New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 6055813 = | 58 (0.990) | 3 (0.060) | 3/234 | NT | 5.3% | intergenic (+34/‑61) | tonB/oxyR | TonB energy transducing system subunit TonB/oxidative and nitrosative stress transcriptional dual regulator |
? | NC_002947 | 6055876 = | 55 (1.030) | coding (3/927 nt) | oxyR | oxidative and nitrosative stress transcriptional dual regulator |
GCACGATTGAAGTCGTGGCACCGTTCGTCTACTCACTGGACCGCCGCTAAGACTTTTGCTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGCCAACCCACCCTGTCGGTCGGT‑GTGAAGAAGCTCGAGGACGAGCTTGGCGTTCTGATCTTCGA > NC_002947/6055730‑6056019 | ggctcacgtgacagcgctcggcggcatggccgaagtgctgttcctgggcgagtgtgacgatgtagcgtaattctgtaagggtcATAACGTGCGTCTATCGACTTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATg > 1:268053‑M1/84‑148 (MQ=255) cGATTGAAGTCGTGGCACCGTTCGTCTACTCACTGGACCGCCGCTAAGACTTTTGCTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCt < 4:178836/149‑1 (MQ=255) gATTGAAGTCGTGGCACCGTTCGTCTACTCACTGGACCGCCGCTAAGACTTTTGCTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCt > 7:331140/1‑148 (MQ=255) gTGGCACCGTTCGTCTACTCACTGGACCGCCGCTAAGACTTTTGCTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTa < 1:252245/148‑1 (MQ=255) tGGCACCGTTCGTCTACTCACTGGACCGCCGCTAAGACTTTTGCTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACg < 2:81571/149‑1 (MQ=255) tGGCACCGTTCGTCTACTCACTGGACCGCCGCTAAGACTTTTGCTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACg > 6:243835/1‑149 (MQ=255) gCACCGTTCGTCTACTCACTGGACCGCCGCTAAGACTTTTGCTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACa < 1:330017/139‑1 (MQ=255) gCACCGTTCGTCTACTCACTGGACCGCCGCTAAGACTTTTGCTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACa > 2:330017/1‑139 (MQ=255) gCACCGTTCGTCTACTCACTGGACCGCCGCTAAGACTTTTGCTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGc < 3:296556/148‑1 (MQ=255) ttCGTCTACTCACTGGACCGCCGCTAAGACTTTTGCTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCg > 1:59383/1‑149 (MQ=255) gTCTACTCACTGGACCGCCGCTAAGACTTTTGCTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTc < 4:193792/148‑1 (MQ=255) tACTCACTGGACAGGCGCTAAGACTTTTGCTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCATTACAGAATTACGCTACATCGTCacac > 7:318854/1‑149 (MQ=255) aCTCACTGGACCGCCGCTAAGACTTTTGCTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACt > 1:42350/1‑149 (MQ=255) aCTGGACCGCCGCTAAGACTTTTGCTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGcc > 1:107787/1‑149 (MQ=255) aCTGGACCGCCGCTAAGACTTTTGCTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGcc > 4:224171/1‑149 (MQ=255) gACCGCCGCTAAGACTTTTGCTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAg > 2:232482/1‑148 (MQ=255) gACCGCCGCTAAGACTTTTGCTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAg > 2:153890/1‑148 (MQ=255) ccgccgCTAAGACTTTTGCTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGaa < 2:107787/149‑1 (MQ=255) ccgccgCTAAGACTTTTGCTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGaa < 8:331140/149‑1 (MQ=255) cgccgcTAAGACTTTTGCTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGaa > 4:189010/1‑148 (MQ=255) tAAGACTTTTGCTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAg > 4:194263/1‑139 (MQ=255) tAAGACTTTTGCTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAg < 3:194263/139‑1 (MQ=255) cTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATgcc > 5:178877/1‑149 (MQ=255) tGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATgccgcc > 7:160807/1‑148 (MQ=255) gTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATgccgcc > 2:30487/1‑147 (MQ=255) tCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACTCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAg > 5:185565/1‑149 (MQ=255) tCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAg > 7:209754/1‑149 (MQ=255) acaATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAgcg > 3:363970/1‑149 (MQ=255) acaATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAgcg > 4:204260/1‑149 (MQ=255) aaTTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCt > 2:278742/1‑149 (MQ=255) aaTTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCt < 5:243835/149‑1 (MQ=255) ggCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCAc < 3:204260/149‑1 (MQ=255) ctaGTCTGATAACGTGCGTCTATGGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGTCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGt < 8:318854/147‑1 (MQ=255) cAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGt < 6:54169/149‑1 (MQ=255) aaGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACgg > 5:22185/1‑147 (MQ=255) aGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGa < 1:153890/149‑1 (MQ=255) aGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGa < 6:22185/149‑1 (MQ=255) gTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAg > 7:214791/1‑149 (MQ=255) tGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGcc > 8:339911/1‑148 (MQ=255) cataacgtgcgtccatgaagttgcgggcccagcatagcggctgcaagtcgatagacgcacgttatGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGcc > 1:268053‑M2/66‑148 (MQ=255) CGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGCCAacccac < 2:193202‑M1/149‑1 (MQ=255) cgtgcgtccatgaagttgcgggcccagcatagcggctgcaatcgatagacgcacgttatGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGa > 8:280430‑M2/60‑125 (MQ=255) cgtgcgtccatgaagttgcgggcccagcatagcggctgcaatcgatagacgcacgttatGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGa < 7:280430‑M2/66‑1 (MQ=255) aTCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGCCAACCCACCCTgtcggt > 7:142401/1‑149 (MQ=255) tCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGCCAACCCACCCTgtcggtc < 8:160807/149‑1 (MQ=255) gA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGCCAACCCACCCTgtcg < 8:121800/144‑1 (MQ=255) gA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGCCAACCCACCCTgtcg > 7:121800/1‑144 (MQ=255) a‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGCCGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGACCAGGAACAGCACTTCGGCCATTCCGCCGAGCGCTCTCACGTGAGCCAACCCACACTGTcggtcggt > 7:278152/1‑149 (MQ=255) a‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTc > 5:46345/1‑98 (MQ=255) a‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTc < 6:46345/98‑1 (MQ=255) a‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGCCAACCCACCCTGTcggtcggt < 7:339911/149‑1 (MQ=255) cTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGCCAACCCACCCTGTCGGTCGGT‑GTGAAGAAGCTCGAg < 8:209754/149‑1 (MQ=255) cTGGGACAGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGTACATCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGACAACCCACCCTGTCTGTCGGT‑GTGAATAAGCta < 8:278152/146‑2 (MQ=255) tGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGCCAacccac > 7:6583/1‑120 (MQ=255) tGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGCCAacccac < 8:6583/120‑1 (MQ=255) ggCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGCCAACCCACCCTGTCGGTCGGT‑GTGAAGAAGCTCGAGGAc > 5:277484/1‑149 (MQ=255) cGCAAATTCATGGACGCACGTTATGACACTTACAGAATTACGCTACATAGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTAGGCCATGCCGCCGAGCGATGTAACGTGAGCCAACCCACACTGTCGGTCGGA‑GTGAAGAAGCTCCAGGACGAGc > 7:134388/1‑149 (MQ=255) gCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGCCAACCCACCCTGTCGGTCGGT‑GTGAAGAAGCTCGAGGACGAGCt > 5:91451/1‑149 (MQ=255) aaCTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCAGGTGAGCCAACCCACCCTGTCGGTCGGT‑GTGAAGAAGCTCGAGGACGAGCTTg < 1:278742/149‑1 (MQ=255) cTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGCCAACCCACCCTGTCGGTCGGT‑GTGAAGAAGCTCGAGGACGAGCTTGGc > 5:276596/1‑149 (MQ=255) tCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGCCAACCCACCCTGTCGGTCGGT‑GTGAAGAAGCTCGAGGACGAGCTTg < 2:5378/145‑1 (MQ=255) tCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGCAAACCCACCCTGTCGGTCGGT‑GTGAAGAAGCTCGAGGACGAGCTTggag > 1:5378/1‑146 (MQ=255) aTGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGCCAACCCACCCTGTCGGTCGGT‑GTGAAGAAGCTCGAGGACGAGCTTGGCGTTc < 3:224171/149‑1 (MQ=255) tGGACGCACGTTATGACTCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGCCAACCCACCCTGTCGGTCGGT‑GTGAAGAAGCTCGAGGACGAGCTTGGCGTTCt < 6:185565/149‑1 (MQ=255) acgcaagttatGAACCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTAGCCCAGGAACATCACTTCGGCCATTCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGCCAACCCACCCTGTCGGTCGGTAGTGAAGAAGCTCGAGGACGAGCTTGGCGTTCTg < 1:232482‑M2/137‑1 (MQ=255) acgttatGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGCCAACCCACCCTGTCGGTCGGT‑GTGAAGAAGCTCGAGGACGAGCTTGGCGTTCTGATCTTc < 4:363970‑M2/142‑1 (MQ=255) acgttatGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGCCAACCCACCCTGTCGGTCGGT‑GTGAAGAAGCTCGAGGACGAGCTTGGCGTTCTGATCTTc < 6:277484‑M2/142‑1 (MQ=255) gttatGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGCCAACCCACCCTGTCGGTCGGT‑GTGAAGAAGCTCGAGGACGAGCTTGGCGTTCTGATCTTCGa < 6:178877‑M2/144‑1 (MQ=255) gttatGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCACTGTCACGTGAGCCAACCCACCCTGTCGGTCGGT‑GTGAAGAAGCTCGAGGACGAGCTTGGCGTTCTGATCTTCGa < 6:45855‑M2/144‑1 (MQ=255) | GCACGATTGAAGTCGTGGCACCGTTCGTCTACTCACTGGACCGCCGCTAAGACTTTTGCTTCTGTCACAATTCGGCAAGTCTGATAACGTGCGTCTATCGA‑TTGCAGCCGCTATGCTGGGCCCGCAACTTCATGGACGCACGTTATGACCCTTACAGAATTACGCTACATCGTCACACTCGCCCAGGAACAGCACTTCGGCCATGCCGCCGAGCGCTGTCACGTGAGCCAACCCACCCTGTCGGTCGGT‑GTGAAGAAGCTCGAGGACGAGCTTGGCGTTCTGATCTTCGA > NC_002947/6055730‑6056019 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |