New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 6071622 = | 60 (1.020) | 3 (0.050) | 3/246 | NT | 5.5% | intergenic (‑45/+57) | phoU/pstB‑II | phosphate transport‑associated protein/phosphate ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 6071671 = | 46 (0.820) | intergenic (‑94/+8) | phoU/pstB‑II | phosphate transport‑associated protein/phosphate ABC transporter ATP‑binding protein |
GCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGTACATGAACGCGGTGTAATCCGAAACACGCGCCGCTTGCTG > NC_002947/6071523‑6071816 | gCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGa < 6:114505/149‑1 (MQ=255) ggCGTTGAACTGCTGGGAAAAGTGATGGGTAAGGCGTTCTTTGTAGATCATCGTTTTGTCCTTTTGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAgcgg < 8:146261/149‑1 (MQ=255) gAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCtt < 6:166131/148‑1 (MQ=255) ggAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAg < 5:114578/147‑1 (MQ=255) accgataccctgttcaccaacccggcgaagaagctagaccgaagactacatcaccggtcgctacggctaagcgccgctCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAg < 1:49850‑M1/51‑1 (MQ=255) accgataccctgttcaccaacccggcgaagaagcagaccgaagactacatcaccggtcgctacggctaagcgccgctCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAg > 2:49850‑M1/78‑128 (MQ=255) tgATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGt < 1:114043/148‑1 (MQ=255) gATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGa > 6:319526/1‑149 (MQ=255) aTGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGa < 7:260349/148‑1 (MQ=255) ggTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATg > 4:76543/1‑147 (MQ=255) ggTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTa < 3:340067/149‑1 (MQ=255) ggTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTa > 3:200354/1‑149 (MQ=255) gTAAGGCTTTCGTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTATGAGCGGGTTCACCCGCGAACACAGGCAACCCCGCTGCCACACACCAAGGTGCCTGTTACGCGAGCTCCGATTAGCCGTAGCGACCGGTGAAGTAg > 4:5535/1‑149 (MQ=255) tAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGcc < 4:152798/129‑1 (MQ=255) tAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGcc > 3:152798/1‑129 (MQ=255) tctttGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTc > 6:97901/1‑149 (MQ=255) tgttgATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCt < 7:278932/146‑1 (MQ=255) atcatcGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCttcttc > 7:113463/1‑149 (MQ=255) atcatcGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCttcttc < 2:86586/149‑1 (MQ=255) atcGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTACACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGcc < 5:319526/149‑1 (MQ=255) gTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGt > 2:23547/1‑149 (MQ=255) tCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGt < 5:97901/148‑1 (MQ=255) tCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTg < 3:112739/149‑1 (MQ=255) cTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCTACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGaa > 2:294052/1‑149 (MQ=255) cTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGaa > 2:58182/1‑149 (MQ=255) ttGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGaa > 2:254135/1‑147 (MQ=255) gTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGACTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTc > 8:4908/1‑121 (MQ=255) tAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGt < 4:288846/140‑1 (MQ=255) tAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGt > 3:288846/1‑140 (MQ=255) gcgcGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGggtat > 2:66569/1‑149 (MQ=255) gcgGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGggtatcg < 3:76543/149‑1 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGggtat > 3:229907/1‑141 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGggtat < 4:229907/141‑1 (MQ=255) tGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGtt > 3:347259/1‑126 (MQ=255) ggAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGaa < 3:115532/149‑1 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAAt > 6:189177/1‑149 (MQ=255) cGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCg < 8:113463/149‑1 (MQ=255) ggTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGAc < 1:58182/149‑1 (MQ=255) gTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGAGACCGGTGATGTAGAGCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGAc > 1:116149/1‑149 (MQ=255) ctcgcgaaacaggcaccttggtgtctggcaccggggttgccggtgttcgcgAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCTAGCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGggtatcggt < 1:49850‑M2/78‑1 (MQ=255) ctcgcgaaacaggcaccttggtgtctggcaccggggttgccggtgttcgcgAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGggtatcggt > 2:49850‑M2/52‑128 (MQ=255) ccGCGAACGCCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCgg < 2:154749/106‑1 (MQ=255) ccGCGAACGCCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCgg > 1:154749/1‑106 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTg > 1:167812/1‑149 (MQ=255) CGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGc > 4:200354‑M1/1‑149 (MQ=255) gcgaaacaggcaccttggtgtctggcacgggggttgccggtgttcgagAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGcc > 1:211424‑M2/49‑149 (MQ=255) CGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGccc > 1:158694‑M1/1‑149 (MQ=255) gCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGTACAt > 5:130565/1‑148 (MQ=255) ccccGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGTACATGAAcg < 1:66569/149‑1 (MQ=255) cGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGtt < 4:29986/128‑1 (MQ=255) cGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGtt > 3:29986/1‑128 (MQ=255) ggTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGTACATGAACGCGgt < 1:254135/149‑1 (MQ=255) ccAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGTACATGAACGCGGTGTAATCCGaaa < 1:23547/149‑1 (MQ=255) aGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGTACATGAACGCGGTGTAATCCGAAacac < 6:130565/149‑1 (MQ=255) aGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGTACATGAACGCGGTGTAATCCGAAacac < 5:189177/149‑1 (MQ=255) tGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAgg < 7:311752/78‑1 (MQ=255) tGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAgg > 8:311752/1‑78 (MQ=255) gTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGAACGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGTACATGAACGCGGTGTAATCCGAAACACGCGCCGCt > 6:176193/1‑149 (MQ=255) gcgAGTGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGTACATGAACGCGGTGTAATCCGAAACACGCGCCGCTtgctg > 2:241006‑M2/4‑149 (MQ=255) | GCTCGGCGTTGAACTGCTGGGAAATGTGATGGGTAAGGCTTTCTTTGTTGATCATCGTTTTGTCCTTTGGTAGCGCGGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCAGACACCAAGGTGCCTGTTTCGCGAGCGGCGCTTAGCCGTAGCGACCGGTGATGTAG‑TCTTCGGTCT‑GCTTCTTCGCCGGGTTGGTGAACAGGGTATCGGTATCCCCGAATTCGACCAGTTTGCCCATGTACATGAACGCGGTGTAATCCGAAACACGCGCCGCTTGCTG > NC_002947/6071523‑6071816 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |