New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 2310780 = | 103 (1.750) | 6 (0.110) | 5/234 | NT | 6.4% | coding (531/1311 nt) | PP_2033 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2310845 = | 81 (1.520) | coding (596/1311 nt) | PP_2033 | hypothetical protein |
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
GGCCAACCTGCTGCACGATGGCGCGGGCGGGCTGTTGTCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCG‑TGCTGCCGGGCGTGCACTCGAATATTGGGGGTGGTTACCC > NC_002947/2310699‑2310992 | ggCCAACCTGCTGCACGATGGCGCGGGCGGGCTGTTGTCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGcc > 4:177395/1‑149 (MQ=255) gCCAACCTGCTGCACGATGGCGCGGGCGGGCTGTTGTCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTgg < 6:112670/146‑1 (MQ=255) gCCAACCTGCTGCACGATGGCGCGGGCGGGCTGTTGTCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGcc < 1:170405/148‑1 (MQ=255) 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ctgcACGATGGCGCGGGCGGGCTGTTGTCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCgcctgg < 1:34833/148‑1 (MQ=255) gATGGCGCGGGCGGGCTGTTGTCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGcctgggcctggg > 7:122168/1‑149 (MQ=255) gATGGCGCGGGCGGGCTGTTGTCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCACCGTGGCGGccgtctg > 3:120926/1‑133 (MQ=255) gcgcGGGCGGGCTGTTGTCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCg < 1:289928/149‑1 (MQ=255) cgcgGGCGGGCTGTTGTCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCg > 4:213609/1‑148 (MQ=255) 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cTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCGGTGGCCACGACATCG‑TGCTGCCGGGCg > 2:299665/1‑149 (MQ=255) ttCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCTGATATTGCCCGT‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCG‑TGCTGCCGGGCGt > 2:117719/1‑149 (MQ=255) ttCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCG‑TGCTGCCGGGCGt > 2:121973/1‑149 (MQ=255) ttCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCG‑TGCTGCCGGGCGt > 5:316624/1‑149 (MQ=255) ttCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCG‑TGCTGCCGGGCGt > 1:231349/1‑149 (MQ=255) cGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGcggcgg > 8:253069/1‑97 (MQ=255) ccTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCG‑TGCTGCCGGGCGTGCACTc > 6:102508/1‑149 (MQ=255) ccTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCG‑TGCTGCCGGGCGTGCACTc < 6:166879/149‑1 (MQ=255) caatgatcgccgccacggtgGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCG‑TGCTGCCGGGCGTGCACTCGa < 6:326248‑M2/129‑1 (MQ=255) cAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCG‑TGCTGCCGGGCGTGCACTCGa < 6:194317/147‑1 (MQ=255) aGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCG‑TGCTGCCGGGCGTGCACTCGAata > 4:310147/1‑149 (MQ=255) aGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCG‑TGCTGCCGGGCGTGCACTCGAata > 8:283457/1‑149 (MQ=255) aGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCG‑TGCTGCCGGGCGTGCACTCGAata > 1:370620/1‑149 (MQ=255) cGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCG‑TGCTGCCGGGCGTGCACTCGAATATTg < 2:370620/149‑1 (MQ=255) gccgccacggtgGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCG‑TGCTGCCGGGCGTGCACTCGAATATTggg < 7:94930‑M2/137‑1 (MQ=255) gccgccacggtgGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCG‑TGCTGCCGGGCGTGCACTCGAATATTggg < 1:147998‑M2/137‑1 (MQ=255) ccgccacggtgGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCG‑TGCTGCCGGGCGTGCACTCGAATATTgggg < 2:231349‑M2/138‑1 (MQ=255) cgccacggtgGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCG‑TGCTGCCGGGCGTGCACTCGAATATTggggg < 6:248975‑M2/139‑1 (MQ=255) ccacggtgGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCG‑TGCTGCCGGGCGTGCACTCGAATATTGGGggtg < 1:161597‑M2/141‑1 (MQ=255) cacggtgGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCG‑TGCTGCCGGGCGTGCACTCGAATATTGGGggtgg < 4:84493‑M2/142‑1 (MQ=255) cacggtgGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCG‑TGCTGCCGGGCGTGCACTCGAATATTGGGggtgg > 5:178698‑M2/8‑149 (MQ=255) cggtgGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCG‑TGCTGCCGGGCGTGCACTCGAATATTGGGGGTGGtt < 5:335127‑M2/144‑1 (MQ=255) gtgGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCGTTGCTGCCGGGCGTGCACTCGAATATTGGGGGTGGTTa < 1:60935‑M2/146‑1 (MQ=255) tgGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGG‑CACGTCAACC‑TGCTGCCCGGCGTGCACTCCTAAatttggggtggacatcc > 3:259377‑M2/3‑143 (MQ=255) | GGCCAACCTGCTGCACGATGGCGCGGGCGGGCTGTTGTCGGTGGCGTGCGAAACCTCAATCAACTTTATCGGCCTGTTCGACACCGTGGCGGCGATCATTGCGCCCTTACAGGGTGACTTCGACCCTGCAGACGGCCGCCACGGTGGCCTGCGCCTGGGCCTGGGTGCGGATATTGCCCGG‑‑‑CACGTGGTGCAGCTGGTGGCCGAGGACGAGCGGCGGCATAACTTCCCGCTGGTGCGCAGTGGCCACGACATCG‑TGCTGCCGGGCGTGCACTCGAATATTGGGGGTGGTTACCC > NC_002947/2310699‑2310992 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |