New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1410031 = | 48 (0.930) | 5 (0.100) | 4/250 | NT | 10.6% | coding (701/1059 nt) | nadA | quinolinate synthase iron‑sulfur cluster subunit |
? | NC_002947 | 1410076 = | 38 (0.770) | coding (746/1059 nt) | nadA | quinolinate synthase iron‑sulfur cluster subunit |
ACATCCAGAAGCAAACCGGTGCCGACATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTACAAGATGCAGCAGTTGTGCCCGGACAAGGAATTCGTCGAAGC > NC_002947/1409884‑1410178 | aCATCCAGAAGCAAACCGGTGCCGACATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑Gt < 2:204237/148‑1 (MQ=255) aatgcgcacagctgcggcatgccgcgccgttgccggcggtgggggcttcgacgaattccttgtccgggcacaactgctgcatcttgtagaagatgccgcggtcggtggcgacgatgaaggttttgttcggcagggtctgggcagcctt < 3:221231‑M1/1‑1 (MQ=255) tgcgcacagctgcggcatgccgcgccgttgccggcggtgggggcttcgacgaattccttgtccgggcacaactgctgcatcttgtagaagatgccgcggtcggtggcgacgatgaaggttttgttcggcagggtctgggcagcctTGAt > 5:185863‑M1/146‑149 (MQ=255) cAGAAGCAAACCGGTGCCGACATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATc > 2:96087/1‑147 (MQ=255) gcacagctgcggcatgccgcgccgttgccggcggtgggggcttcgacgaattccttgtccgggcacaactgctgcatcttgtagaagatgccgcggtcggtggcgacgatgaaggttttgttcggcagggtctgggcagcctTGATc < 3:249956‑M1/5‑1 (MQ=255) aaaCCGGTGCCGACATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGCGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGcc > 7:182858/1‑149 (MQ=255) aaaCCGGTGCCGACATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGcc > 1:294434/1‑149 (MQ=255) gcggcatgccgcgccgttgccggcggtgggggcttcgacgaattccttgtccgggcacaactgctgcatcttgtagaagatgccgcggtcggtggcgacgatgaaggttttgttcggcagggtctgggcagcctTGAt < 1:140025‑M1/4‑1 (MQ=255) gcggcatgccgcgccgttgccggcggtgggggcttcgacgaattccttgtccgggcacaactgctgcatcttgtagaagatgccgcggtcggtggcgacgatgaaggttttgttcggcagggtctgggcagcctTGAt > 2:140025‑M1/135‑138 (MQ=255) ggTGCCGACATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGAcgc < 4:152622/149‑1 (MQ=255) gTGCCGACATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCACTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGAcgcg > 5:209293/1‑149 (MQ=255) gCCGACATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGt < 2:64652/149‑1 (MQ=255) gACATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTggg < 3:157471/149‑1 (MQ=255) tgctgcTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTcc < 1:96087/149‑1 (MQ=255) tgctgTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTccac > 5:60942/1‑148 (MQ=255) ctgTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTccacca < 2:155808/148‑1 (MQ=255) tgtgGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCAccagc > 7:213178/1‑149 (MQ=255) gggACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCAccagccag > 2:86375/1‑149 (MQ=255) tGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCt > 7:19827/1‑110 (MQ=255) tGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCt < 8:19827/110‑1 (MQ=255) gCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTg < 4:57135/110‑1 (MQ=255) gCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTg > 3:57135/1‑110 (MQ=255) gCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCt > 6:22565/1‑149 (MQ=255) cgacgaattccttgtccgggcacaactgctgcatcttgtagaagatgccgcggtcggtggcgacgatgaaggttttgttcggcagggtctgggcagcctTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAgg > 4:249956‑M1/100‑147 (MQ=255) tCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCACTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGcc < 6:209293/149‑1 (MQ=255) gTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCACTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGCGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGcc < 1:86375/148‑1 (MQ=255) tCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGa > 1:154980/1‑149 (MQ=255) ttccttgtccgggcacaactgctgcatcttgtagaagatgccgcggtcggtggcgacgatgaaggttttgttcggcagggtctgggcagcctTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAgg < 1:112606‑M1/48‑1 (MQ=255) ttccttgtccgggcacaactgctgcatcttgtagaagatgccgcggtcggtggcgacgatgaaggttttgttcggcagggtctgggcagcctTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAgg > 2:112606‑M1/93‑140 (MQ=255) aCGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGAc < 6:60942/148‑1 (MQ=255) ttCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCt < 4:41694/122‑1 (MQ=255) ttCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCt > 3:41694/1‑122 (MQ=255) ttCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAg < 5:85982/129‑1 (MQ=255) ttCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAg > 6:85982/1‑129 (MQ=255) ttCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGaa > 2:232220/1‑149 (MQ=255) cgggcacaactgctgcatcttgtagaagatgccgcggtcggtggcgacgatgaaggttttgttcggcagggtctgggcagcctTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGAt > 8:207608‑M1/84‑126 (MQ=255) cgggcacaactgctgcatcttgtagaagatgccgcggtcggtggcgacgatgaaggttttgttcggcagggtctgggcagcctTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGAt < 7:207608‑M1/43‑1 (MQ=255) cAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAAc > 3:125115/1‑148 (MQ=255) gTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACaaaa > 2:36200/1‑149 (MQ=255) tCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAAc < 5:22565/149‑1 (MQ=255) cgcCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCtt < 7:130630/149‑1 (MQ=255) cgcCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCtt > 6:137713/1‑149 (MQ=255) aCATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCacc > 5:69607/1‑149 (MQ=255) gcgcTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGGCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCgg < 1:232220/149‑1 (MQ=255) gcgcTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCgg < 5:137713/149‑1 (MQ=255) cgcTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTACCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGc < 2:294434/149‑1 (MQ=255) gcTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCa > 3:83613/1‑149 (MQ=255) aCCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTc < 1:172786/122‑1 (MQ=255) aCCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACAAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTc > 2:172786/1‑122 (MQ=255) tgcGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTACAAGATg > 3:10166/1‑148 (MQ=255) cGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTACAAGATgc < 2:154980/147‑1 (MQ=255) gATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTACAAGATgcag > 3:237222/1‑148 (MQ=255) tCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTACAAGATGcagcag > 8:245697/1‑149 (MQ=255) tGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTACAAGATGCAGCAGTtg > 1:252418/1‑149 (MQ=255) ccccGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTACAAGATGCAGCAGTTGTGCCCgg < 2:252418/149‑1 (MQ=255) ccGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTACAAGATGCAGCAGTTGTGCCCGGa > 3:291404/1‑148 (MQ=255) tCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTACAAGATGCAGCAGTTGTGCCCGGACAAgg > 3:54532/1‑148 (MQ=255) ccGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTACAAGATGCAGCAGTTGTGCCCGGACAAGGAAtt > 2:203247/1‑149 (MQ=255) cGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTACAAGATGCAGCAGTTGTGCCCGGACAAGGAATtc < 1:36200/149‑1 (MQ=255) aaGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTACAAGATGCAGCAGTTGTGCCCGGACAAGGAATtcgtc < 8:182858/149‑1 (MQ=255) cG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTACAAGATGCAGCAGTTGTGCCCGGACAAGGAATtcgtcg > 5:239578/1‑147 (MQ=255) gTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTACAAGATGCAGCAGTTGTGCCCGGACAAGGAATTCGTCGAAGc > 2:312805/1‑149 (MQ=255) | ACATCCAGAAGCAAACCGGTGCCGACATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCG‑GTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTACAAGATGCAGCAGTTGTGCCCGGACAAGGAATTCGTCGAAGC > NC_002947/1409884‑1410178 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |