGCGATTGCCGGCAATCTGGGTAGACGTCTGTGGGTGTACTACACCG‑TCACCCGGGCTGGA‑‑‑GAAACGGGACGCAGATGTGTATAGTTCTAG‑CTGCGTGTAAGTGATTTCGATCAGCGCAGCTAGCCGTTAAttgt < 2:306439/146‑3 (MQ=255) ccGCGGTCGGCCATGGCCGCCAATCTGGGTAGACGTCTGTGGGTGTACTACACCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCg > 4:303284/1‑148 (MQ=255) gcgGTCGGCCATGGCCGCCAATCTGGGTAGACGTCTGTGGGTGTACTACACCGTTCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CGGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCACCTACCCGATAATTCAGGACg > 1:283365/1‑147 (MQ=255) gcgGTCGGCCATGGCCGCCAATCTGGGTAGACGTCTGTGGGTGTACTACACCG‑TCACCCGCGCCGGCGAGGAAACGCCACGCACATGAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCGACCCGATTATTCAGGGCg > 1:111437/1‑149 (MQ=255) ccATGGCCGCCAATCTGGGTAGACGTCTGTGGGTGTACTACACCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGcc > 3:207164/1‑146 (MQ=255) cgccAATCTGGGTAGACGTCTGTGGGTGTACTACACCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCgg > 6:15495/1‑148 (MQ=255) ccAATCTGGGTAGACGTCTGTGGGTGTACTACACCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGaa < 6:286885/149‑1 (MQ=255) gggTAGACGTCTGTGGGTGTACTACACCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGaa > 5:156355/1‑142 (MQ=255) gggTAGACGTCTGTGGGTGTACTACACCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGaa < 6:156355/142‑1 (MQ=255) ggTAGACGTCTGTGGGTGTACTACACCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGaa < 3:303284/146‑1 (MQ=255) tAGACGTCTGTGGGTGTACTACACCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTg > 6:121754/1‑148 (MQ=255) gTCTGTGGGTGTACTACACCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAg > 2:65300/1‑149 (MQ=255) gtgGGTGTACTACACCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTc > 7:16586/1‑149 (MQ=255) ctacACCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGGGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAgtgggtg < 2:283365/149‑1 (MQ=255) ctacACCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAgtgggtg > 4:263314/1‑149 (MQ=255) ctacACCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAgtgggtg < 2:111437/149‑1 (MQ=255) tacACCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAgtgggtgg > 2:327617/1‑149 (MQ=255) tacACCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAgtgggtgg > 5:27730/1‑149 (MQ=255) acacCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCCAGAACCGGGAATTGAAACTGCTTGAGGTTCCAGTGGGTGgc > 3:263774/1‑149 (MQ=255) cacCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGgcg > 5:10231/1‑149 (MQ=255) acCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAg < 2:344704/93‑1 (MQ=255) acCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAg > 1:344704/1‑93 (MQ=255) acCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGgcgc > 5:347084/1‑149 (MQ=255) g‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCttt < 5:121754/149‑1 (MQ=255) tCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCAGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTtg < 4:81927/149‑1 (MQ=255) ccGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCa > 7:45966/1‑149 (MQ=255) ccGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCa > 2:21966/1‑149 (MQ=255) ccGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCa > 3:41467/1‑149 (MQ=255) c‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCtt > 5:334285/1‑149 (MQ=255) aaCGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCttttt < 8:45966/149‑1 (MQ=255) gCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTAGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATCAGGTTCCAGTGGGTGgcg > 3:167097/1‑125 (MQ=255) gCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTc < 4:207164/149‑1 (MQ=255) gCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTAGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTc < 1:28772/149‑1 (MQ=255) acaTCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCgg > 4:306302/1‑84 (MQ=255) acaTCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCgg < 3:306302/84‑1 (MQ=255) acaTCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCttttt < 5:193852/139‑1 (MQ=255) acaTCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCttttt > 6:193852/1‑139 (MQ=255) aTCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTCATgg < 1:65300/149‑1 (MQ=255) aTCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTCATgg < 6:10231/149‑1 (MQ=255) gAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTCATGGCAg > 8:346381/1‑148 (MQ=255) aaaaGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTCATGGCAg > 4:129675/1‑147 (MQ=255) aaGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTCATGGCAGAAgg < 8:16586/149‑1 (MQ=255) ttCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGcgcagctcgaacttttctgatgtgcgtggcgtttcgccggcgcgggtgacggtgtagtacacccacagacgtctacccagattggcggccatggccgaccgcggcaccgtgaacagccg < 8:130566‑M2/149‑120 (MQ=255) gCGGGTAAGCGATTTCGATCAGcgcagctcgaacttttctgatgtgcgtggcgtttcgccggcgcgggtgacggtgtagtacacccacagac > 2:317924‑M2/1‑22 (MQ=255) gCGGGTAAGCGATTTCGATCAGcgcagctcgaacttttctgatgtgcgtggcgtttcgccggcgcgggtgacggtgtagtacacccacagac < 1:317924‑M2/92‑71 (MQ=255) gCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTCCACGCTGCCTTTTTGGAGGTTCATGGCAGAAGGGCAATTGCTgg > 4:210433/1‑149 (MQ=255) cGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTCATGGCAGAAGGGCAATTGCTggg < 6:334285/149‑1 (MQ=255) cGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTCATGGCAGAAGGGCAATTGCTgg < 6:27730/148‑1 (MQ=255) aaGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTCAt < 1:109893/123‑1 (MQ=255) aaGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTCAt > 2:109893/1‑123 (MQ=255) cGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTCATGGCAGAAGGGCAATTGCTGGGTATCGAgg < 5:15495/149‑1 (MQ=255) cGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTCATGGCAGAAGGGCAATTGCTGGGTATCGAgg > 3:196447/1‑149 (MQ=255) aTTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTCATGGCAGAAGGGCAATTGCTGGGTATCGAGgcg > 8:14144/1‑149 (MQ=255) cGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTCATGGCAGAAGGGCAATTGCTGGGTATCGAGGCGCTa < 1:21966/148‑1 (MQ=255) gATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTCATGGCAGAAGGGCAATTGCTGGGTATCGa > 6:127183/1‑140 (MQ=255) gATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTCATGGCAGAAGGGCAATTGCTGGGTATCGa < 5:127183/140‑1 (MQ=255) gATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTCATGGCAGAAGGGCAATTGCTGGGTATCGAGGCGCTAgg < 3:129675/149‑1 (MQ=255) gATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTCATGGCAGAAGGGCAATTGCTGGGTATCGAGGCGCTAgg < 4:41467/149‑1 (MQ=255) gATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGGGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTCATGGCAGAAGGGCAATTGCTGGGTATCGAGGCGCTAg < 8:208661/148‑1 (MQ=255) tCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTCATGGCAGAAGGGCAATTGCTGGGTATCGAGGCGCTAGGcc > 7:272838/1‑149 (MQ=255) gcgcAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTCATGGCAGAAGGGCAATTGCTGGGTATCGAGGCGCTAGGCCGtt > 2:360655/1‑149 (MQ=255) gcgcAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCC‑TTTTGGACGTTCATGGCAGAAGGGCAATTGCTgg < 2:316766/127‑1 (MQ=255) | ACACGCCTGTTCACGGTGCCGCGGTCGGCCATGGCCGCCAATCTGGGTAGACGTCTGTGGGTGTACTACACCG‑TCACCCGCGCCGGC‑‑‑GAAACGCCACGCACATCAGAAAAGTTCGAG‑CTGCGGGTAAGCGATTTCGATCAGCGCAGCTACCCGATAATTCAGGTCGAAGGTGCCGAGAACCGGGAATTGAAACTGCATGAGGTTCCAGTGGGTGGCGCTTTGTGCACGCTGCCTTTTTGGACGTTCATGGCAGAAGGGCAATTGCTGGGTATCGAGGCGCTAGGCCGTT > NC_002947/2115780‑2116068 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |