New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5306320 | 45 (0.760) | 3 (0.060) | 3/238 | NT | 6.7% | coding (932/3483 nt) | recC | multifunctional ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease/ssDNA endonuclease recombinase subunit |
? | NC_002947 | = 5306376 | 42 (0.770) | coding (876/3483 nt) | recC | multifunctional ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease/ssDNA endonuclease recombinase subunit |
ACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTACGCACAGCAATACCTGACTGAAACGCGACAGGCCTGCCAGTGCTTCCAGGGCCTGGGCCGGCAG > NC_002947/5306236‑5306522 | acGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGcgttgctg < 1:327549‑M2/149‑9 (MQ=255) gCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGcgttgctggc > 7:219782‑M2/1‑139 (MQ=255) gCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGcgttgctggc > 1:107043‑M2/1‑139 (MQ=255) ccTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑Gt < 6:93391/149‑1 (MQ=255) ccTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑Gt < 5:220125/149‑1 (MQ=255) gTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTg > 5:342541/1‑148 (MQ=255) gCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTAc < 3:111165/148‑1 (MQ=255) gCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACt < 1:288241/149‑1 (MQ=255) tGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGGTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGATGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACtgg > 3:87350/1‑149 (MQ=255) gCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACtggt > 1:329260/1‑149 (MQ=255) tcatAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAg > 1:64333/1‑149 (MQ=255) catAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAgg > 6:242077/1‑149 (MQ=255) tCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTg < 5:242077/147‑1 (MQ=255) tCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTg < 6:342541/147‑1 (MQ=255) tCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTc < 2:64333/149‑1 (MQ=255) gAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCgg > 3:328115/1‑149 (MQ=255) gCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACtggtg > 4:277202/1‑127 (MQ=255) gCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACtggtg < 3:277202/127‑1 (MQ=255) gTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTc > 3:218875/1‑141 (MQ=255) gTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTc < 4:218875/141‑1 (MQ=255) gTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAgg > 7:239875/1‑127 (MQ=255) gTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAgg < 8:239875/127‑1 (MQ=255) gcgGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTCTCGGCAACGATATCGGCCCAgt > 5:211163/1‑149 (MQ=255) ttGTTTACACCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTggc > 5:360444/1‑149 (MQ=255) ccccAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTTCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGTGGCATGCATTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGTTATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATg < 6:75155/148‑1 (MQ=255) cAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGtt < 6:211163/149‑1 (MQ=255) ggCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTtgt < 4:328115/149‑1 (MQ=255) ccAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGcgttgctggcagcctggggtaaacaaggccgcgactacatcaacctgctcgacagctatgatgacccaggcagctaccagggcg < 7:156769‑M2/149‑85 (MQ=255) cAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGcgttgctggcagcctggggtaaacaaggccgcgactacatcaacctgctcgacagctatgatgacccaggcagctaccagggcgt < 3:277269‑M2/149‑86 (MQ=255) aGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGcgttgctggc < 7:61721‑M2/73‑11 (MQ=255) aGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGcgttgctggc > 8:61721‑M2/1‑63 (MQ=255) gCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTACGcac < 2:327549/149‑1 (MQ=255) cAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTACGcaca < 2:363727/149‑1 (MQ=255) cAACGGCTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGCGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGTTTTCGGACCAGTGGTGTCGGCATGGGGTGTGTACGca < 4:87350/147‑1 (MQ=255) gTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTgtgt < 8:345689/136‑1 (MQ=255) gTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTgtgt > 7:345689/1‑136 (MQ=255) ggCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTACGCACAGCAATACct > 1:347830/1‑149 (MQ=255) tGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGcgttgctggcagcctggggtaaacaaggccgcgactacatcaacctgctcgacagctatgatgacccaggcagctaccagggcgtgttcagcgacggccgcatcgac > 4:277269‑M2/1‑42 (MQ=255) aGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTACGCACAGCAATACCTGACTGAAACGCGa < 6:360444/149‑1 (MQ=255) gCGTCTGGTCGTCCAGGTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACGGGTGGCGCAACCGGTCGGTGGCGGCATCGCTATCGGGCGAGTGGTGGCGGGAGGGGGTGTGTGAGGGCAGGAATAGCGGACTGAAACGCGAc > 4:257257/1‑149 (MQ=255) tGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCAGTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTACGCACAGCAATACCTGACTGAAACGCGACAGGc > 1:257261/1‑149 (MQ=255) cgtcCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTACGCACAGCa > 7:163447/1‑120 (MQ=255) cgtcCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTACGCACAGCa < 8:163447/120‑1 (MQ=255) gtcCAGGTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTACGCACAGCAATACCTGACTGAAACGCGACAGGCCTGc > 4:253842/1‑147 (MQ=255) cAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCGTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGGGGCGGCATGGGTTGTGTACGCACGGCAAGACCTGGCTGAAACGCGCCAGGCCTGCCAGTg > 2:123810/1‑149 (MQ=255) cAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTACGCACAGAAATACGTGACTGAAACGCGACAGGCCTGCCAGTg > 8:352999/1‑149 (MQ=255) cAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTACGAACAGCAATACCTGACTGAAACGCGACAGGCCTGCCAGTg > 4:16851/1‑149 (MQ=255) gTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTACGCACAGCAATACCTGACTGAAACGCGACAGGCCTGCCAGTGCt > 5:243874/1‑149 (MQ=255) ggggCATGCCTCGCTTGCGTTGCTGGC‑GTGTGTACTGTTTGCTCAACAGGTCCTTTTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTACGCACAGCAATACCTGACTGAAACGCGACAGGCCTTCCAGTGCTTCCAgg < 3:257257/149‑1 (MQ=255) gggCATGCGTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCGACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTACGCACCGCAATACCTGACTGAAACGCGACAGGCCGGCCAGTGCTTGCAggg > 2:244472/1‑149 (MQ=255) ggCATGCGTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCGACGATGTCGGCCCAGTGGTGGGGGCATGGGTTGTGGACGCCCAGCAATACCGGGCGGACGCGCGACAGGCCGGCCAGTGCGTCCCGGGc > 8:150778/1‑149 (MQ=255) ccTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTtgtg < 7:171208/89‑1 (MQ=255) ccTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTtgtg > 8:171208/1‑89 (MQ=255) cttgcGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTACGCACAGCAATACCTGACTGAAACGCGACAGGCCTGCCAGTGCTTCCAGGGCCTGGGCCGGCa < 2:329260/149‑1 (MQ=255) ttgcGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTACGCACAGCAATACCTGACTGAAACGCGACAGGCCTGCCAGTGCTTCCAGGGCCTGGGCCGGCAg > 2:150785/1‑149 (MQ=255) tgcGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTACGCACAGCAATACCTGACTGAAACGCGACAGGCCTGCCAGTGCTTCCAGGGc < 7:187893/136‑1 (MQ=255) tgcGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTACGCACAGCAATACCTGACTGAAACGCGACAGGCCTGCCAGTGCTTCCAGGGc > 8:187893/1‑136 (MQ=255) | ACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCCTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGC‑GTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTACGCACAGCAATACCTGACTGAAACGCGACAGGCCTGCCAGTGCTTCCAGGGCCTGGGCCGGCAG > NC_002947/5306236‑5306522 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |