New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4920753 | 65 (1.100) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 6.6% | coding (1162/2682 nt) | PP_4330 | toxin‑like protein |
? | NC_002947 | = 4920795 | 50 (0.880) | coding (1204/2682 nt) | PP_4330 | toxin‑like protein |
CCAGCGCAGCTATGACGATGCCGATTTTGTCATCACCACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAGGGCACAGCAGGCATCAAGG > NC_002947/4920647‑4920939 | ccagcgcAGCTATGACGATGCCGATTTTGTCATCACCACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCg < 7:291429/149‑1 (MQ=255) cTATGAAGATTCCTATTTAGTCATCACCACCGCCAGCCAGGTTACCAAATCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCTCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTTGCGCTCGGTGGCATTg < 4:320576/149‑1 (MQ=255) tGACGATGCCGATTTTGTCATCACCACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGcc < 8:247547/148‑1 (MQ=255) tGCCGATTTTGTCATCACCACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTtgg < 1:5045/149‑1 (MQ=255) cGATTTTGTCATCACCACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCAtt < 2:120443/136‑1 (MQ=255) cGATTTTGTCATCACCACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCAAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCAtt > 1:120443/1‑136 (MQ=255) ttttGTCATCACCACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTtgggcctgg < 8:33709/149‑1 (MQ=255) tcatcaCCACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGggcctgggcctg > 2:262957/1‑149 (MQ=255) atcaCCACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGa > 2:355050/1‑149 (MQ=255) atcaACACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGa > 8:87698/1‑149 (MQ=255) tcaagaccGTCTGCCAGGTTACCAAAGCCAATTGGCGAGGCTACCTCACCAATAGGGTCATCGTGCTTGCGCCACTGTGCCTTGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGAt < 2:301580/144‑1 (MQ=255) tcaCCACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGAt > 1:150848/1‑149 (MQ=255) tcaCCACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGAt > 5:9614/1‑149 (MQ=255) caccacCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGAt > 4:297050/1‑148 (MQ=255) accGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGt < 2:150848/149‑1 (MQ=255) cGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGa < 7:224567/149‑1 (MQ=255) aGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGc < 3:173187/149‑1 (MQ=255) ggTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGcc < 1:262957/149‑1 (MQ=255) aaaGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCt < 2:271897/149‑1 (MQ=255) aaaGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCt < 6:110691/149‑1 (MQ=255) ccAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGTTCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGaaa < 1:211160/149‑1 (MQ=255) gAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAg < 8:245187/116‑1 (MQ=255) gAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAg > 7:245187/1‑116 (MQ=255) cTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACaggagg < 6:9614/149‑1 (MQ=255) aCCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCt < 5:237559/130‑1 (MQ=255) aCCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCt > 6:237559/1‑130 (MQ=255) tCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGt > 1:249468/1‑148 (MQ=255) cACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACg > 3:128582/1‑116 (MQ=255) cACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACg < 4:128582/116‑1 (MQ=255) aCCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGt < 2:249468/146‑1 (MQ=255) aCCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTggg > 1:256991/1‑149 (MQ=255) ccAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGc > 8:208601/1‑149 (MQ=255) aCGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGaaa < 1:358491/123‑1 (MQ=255) aCGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGaaa > 2:358491/1‑123 (MQ=255) gCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGCTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGCGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCg > 6:35167/1‑149 (MQ=255) tCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGcc > 3:47425/1‑149 (MQ=255) tCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGACAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGcc > 5:213640/1‑149 (MQ=255) aaCCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGaaa < 1:109773/117‑1 (MQ=255) aaCCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGaaa > 2:109773/1‑117 (MQ=255) ccTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGgtggcgctagcaggttgagcgtattggtgaggtagcctcgccatttggctttggtaacctggctg > 8:170319‑M2/1‑56 (MQ=255) ccTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGgtggcgctagcaggttgagcgtattggtgaggtagcctcgccatttggctttggtaacctggctg < 7:170319‑M2/121‑66 (MQ=255) ccTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAATGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTggg < 3:297050/149‑1 (MQ=255) ccTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAg < 4:86329/116‑1 (MQ=255) ccTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAg > 3:86329/1‑116 (MQ=255) cTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGgtggcgctagcaggttgagcgtattggtgaggtagcctcgccatttggctttggtaacctggctgtcggtggtgatgacaaaatcggcatcgt < 3:188893‑M2/148‑94 (MQ=255) cTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTgggg < 2:256991/149‑1 (MQ=255) gcgcCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGtt < 6:28381/149‑1 (MQ=255) cACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCAACAGCCTGAAAGCCAAACAGGATGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAAc < 7:87698/149‑1 (MQ=255) aCTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTgg < 7:129425/136‑1 (MQ=255) aCTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTgg > 8:129425/1‑136 (MQ=255) tgtgCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGcc > 5:356172/1‑149 (MQ=255) gCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTa > 2:160490/1‑149 (MQ=255) ccTGGTGGGGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGTCAATGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAACCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTa < 6:111147/148‑1 (MQ=255) tggtgCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTg < 6:356172/149‑1 (MQ=255) ggtgCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTgg < 1:160490/149‑1 (MQ=255) tgCCGGGGCTGGCGCAACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAATGCCAAACAGGAGGGGGTGGTCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGATGGc > 7:142219/1‑148 (MQ=255) ccACTGCTGGCGCTCGgtggcgctagcaggttgagcgtattggtgaggtagcctcgccatttggctttggtaacctggctgtcggtggtgatgacaaaatcggcatcgtcatagctgcgctggcgctggcgctcggtcagggctgcgaa > 4:188893‑M2/1‑16 (MQ=255) tgctgGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAGGGCACAGCAgg > 3:238579/1‑148 (MQ=255) gcTCGGGGTCTTTGCCCAGTTGGTCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGTGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAGGGCACAGCAGGCATCAAgg < 6:213640/149‑1 (MQ=255) | CCAGCGCAGCTATGACGATGCCGATTTTGTCATCACCACCGACAGCCAGGTTACCAAAGCCAAATGGCGAGGCTACCTCACCAATACGCTCAACCTGCTAGCGCCACTGTGCCTGGTGGTGCCGGGGCTGGCGCCACTGCTGGCGCTCGGTGGCATTGCCCAGTTGGGCCTGGGCCTGGATCAGGTGATCAACGGCCACAGCCTGAAAGCCAAACAGGAGGGGGTGGGCGACATCGCCTGGGGGCTGTTCAACGCCGTACCGCTGGCAACGGAGGGCACAGCAGGCATCAAGG > NC_002947/4920647‑4920939 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |