New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 937436 | 44 (0.850) | 4 (0.080) | 4/250 | NT | 8.8% | coding (8186/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
? | NC_002947 | = 937482 | 41 (0.830) | coding (8140/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
AGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACGCGGCTACCAGCAGGAGCAGAACCGCTGA > NC_002947/937334‑937628 | aGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGc < 2:6444/149‑1 (MQ=255) tgcctgcTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAAc > 3:177670/1‑149 (MQ=255) gcctgcTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGt < 1:22131/140‑1 (MQ=255) gcctgcTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGt > 2:22131/1‑140 (MQ=255) ggCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCTGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTg < 3:27095/148‑1 (MQ=255) ccGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGc < 1:304847/149‑1 (MQ=255) gCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCg < 4:23017/149‑1 (MQ=255) cTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCgg < 4:177670/149‑1 (MQ=255) tGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCgg > 6:308367/1‑148 (MQ=255) acgacgGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGta > 2:246038/1‑148 (MQ=255) acgacgGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGt < 5:100341/147‑1 (MQ=255) cgacgGTACCATCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGt < 4:109676/146‑1 (MQ=255) cgacgGTACCATCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGt > 3:109676/1‑146 (MQ=255) gacgGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCcaccac > 5:23600/1‑114 (MQ=255) gacgGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCcaccac < 6:23600/114‑1 (MQ=255) gacgGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGtat > 3:213972/1‑147 (MQ=255) gTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACgg > 2:328112/1‑149 (MQ=255) cACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAg < 4:213972/149‑1 (MQ=255) cACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAg < 3:301037/149‑1 (MQ=255) cACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAg > 5:276729/1‑149 (MQ=255) tGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATAGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTg > 2:276525/1‑149 (MQ=255) ttGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGccc > 3:141966/1‑149 (MQ=255) cctgATCGCTTGTCTCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGGGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCTCCAGCACGTCCAGCAACTCGACATTGGCCTTGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGTTGCCCTct < 8:18129/146‑2 (MQ=255) tCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGcacc < 6:276729/149‑1 (MQ=255) ttGGCTCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCt < 1:207231/138‑1 (MQ=255) ttGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCCCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCt > 2:207231/1‑138 (MQ=255) acaGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGc > 2:35721/1‑148 (MQ=255) ggTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGAc > 4:170058/1‑147 (MQ=255) tGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTg < 5:308367/149‑1 (MQ=255) tCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGCGcc > 7:14583/1‑149 (MQ=255) tGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCcaccagacatcaccgcgcctgtggcgccaagcgatctggcaatcagtg > 3:41473‑M2/1‑51 (MQ=255) tGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCcaccagacatcaccgcgcctgtggcgccaagcgatctggcaatcagtg < 4:41473‑M2/99‑49 (MQ=255) ggTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCcaccagacatcaccgcgcctgtggcgccaagcgatctggcaatcagtggcgacggtaccgtcgtcagcggccgcgccgaagcaggcagcaccgtccgtg < 8:172024‑M2/149‑100 (MQ=255) gTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTg < 2:119287/149‑1 (MQ=255) cgACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGAt > 2:78847/1‑121 (MQ=255) cgACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGAt < 1:78847/121‑1 (MQ=255) aCCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTGGCATCATg < 3:170058/149‑1 (MQ=255) cTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCa > 1:112364/1‑149 (MQ=255) cACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCcaccagacatcaccgcgcctgtggcgccaagcgatctggcaatcagtggcgacggtaccgtcgtcagcggccgcgccgaagcaggcagcaccgtccgtgtgctggccgccgat > 7:172024‑M2/1‑36 (MQ=255) cAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCAcgc < 4:310166/149‑1 (MQ=255) gtcgaGGTGCCGGTGTTGTCGATCTCCACGACGTCACGCACCTCTGCCTTGGCTTGGTCCGGTATACGTACCACGGTGAAGGTGCCATCGGCACCCACGACGAGGGTAACGATGAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACTCGGCt < 8:55028/147‑1 (MQ=255) aGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACGCGGCTAc > 2:321205/1‑147 (MQ=255) ggTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACGCGGCTACcag > 6:14599/1‑149 (MQ=255) gTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACGCGGCTACcag > 3:308648/1‑148 (MQ=255) gCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACGCGGCTACcagcag > 8:106296/1‑149 (MQ=255) ccGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACGCGGCTACcagcag < 2:112364/148‑1 (MQ=255) ttggtCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTGGCATCATg < 2:281218/117‑1 (MQ=255) gttgtCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACGCGGCTACCAGCAGGAgta < 1:246038/148‑3 (MQ=255) gtCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGTCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACGCGGCTACCAGCAGGAGCAGAAc > 6:168255/1‑149 (MQ=255) tCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTg > 4:206771/1‑102 (MQ=255) aTCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGACGGTGCCCTCGCCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACGCGGCTACCAGCAGGAGCAGAACCGCt > 1:198483/1‑149 (MQ=255) aTCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACGCGGCTACCAGCAGGAGCAGAACCGCt > 7:187495/1‑149 (MQ=255) ccaccaCGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACGCGGCTACCAGCAGGAGCAGAACCGCTGa > 7:286607/1‑147 (MQ=255) ccaccaCGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACGCGGCTACCAGCAGGAGCAGAACCGCTGa < 8:286607/147‑1 (MQ=255) | AGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACGCGGCTACCAGCAGGAGCAGAACCGCTGA > NC_002947/937334‑937628 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |