New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3654072 | 49 (0.830) | 7 (0.120) | 5/250 | NT | 13.7% | coding (561/1101 nt) | PP_3219 | alkansulfonate monooxygenase |
? | NC_002947 | = 3654130 | 41 (0.720) | coding (503/1101 nt) | PP_3219 | alkansulfonate monooxygenase |
ACGCCCATGGCGAGCGGCGGCCTTGCGCACCTGGGCGATGCGTTCGCGCACCTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGCCGTGGTGGTCGAAGGGCGACGTCTGGGTCCAGGTGTTACGCAGCACATCGAGGTATTCGTCGGTACGTGCGTAGCGGGCATCTTTGTCGAG > NC_002947/3653982‑3654272 | aCGCCCATGGCGAGCGGCGGCCTTGCGCACCTGGGCGATGCGTTCGCGCACCTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCt > 2:362219/1‑149 (MQ=255) gCCCATGGCGAGCGGCGGCCTTGCGCACCTGGGCGATGCGTTCGCGCACCTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTtg > 6:35316‑M2/1‑147 (MQ=255) gCCCATGGCGAGCGGCGGCCTTGCGCACCTGGGCGATGCGTTCGCGCACCTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTtg > 1:362219‑M2/1‑147 (MQ=255) ccATGGCGAGCGGCGGCCTTGCGCACCTGGGCGATGCGTTCGCGCACCTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTtgcc < 4:261824‑M2/149‑5 (MQ=255) cATGGCGAGCGGCGGCCTTGCGCACCTGGGCGATGCGTTCGCGCACCTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGccc < 2:5485/149‑1 (MQ=255) gCGAGCGGCGGCCTTGCGCACCTGGGCGATGCGTTCGCGCACCTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACgg < 1:302865/149‑1 (MQ=255) gCGAGCGGCGGCCTTGCGCACCTGGGCGATGCGTTCGCGCACCTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTACTACCGCCGCGACCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTTCCCACgg > 6:263723/1‑149 (MQ=255) ggcggcCTTGCGCACCTGGGCGATGCGTTCGCGCACCTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGa < 4:180164/149‑1 (MQ=255) acTTGCGCACCTGGGCGATGCGTTCGCGCACCTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACTTCATGTAGACGTCGGCTTGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCTCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAg < 5:263723/148‑1 (MQ=255) gcgcACCTGGGCGATGCGTTCGCGCACCTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTc < 2:191686/148‑1 (MQ=255) gcACCTGGGCGATGCGTTCGCGCACCTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAgg < 2:27302/149‑1 (MQ=255) aCCTGGGCGATGCGTTCGCGCACCTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGtt < 5:174877/149‑1 (MQ=255) gCGATGCGTTCGCGCACCTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGAAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGACGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCAACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑Cctc > 3:321683/1‑149 (MQ=255) aTGCGTTCGCGCACCTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTAc > 2:26894/1‑149 (MQ=255) tCGCGCACCTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACggg < 6:107003/116‑1 (MQ=255) tCGCGCACCTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACggg > 5:107003/1‑116 (MQ=255) gcgcACCTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTa < 6:115198/147‑1 (MQ=255) gcgcACCTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTa > 5:115198/1‑147 (MQ=255) gcgcACCTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAg < 3:75901/148‑1 (MQ=255) gcgcACCTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGt > 2:247037/1‑149 (MQ=255) aCCTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTc > 1:311624/1‑149 (MQ=255) cTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGc > 5:376417/1‑149 (MQ=255) cTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGc > 7:70146/1‑149 (MQ=255) cTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGc > 2:16523/1‑149 (MQ=255) tCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGCCgtg > 5:48544/1‑149 (MQ=255) cAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGCCgtggt < 2:311624/149‑1 (MQ=255) cAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGCCgtgg < 6:48544/148‑1 (MQ=255) aGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGCCgtggtg < 1:298529/149‑1 (MQ=255) gCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGTCCCTCTACCCGGTAGTGGTCGCCGTGGTGGTc < 1:26894/149‑1 (MQ=255) ccACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGCCGTGGTGGTCGAAGGGCg > 3:198278/1‑149 (MQ=255) atGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGCCGTGGTGGTCGAAGGGCGACGTCt < 5:172849/148‑1 (MQ=255) tGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGCCGTGGTGGTCGAAGGGCGACGTCTgg > 4:289481/1‑149 (MQ=255) cGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGCCGTGGTGGTCGAAGGGCGACGTCTGGGTCCAg < 3:261824/149‑1 (MQ=255) gTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTtgccgacgtctacatgatgtggggcgagccgctggagcaggtgcgcgaacgcatcgcccaggtgcgcaaggccgccgctcgcca < 5:143740‑M2/149‑85 (MQ=255) tCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTtgccgacgtctacatgatgtggggcgagccgctggagcaggtgcgcgaacgcatcgcccaggtgcgcaaggccgccgctcgccat < 8:297555‑M2/149‑86 (MQ=255) tCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTtgccgacgtctacatgatgtggggcgagccgctggagcaggtgcgcgaacgcatcgcccaggtgcgcaaggccgccgctcgccat < 8:303062‑M2/149‑86 (MQ=255) tCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGCCGTGGTGGTCGAAGGGCGACGTCTGGGTCCAGgt < 3:306989/149‑1 (MQ=255) ggCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACgg > 8:249974/1‑71 (MQ=255) ggCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACgg < 7:249974/71‑1 (MQ=255) cgcgACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGCCGTGGTGGTCGAAGGGCGACGTCTGGGTCCAGGTGTTACGCAGCACAt < 1:16523/149‑1 (MQ=255) cgcgACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGCCGTGGTGGTCGAAGGGCGACGTCTGGGTCCAGGTGTTACGCAGCACAt < 7:166241/149‑1 (MQ=255) gACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGCCGTGGTGGTCGAAGGGCGACGTCTGGGTCCAGGTGTTACGCAGCACATCGa < 3:168882/149‑1 (MQ=255) gACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCGCTACCCGGTAGTGGTCGCCGTGGTGGTCGAAGGGCGACGTCTGGGTCCAGGTGTTACGCAGCACATc > 5:326278/1‑147 (MQ=255) gACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGT‑CGCGGCCAAGCAtgccgacgtctacatgatgtggggcgagccgctggagcaggtgcgcgaacgcatcgcccaggtgcgcaaggccgccgctcgccatgggcgtgagcagcacat < 3:34231‑M2/149‑103 (MQ=255) cTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTtgccgacgtctacatgatgtggggcgagccgctggagcaggtgcgcgaacgcatcgcccaggtgcgcaaggccgccgctcgccatgggcgtgagcagcacattc > 7:303062‑M2/1‑45 (MQ=255) cTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTtgccgacgtctacatgatgtggggcgagccgctggagcaggtgcgcgaacgcatcgcccaggtgcgcaaggccgccgctcgccatgggcgtgagcagcacattc > 7:297555‑M2/1‑45 (MQ=255) ccgccgCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGCCGTGGTGGTCGAAGGGCGCCGTCTGGGTCCAGGTGTTACGCAGCACATCGAGGTATtcg > 4:136713/1‑149 (MQ=255) cgccgcGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGCCGTGGTGGTCGAAGGGCGACGTCTGGGGCCAGGTGTTACGCAGCACATCGAGGTATtcgt < 3:289481/149‑1 (MQ=255) gccgcGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTtgccgacgtctacatgatgtggggcgagccgctggagcaggtgcgcgaacgcatcgcccaggtgcgcaaggccgccgctcgccatgggcgtgagcagcacattcgcttcagc > 6:143740‑M2/1‑37 (MQ=255) ccgcGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGCCGTGGTGGTCGAAGGGCGACGTCTGGGTCCAGGTGTTACGCAGCACATCGAGGTATtcgtcg < 6:376417/149‑1 (MQ=255) ccgcGTCCGAGGCGCAGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAATGTCAGTTTGT‑CCTCTACCCTGTAGTGGTCGCCGTTGTGGTCGAAGGGCTACGTCTGGGTCCAGGTGTTACGCAGCACATCGAGGTATtcgtcg < 4:321683/149‑1 (MQ=255) gAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGCCGTGGTGGTCGAAGGGCGACGTCTGGGTCCAGGTGTTACGCAGCACATCGAGGTATTCGTCGGTACGTGc < 4:198278/149‑1 (MQ=255) gcCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGCCGTGGTGGTCGAAGGGCGACGTCTGGGTCCAGGTGTTACGCAGCACATCGAGGTATTCGTCGGTACGTGCGTAGc > 5:315638/1‑149 (MQ=255) ccGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGCCGTGGTGGTCGAAGGGCGACGTCTGGGTCCAGGTGTTACGCAGCACATCGAGGTATTCGTCGGTACGTGCGTAGCg < 4:67905/149‑1 (MQ=255) agaAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGCCGTGGTGGTCGAAGGGCGACGTCTGGGTCCAGGTGTTACGCAGCACATCGAGGTATTCGTCGGTACGTGCGTAGCGGGCa < 8:70146/149‑1 (MQ=255) gaAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTTCCCGGTAGTGGTCGCCGTGGTGGTCGAAGGGCGACGTCTGGGTCCAGGTGTTACGCAGCACATCGAGGTATTCGTCGGTACGTGCGTAGCGGGCAt < 3:136713/149‑1 (MQ=255) gCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGCCGTGGTGGTCGAAGGGCGACGTCTGGGTCCAGGTGTTACGCAGCACATCGAGGTATTTGTCGGTACGTGCGTAGCGGGCATCTTTGTCgag > 6:126826/1‑148 (MQ=255) | ACGCCCATGGCGAGCGGCGGCCTTGCGCACCTGGGCGATGCGTTCGCGCACCTGCTCCAGCGGCTCGCCCCACATCATGTAGACGTCGGCATGCTTGGCCGCGACTTCTACCGCCGCGTCCGAGGCGCCGGAGAAGTACACCGGCA‑GCTTGCCCACGGGTTTGACCAAGGTCAGGTTGT‑CCTCTACCCGGTAGTGGTCGCCGTGGTGGTCGAAGGGCGACGTCTGGGTCCAGGTGTTACGCAGCACATCGAGGTATTCGTCGGTACGTGCGTAGCGGGCATCTTTGTCGAG > NC_002947/3653982‑3654272 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |