New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3878284 | 66 (1.120) | 5 (0.090) | 3/248 | NT | 7.0% | coding (119/3180 nt) | mexF | multidrug RND transporter MexF |
? | NC_002947 | = 3878313 | 70 (1.240) | coding (148/3180 nt) | mexF | multidrug RND transporter MexF |
TGAACTTCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGTCCTCCCAGTCCACTGCGGACGGCAAGCTGACGCTGACCATCACCTTCGCCCTGGG > NC_002947/3878167‑3878461 | tGAACTTCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAac > 8:111229‑M2/1‑147 (MQ=255) aCTTCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAacttc < 6:155223‑M2/149‑6 (MQ=255) aCTTCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAacttc < 3:198880‑M2/149‑6 (MQ=255) tctcGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTcccc > 2:309957/1‑149 (MQ=255) cGAAGTTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGgc > 3:180562/1‑149 (MQ=255) gAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGgcg > 1:204045/1‑149 (MQ=255) cttcATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAAc < 4:198880/148‑1 (MQ=255) ttcATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAAccc > 4:145242/1‑149 (MQ=255) cATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAAcccc > 5:136834/1‑148 (MQ=255) cATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAAcccc > 4:348536/1‑148 (MQ=255) ttACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAg > 7:205835/1‑149 (MQ=255) aCCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAgg < 6:136834/148‑1 (MQ=255) cGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAAc < 7:283135/138‑1 (MQ=255) cGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAAc > 8:283135/1‑138 (MQ=255) gCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCAt < 3:77891/147‑1 (MQ=255) gCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCAt > 4:77891/1‑147 (MQ=255) gCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCg < 4:153015/149‑1 (MQ=255) cGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTGTCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCgg > 1:106435/1‑149 (MQ=255) cgccgcGGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAAcc < 6:336043/148‑1 (MQ=255) gccgcGGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGt > 2:134370/1‑149 (MQ=255) ccgcGGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGtt < 1:134370/149‑1 (MQ=255) cgcgGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTg < 3:145242/149‑1 (MQ=255) tGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTgccgcg > 8:37343/1‑149 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTgccgcgcc < 8:205835/149‑1 (MQ=255) gTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTgccgcgccgc > 1:238611/1‑149 (MQ=255) gCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTg < 2:238611/148‑1 (MQ=255) ctgctgATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAgg < 3:281740/148‑1 (MQ=255) gctgATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAg < 5:57127/142‑1 (MQ=255) gctgATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAg > 6:57127/1‑142 (MQ=255) gctgATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCa > 1:118949/1‑149 (MQ=255) gATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCAGGCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGATCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCAt > 1:210906/1‑148 (MQ=255) gATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTa > 8:12961/1‑149 (MQ=255) ctggTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCAGAAGTTGTGACGCCCACCTTTGTGGTGCGCGGCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGAGAAAGCTTTGGCGCGCCTCTGTAGCAGGCCATTAcatgt < 2:273985/147‑5 (MQ=255) ggTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGgtgt < 5:155223/149‑1 (MQ=255) gTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGCGGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAACCCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGgtgt > 1:231940/1‑149 (MQ=255) gTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGtgtg < 2:106435/149‑1 (MQ=255) gTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGtgtg < 2:231940/149‑1 (MQ=255) gTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGtgtg < 3:336981/149‑1 (MQ=255) ttCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTgg > 1:133445/1‑149 (MQ=255) ccATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGga < 3:348536/148‑1 (MQ=255) cATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGc < 5:146756/132‑1 (MQ=255) cATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGc > 6:141033/1‑132 (MQ=255) cATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGc < 5:141033/132‑1 (MQ=255) cATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGc > 6:146756/1‑132 (MQ=255) cATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGgag < 6:143891/148‑1 (MQ=255) cATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGATCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGgag < 2:210906/148‑1 (MQ=255) aTCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGaa > 5:325138/1‑149 (MQ=255) tctcGCTGTA‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGaa > 4:3161/1‑148 (MQ=255) cTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCt < 2:118949/149‑1 (MQ=255) tt‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTa < 2:345831/149‑1 (MQ=255) ccA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTAc < 1:309957/148‑1 (MQ=255) cA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACAt > 6:54724/1‑149 (MQ=255) a‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCTCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTAcc > 8:260900/1‑125 (MQ=255) a‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTAcc < 7:260900/125‑1 (MQ=255) tGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGgc > 1:337936/1‑65 (MQ=255) tGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGgc < 2:337936/65‑1 (MQ=255) tGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGtcc > 4:355973/1‑149 (MQ=255) cGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGtcctcc > 8:93209/1‑149 (MQ=255) cGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGtcctcc < 2:133445/149‑1 (MQ=255) gATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGtcctcc > 6:14325/1‑148 (MQ=255) aGC‑GAATACCCCGACGTGGTGCCGCCCACCGTGGGGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGTCCTCCCAGTc < 6:313829/149‑1 (MQ=255) cccGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAacttcggggtattcgctgatcggcagctggaacagcgagatggaacccgcgatcagcagcaccagcgacagcaccgcggcgaagatcggccgggt > 4:98174‑M2/1‑37 (MQ=255) cccGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAacttcggggtattcgctgatcggcagctggaacagcgagatggaacccgcgatcagcagcaccagcgacagcaccgcggcgaagatcggccgggt < 3:98174‑M2/132‑96 (MQ=255) cccGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGTCCTCCCAGTCCACt > 3:113697/1‑144 (MQ=255) cccGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGTCCTCCCAGTCCACt < 4:113697/144‑1 (MQ=255) cccGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGTCCTCCCAGTCCACTGCGGa > 2:119406/1‑149 (MQ=255) ccGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCActtcggggtattcgctgatcggcagctggaacagcgagatggaacccgcgatcagcagcaccagcgacagcaccgcggcgaagatcggccgggtaatgaagaatttcgagaag < 2:321309‑M2/149‑114 (MQ=255) ccGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAacttcggggtattcgctgatcggcagctggaacagcgagatggaacccgcgatcagcagcaccagcgacagcaccgcggcgaagatcggccgggtaatgaagaatttcgag < 4:65602‑M2/147‑112 (MQ=255) gAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGTCCTCCCAGTCCACTGCGGACgg < 8:66484/149‑1 (MQ=255) gtggtgCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGTCCTCCCAGTCCACTGCGGACGGCaa < 7:12961/149‑1 (MQ=255) cACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGgtg > 2:236648/1‑92 (MQ=255) cACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGgtg < 1:236648/92‑1 (MQ=255) cACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGTCCTCCCAGTCCACTGCGGACGGCAAgctgacgctga < 7:93209/149‑1 (MQ=255) cACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGTCCTCCCAGTCCACTGCGGACGGCAAgctgacgctga > 1:281166/1‑149 (MQ=255) tggtgCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGTCCTCCCAGTCCACTGCGGACGGCAAGCTGACGCTGACCATCAcc < 5:54724/149‑1 (MQ=255) tgCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACa < 1:310500/99‑1 (MQ=255) tgCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACa > 2:310500/1‑99 (MQ=255) cgcgcCActtcggggtattcgctgatcggcagctggaacagcgagatggaacccgcgatcagcagcaccagcgacagcaccgcggcgaagatcggccgggtaatgaagaatttcgagaagttcatcggtagggtcccttaaccgcgtg > 1:321309‑M2/1‑7 (MQ=255) gcgcCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGTCCTCCCAGTCCACTGCGGACGGCAAGCTGACGCTGACCATCACCTTCGcc < 7:37343/149‑1 (MQ=255) gcCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGTCCTCCCAGTCCACTGCGGACGGCAAGCTGACGCTGACCATCACCTTCGCCCt < 5:14325/149‑1 (MQ=255) cAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGTCCTCCCAGTCCACTGCGGACGGCAAGCTGACGCTGACCATCACCTTCGCCCTgg > 3:84755/1‑149 (MQ=255) aaCTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGTCCTCCCAGTCCACTGCGGACGGCAAGCTGACGCTGACCATCACCTTCGCCCTggg < 4:84755/149‑1 (MQ=255) | TGAACTTCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCTGCTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTT‑CCA‑GCTGCCGATCAGC‑GAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGGTGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGTCCTCCCAGTCCACTGCGGACGGCAAGCTGACGCTGACCATCACCTTCGCCCTGGG > NC_002947/3878167‑3878461 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |