New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 937436 | 44 (0.850) | 4 (0.080) | 4/250 | NT | 8.8% | coding (8186/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
? | NC_002947 | = 937482 | 41 (0.830) | coding (8140/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
CCCACCACGACACTGCCCAGTACAGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTG > NC_002947/937292‑937582 | cccACCACGACACTGCCCAGTACAGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTgcggc < 3:203005/149‑1 (MQ=255) accacGACACTGCCCAGTACAGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGAc > 6:51807/1‑149 (MQ=255) cacGACACTGCCCAGTACAGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCt > 3:310166/1‑149 (MQ=255) acacTGCCCAGTACAGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCAc < 8:241900/149‑1 (MQ=255) aGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAgg < 4:244970/149‑1 (MQ=255) aGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAgg > 2:304847/1‑149 (MQ=255) aTCGGCGGCCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGgcgatcgacaacaacggcacctcgtcgttgccggtg > 7:172024‑M1/1‑113 (MQ=255) ggcggcCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTTCACCGGCAACGACGAGGTGCCGttgttg < 2:195377/148‑1 (MQ=255) gcggcCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTgc > 4:33295/1‑110 (MQ=255) gcggcCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTgc < 3:33295/110‑1 (MQ=255) gcCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGAt > 6:122211/1‑149 (MQ=255) cAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCgttgtt < 4:245191/141‑1 (MQ=255) cAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCgttgtt > 3:245191/1‑141 (MQ=255) cAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCg > 6:100341/1‑149 (MQ=255) aGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGc < 2:6444/149‑1 (MQ=255) cacGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGgcgatcgacaacaacggcacctcgtcgttgccggtgcaggtcgccgcacc < 8:172024‑M1/149‑51 (MQ=255) gacggTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGttgttg < 2:104717/133‑1 (MQ=255) gacggTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGCCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGttgttg > 1:104717/1‑133 (MQ=255) tgcctgcTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAAc > 3:177670/1‑149 (MQ=255) gcctgcTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGt > 2:22131/1‑140 (MQ=255) gcctgcTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGt < 1:22131/140‑1 (MQ=255) ctgcTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGttgttg > 2:69892/1‑122 (MQ=255) ctgcTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGttgttg < 1:69892/122‑1 (MQ=255) ggCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCTGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTg < 3:27095/148‑1 (MQ=255) ccGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGc < 1:304847/149‑1 (MQ=255) gCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCg < 4:23017/149‑1 (MQ=255) cTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCgg < 4:177670/149‑1 (MQ=255) tGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCgg > 6:308367/1‑148 (MQ=255) acgacgGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGta > 2:246038/1‑148 (MQ=255) acgacgGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGt < 5:100341/147‑1 (MQ=255) cgacgGTACCATCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGt > 3:109676/1‑146 (MQ=255) cgacgGTACCATCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGt < 4:109676/146‑1 (MQ=255) gacgGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCcaccac < 6:23600/114‑1 (MQ=255) gacgGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCcaccac > 5:23600/1‑114 (MQ=255) gacgGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGtat > 3:213972/1‑147 (MQ=255) gTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACgg > 2:328112/1‑149 (MQ=255) cACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGgcgatcgacaacaacggcacctcgtcgttgccggtgcaggtcgccgcacca > 3:41473‑M1/1‑48 (MQ=255) cACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGgcgatcgacaacaacggcacctcgtcgttgccggtgcaggtcgccgcacca < 4:41473‑M1/99‑52 (MQ=255) cACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAg < 4:213972/149‑1 (MQ=255) cACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAg > 5:276729/1‑149 (MQ=255) cACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAg < 3:301037/149‑1 (MQ=255) tGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATAGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTg > 2:276525/1‑149 (MQ=255) ttGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGccc > 3:141966/1‑149 (MQ=255) cctgATCGCTTGTCTCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGGGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCTCCAGCACGTCCAGCAACTCGACATTGGCCTTGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGTTGCCCTct < 8:18129/146‑2 (MQ=255) tCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGcacc < 6:276729/149‑1 (MQ=255) ttGGCTCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCt < 1:207231/138‑1 (MQ=255) ttGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCCCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCt > 2:207231/1‑138 (MQ=255) acaGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGc > 2:35721/1‑148 (MQ=255) ggTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGAc > 4:170058/1‑147 (MQ=255) tGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTg < 5:308367/149‑1 (MQ=255) tCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGCGcc > 7:14583/1‑149 (MQ=255) tGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCcaccagacatcaccgcgcctgtggcgccaagcgatctggcaatcagtg > 3:41473‑M2/1‑51 (MQ=255) tGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCcaccagacatcaccgcgcctgtggcgccaagcgatctggcaatcagtg < 4:41473‑M2/99‑49 (MQ=255) ggTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCcaccagacatcaccgcgcctgtggcgccaagcgatctggcaatcagtggcgacggtaccgtcgtcagcggccgcgccgaagcaggcagcaccgtccgtg < 8:172024‑M2/149‑100 (MQ=255) gTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTg < 2:119287/149‑1 (MQ=255) | CCCACCACGACACTGCCCAGTACAGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTG > NC_002947/937292‑937582 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |