New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4905822 | 61 (1.040) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 5.3% | coding (201/489 nt) | PP_4314 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 4905848 | 49 (0.870) | coding (175/489 nt) | PP_4314 | hypothetical protein |
CGGTAGTACAGGTGCGTACCACAGCGGCCACAGAAAGCACGCTGGGCCCAGTCGGACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCATGGGTGGCTCCTTGAACGGAAAGATGGGCCTGCAATTATAGAAGCCACCCAGG > NC_002947/4905700‑4905993 | cGGTAGTACAGGTGCGTACCACAGCGGCCACAGAAAGCACGCTGGGCCCAGTCGGACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACAt > 1:129743/1‑149 (MQ=255) tagtaCAGGTGCGTACCACAGCGGCCACAGAAAGCACGCTGGGCCCAGTCGGACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATgct > 4:218506‑M2/1‑146 (MQ=255) aCAGGTGCGTACCACAGCGGCCACAGAAAGCACGCTGGGCCCAGTCGGACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCaa > 5:174584/1‑149 (MQ=255) aCAGGTGCGTACCACAGCGGCCACAGAAAGCACGCTGGGCCCAGTCGGACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCaa > 7:2489/1‑149 (MQ=255) gTGCGTACCACAGCGGCCACAGAAAGCACGCTGGGCCCAGTCGGACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATg > 4:158287/1‑147 (MQ=255) gTGCGTACCACAGCGGCCACAGAAAGCACGCTGGGCCCAGTCGGACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATg < 3:158287/147‑1 (MQ=255) gTGCGTACCACAGCGGCCACAGAAAGCACGCTGGGCCCAGTCGGACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGa > 7:44205/1‑148 (MQ=255) tGCGTACCACAGCGGCCACAGAAAGCACGCTGGGCCCAGTCGGACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAAt < 6:340876/145‑1 (MQ=255) tGCGTACCACAGCGGCCACAGAAAGCACGCTGGGCCCAGTCGGACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAAt > 5:340876/1‑145 (MQ=255) ggCCACAGAAAGCACGCTGGGCCCAGTCGGACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATgg < 6:174584/149‑1 (MQ=255) ccACAGAAAGCACGCTGGGCCCAGTCGGACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATggg > 8:44831/1‑148 (MQ=255) cacaGAAAGCACGCTGGGCCCAGTCGGACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTTGATCAGCGGAGGCTCGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCaag < 7:128386/129‑2 (MQ=255) cacaGAAAGCACGCTGGGCCCAGTCGGACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTTGATCAGCGGAGGCTCGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCaag > 8:128386/1‑128 (MQ=255) caGAAAGCACGCTGGGCCCAGTCGGACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTAtt > 4:291970/1‑149 (MQ=255) aGAAAGCACGCTGGGCCCAGTCGGACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTg > 4:97776/1‑149 (MQ=255) aaaGCACGCTGGGCCCAGTCGGACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTc > 6:203556/1‑149 (MQ=255) aGCACGCTGGGCCCAGTCGGACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGa > 2:220680/1‑149 (MQ=255) gCTGGGTCCAGTCGGACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTg < 8:260103/149‑1 (MQ=255) ggCCCAGTCGGACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGAcc < 3:45741/148‑1 (MQ=255) cGGACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCcg < 3:291970/148‑1 (MQ=255) gACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCgt > 6:343277/1‑149 (MQ=255) gACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCgt < 8:44205/149‑1 (MQ=255) gAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTc < 7:44831/149‑1 (MQ=255) gAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTc > 8:217566/1‑149 (MQ=255) gAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTc > 4:212608/1‑149 (MQ=255) gACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGcaca < 2:205893/149‑1 (MQ=255) aCGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCAcag < 1:220680/149‑1 (MQ=255) gCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCAcaggc < 8:2489/149‑1 (MQ=255) tGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCAcaggcag > 3:48839/1‑149 (MQ=255) ggCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCAcaggcag < 5:343277/147‑1 (MQ=255) ggCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGt < 6:74288/149‑1 (MQ=255) gcgcACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTg > 8:39730/1‑149 (MQ=255) gcACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGcc > 7:246827/1‑149 (MQ=255) cGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCgtg > 7:117585/1‑149 (MQ=255) gCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCAcaggcag > 4:20316/1‑140 (MQ=255) gCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCAcaggcag < 3:20316/140‑1 (MQ=255) ccTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGttt < 2:129743/149‑1 (MQ=255) ccTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGttt > 3:321050/1‑149 (MQ=255) cTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGtttt > 2:123618/1‑149 (MQ=255) cGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTc < 5:203556/148‑1 (MQ=255) cGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCa > 2:347079/1‑149 (MQ=255) ggAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCAt < 8:117585/149‑1 (MQ=255) gCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCATGGGt < 2:77321/149‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCATGGGTgg > 4:122227/1‑149 (MQ=255) gctgcAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCATGGGTgg < 5:19907/147‑1 (MQ=255) gcAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCATGGGTGGCTCCt > 5:85995/1‑149 (MQ=255) cAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCATGGGTGGCTcc < 3:97776/147‑1 (MQ=255) cAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCATGGGTGGCTACtt > 2:123260/1‑149 (MQ=255) caccacCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCATGGGTGGCTCCTTGAAc < 8:246827/148‑1 (MQ=255) ccaccaGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGAGGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCATGGGTGGCTCCTTg < 8:148784/143‑1 (MQ=255) ccaccaGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCATGGGTGGCTCCTTg > 7:148784/1‑143 (MQ=255) caccaGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATgctgctggtggtgcactgcagcaagcctccgctgatcgaagggcgtgcgcccagcgtctatgattcgtccgactgggcccagcgtgctttctgtggccgctgtggtacgcacc < 5:380349‑M2/149‑114 (MQ=255) accaGCAGCGGGCCGCCGGGCCACTTGCGGCACATgctgctggtggtgcactgcagcaagcctccgctgatcgaagggcgtgcgcccagcgtctatgattcgtccgactgggcccagcgtgctttctgtggccgctgtggtacgcacct < 7:60‑M2/149‑115 (MQ=255) cagcagCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCa > 7:85572/1‑119 (MQ=255) cagcagCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCa < 8:85572/119‑1 (MQ=255) agcagcGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATgctgctggtggtgcactgcagcaagcctccgctgatcgaagggcgtgcgcccagcgtctattattcgtccgactgggcccagcgggctttctgtggccgctgtggtacgcacctgt < 4:260442‑M2/148‑117 (MQ=255) cGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCATGGGTGGCTCCTTGAACGGAAAGATGGGcc > 7:51347/1‑149 (MQ=255) ccgGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCATGGGTGGCTCCTTGAACGGAAAGATGGGCCTGCAAtt < 1:347079/149‑1 (MQ=255) gTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCATGGGTGGCTCCTTGAAGGGAAAGATTGGCCTTCAATtata < 4:321050/149‑1 (MQ=255) tCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCATGGGTGGCTCCTTGAACGGAAAGATGGGCCTGCAATTATAg < 7:39730/149‑1 (MQ=255) cACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCATGGGTGGCTCCTTGAACGGAAAGATGGGCCTGCAATTATAGaa < 4:48839/149‑1 (MQ=255) cACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCATGGGTGGCTCCTTGAACGGAAAGATGGGCCTGCAATTATAGaa < 1:85352/149‑1 (MQ=255) gCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCATGGGTGGCTCCTTGAACGGAAAGATGGGCCTGCAATTATAGAAGCCAcc > 3:368516/1‑147 (MQ=255) acaTGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCATGGGTGGCTCCTTGAACGGAAAGATGGGCCTGCAATTATAGAAGCCCCCCAgg > 8:333877/1‑149 (MQ=255) acaTGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCATGGGTGGCTCCTTGAACGGAAAGATGGGCCTGCAATTATAGAAGCCACCCAgg < 4:368516/149‑1 (MQ=255) tgctgcAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCATGGGTGGCTCCTTGAACGGAAAGATGGGCCTGCAATTATAGAAGCCACCCAgg > 6:164772/1‑146 (MQ=255) tgctgcAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCATGGGTGGCTCCTTGAACGGAAAGATGGGCCTGCAATTATAGAAGCCACCCAgg < 5:164772/146‑1 (MQ=255) | CGGTAGTACAGGTGCGTACCACAGCGGCCACAGAAAGCACGCTGGGCCCAGTCGGACGAATCATAGACGCTGGGCGCACGCCCTTCGATCAGCGGAGGCTTGCTGCAGTGCACCACCAGCAGCGGGCCGCCGGTCCACTTGCGGCACATGCTGCAATGACAAGCGCTGATATGGGTATTGTCGACGGTGACCGTCAGCCGCGTGTCGCCGCACAGGCAGGTGCCGTGTTTTTCCAGGGCCATGGGTGGCTCCTTGAACGGAAAGATGGGCCTGCAATTATAGAAGCCACCCAGG > NC_002947/4905700‑4905993 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |