New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5107942 | 50 (0.850) | 3 (0.050) | 3/246 | NT | 5.8% | coding (170/3021 nt) | ydiJ | putative oxidoreductase |
? | NC_002947 | = 5107965 | 50 (0.890) | coding (147/3021 nt) | ydiJ | putative oxidoreductase |
CCGTCGGTCAGCGACTGGCCGTTGGTGCCGGTGCCACCACCGCGCGGGGTCAGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGTTGCGCAGGGCTTCGAGGAATTCGGGGTAATTGGCGCTCGGTGCAACGGTGGA > NC_002947/5107822‑5108096 | ccGTCGGTCAGCGACTGGCCGTTGGTGCCGGTGCCACCACCGCGCGGGGTCAGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGcgctg > 5:50173‑M2/1‑144 (MQ=255) ccGTCGGTCAGCGACTGGCCGTTGGTGCCGGTGCCACCACCGCGCGGGGTCAGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGcgctg > 3:210791‑M2/1‑144 (MQ=255) ccGTCGGTCAGCGACTGGCCGTTGGTGCCGGTGCCACCACCGCGCGGGGTCAGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGcgctg > 7:145801‑M2/1‑144 (MQ=255) cGTCGGTCAGCGACTGGCCGTTGGTGCCGGTGCCACCACCGCGCGGGGTCAGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGcgctgg > 8:38900‑M2/1‑143 (MQ=255) tCAGCGACTGGCCGTTGGTGCCGGTGCCACCACCGCGCGGGGTCAGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATc < 8:210578/149‑1 (MQ=255) aGCGACTGGCCGTTGGTGCCGGTGCCACCACCGCGCGGGGTCAGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGa < 1:216787/149‑1 (MQ=255) gACTGGCCGTTGGTGCCGGTGCCACCACCGCGCGGGGTCAGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGtt < 2:75315/149‑1 (MQ=255) cGTTGGTGCCGGTGCCACCACCGCGCGGGGTCAGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTg < 6:214025/149‑1 (MQ=255) ccggtgccACCACCGCGCGGGGTCAGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTAc > 3:53611/1‑149 (MQ=255) gtgccACCACCGCGCGGGGTCAGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGt > 3:366645/1‑149 (MQ=255) accaccGCGCGGGGTCAGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGt < 7:136077/116‑1 (MQ=255) accaccGCGCGGGGTCAGCTTGACCTACTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGt > 8:136077/1‑116 (MQ=255) caccGCGCGGGGTCAGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGtt < 1:251223/149‑1 (MQ=255) ccGCGCGGGGTCAGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGa < 4:86309/119‑1 (MQ=255) ccGCGCGGGGTCAGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGa > 3:86309/1‑119 (MQ=255) ccGCGCGGGGTCAGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGc > 2:100739/1‑149 (MQ=255) ccGCGCGGGGTCAGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGc < 4:57340/149‑1 (MQ=255) gcgGGGTCAGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCTCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCgg < 6:81589/140‑1 (MQ=255) gcgGGGTCAGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCgg > 5:81589/1‑140 (MQ=255) ggggTCAGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTc < 6:277750/149‑1 (MQ=255) ggggTCAGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTc < 1:100739/149‑1 (MQ=255) cAGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCAc < 7:312536/149‑1 (MQ=255) aGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGAGTGGCGACCCGCGACACATCGTCGGCATACAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTTGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCAc < 6:272570/148‑1 (MQ=255) gCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCGATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTa > 1:211828/1‑123 (MQ=255) gCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTa < 2:211828/123‑1 (MQ=255) cTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGa > 2:272591/1‑149 (MQ=255) gctgGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCcg > 8:144071/1‑149 (MQ=255) ctgGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGcc < 1:202618/147‑1 (MQ=255) ctgGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCcgc > 5:362310/1‑149 (MQ=255) tCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGtt > 1:305563/1‑149 (MQ=255) tCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGtt > 6:266019/1‑149 (MQ=255) aTCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGTTGCGCAg > 6:7186/1‑149 (MQ=255) tCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGTTGCGCAgg < 4:366645/149‑1 (MQ=255) agcggcgCGACCCGCGCCACATCGGCGGCATCCAGCGGGCACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGCTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGTTGCGCAgg < 4:258041/141‑1 (MQ=255) gCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCg < 1:356171/134‑1 (MQ=255) gCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCg > 2:356171/1‑134 (MQ=255) gcgcCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGTTGCGCAGGGCTTCGAGGAATTCg < 5:7186/149‑1 (MQ=255) gcCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCTGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACGGTGCGGGTTGCGTTGTCGGCTCTGATCTGGCCGCGGAATCCGCTGTTGCGCAGGGCTTCGAGGAATTCggg < 5:237426/149‑1 (MQ=255) cacaTCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGTTGCGCAGGGCTTCGAGGAATTCgggg > 5:264342/1‑148 (MQ=255) cacaTCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGTTGCGCAGGGCTTCGAGGAATTCGGGGt < 6:362310/149‑1 (MQ=255) cacaTCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGATGTTGCGCAGGGCTTCGAGGAAGTCgggg > 2:295869/1‑148 (MQ=255) aTCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGTTGCGCAGGGCTTCGAGGAATTCGGGGTAAt > 5:309728/1‑149 (MQ=255) cgtcgGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGTTGCGCAGGGCTTCGAGGAATTCGGGGTAATTg > 4:44216/1‑149 (MQ=255) cgtcgGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGTTGCGCAGGGCTTCGAGGAATTCGGGGTAATTg > 5:370706/1‑149 (MQ=255) gtcgGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGTTGCGCAGGGCTTCGAGGAATTCGGGGTAATTg < 5:266019/148‑1 (MQ=255) gtcgGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGTTGCGCAGGGCTTCGAGGAATTCGGGGTAATTg < 2:305563/148‑1 (MQ=255) gCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGcgctggatgccgacgatgtggcgcgggtcgccacgctgatgggcgagccgcgcttccagcaggtcaagctgaccccgcgcggtggtggcaccggcaccaacggccagtcgctgacc < 7:30258‑M2/149‑117 (MQ=255) cATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTAGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGTTGCGCAGGGCTTCGAGGAATTCGGGGTAATTGGCGCTc > 2:72248/1‑149 (MQ=255) tCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGcgctggatgccgacgatgtggcgcgggtcgccacgctgatgggcgagccgcgcttccagcaggtcaagctgaccccgcgcggtggtggcaccggcaccaacggccagt > 8:205814‑M2/1‑30 (MQ=255) tCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGcgctggatgccgacgatgtggcgcgggtcgccacgctgatgggcgagccgcgcttccagcaggtcaagctgaccccgcgcggtggtggcaccggcaccaacggccagt < 7:205814‑M2/138‑109 (MQ=255) tCCAGCGGGAACACAGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGTTAGATCGAGTTGTCGGTGGCAAGTACAGTGCTTGTTGAGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGACGCTGTTGCGCAGGTCTTCGAGCAATTCGGGGTAATTGGCGATCgg > 2:29571/1‑149 (MQ=255) ccAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGTTGCGCAGGGCTTCGAGGAAtt > 8:12428/1‑129 (MQ=255) aGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGTTGCGCAGGGCTTCGAGGAATTCGGGGTAATTGGCGCTCg < 3:149540/145‑1 (MQ=255) aGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGTTGCGCAGGGCTTCGAGGAATTCGGGGTAATTGGCGCTCg > 4:149540/1‑145 (MQ=255) aGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGTTGCGCAGGGCTTCGAGGAATTCGGGGTAATTGGCGCTCGGTg > 7:28995/1‑148 (MQ=255) gAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGTTGCGCAGGGCTTCGAGGAATTCGGGGTAATTGGCGCTCGGTGCAACgg > 7:311526/1‑149 (MQ=255) aaCACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGTTGCGCAGGGCTTCGAGGAATTCGGGGTAATTGGCGCTCGGTGCAACGGt < 7:144071/149‑1 (MQ=255) acacCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGTTGCGCAGGGCTTCGAGGAATTCGGGGTAATTGGCGCTCGGTGCAACGGTg < 3:44216/149‑1 (MQ=255) cgccgcCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGTTGCGCAGGGCTTCGAGGAATTCGGGGTAATTGGCGCTCGGTGCAACGGTGGa > 7:184230/1‑147 (MQ=255) | CCGTCGGTCAGCGACTGGCCGTTGGTGCCGGTGCCACCACCGCGCGGGGTCAGCTTGACCTGCTGGAAGCGCGGCTCGCCCATCAGCGTGGCGACCCGCGCCACATCGTCGGCATCCAGCGGGAACACCGCCGCCTGCGGCAAGCGCTGGTAGATCGAGTTGTCGGTGGCCAGTACCGTGCGGGTTGCGTAGTCGGCACTGATCTGGCCGCGGAAGCCGCTGTTGCGCAGGGCTTCGAGGAATTCGGGGTAATTGGCGCTCGGTGCAACGGTGGA > NC_002947/5107822‑5108096 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |