New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1602950 = | 39 (0.760) | 4 (0.080) | 4/240 | NT | 9.8% | coding (797/1215 nt) | PP_5469 | SAM‑dependent methyltransferase |
? | NC_002947 | 1603031 = | 38 (0.800) | coding (878/1215 nt) | PP_5469 | SAM‑dependent methyltransferase |
TTTGGGCCGCGACGCACAGGTCACCGGCGTGGAGCTGCGCCAGGACATGGTCGACCTGTGCAACGCCGCGGCCGCACGCCTCGACCACCCAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCTGCAACGCCGCGATCATCATGTGCTCGCCGTGCTGCCACAAGCAGATCCGCCCGCAACTGCACAGCCCGGGGT > NC_002947/1602804‑1603084 | acaggcttccaggtacagcgcacgcaggctgtcggtcagcatttcggcctgctggcccaggtgcaggccgtactgcagcatgggttgcagcaaccccgggctgtgcagttgcgggcggatctgcttgtggcagcacggcgagcacatga < 1:136730‑M1/3‑1 (MQ=255) acaggcttccaggtacagcgcacgcaggctgtcggtcagcatttcggcctgctggcccaggtgcaggccgtactgcagcatgggttgcagcaaccccgggctgtgcagttgcgggcggatctgcttgtggcagcacggcgagcacatga < 5:44334‑M1/3‑1 (MQ=255) gCCGCGACGCACAGGTCACCGGCGTGGAGCTGCGCCAGGACATGGTCGACCTGTGCAACGCCGCGGCCGCACGCCTCGACCACCCAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATc < 5:265895/149‑1 (MQ=255) gCCGCGACGCACAGGTCACCGGCGTGGAGCTGCGCCAGGACATGGTCGACCTGTGCAACGCCGCGGCCGCACGCCTCGACCACCCAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATc < 4:225687/149‑1 (MQ=255) ccGCGACACACAGGTCACCGGCGTGGAGCTGCGCCAGGACATGGTCGACCTGTGCAACGCCGCGGCCGCACGCCTCGACCACCCAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCg > 8:282182/1‑149 (MQ=255) ccaggtacagcgcacgcaggctgtcggtcagcatttcggcctgctggcccaggtgcaggccgtactgcagcatgggttgcagcaaccccgggctgtgcagttgcgggcggatctgcttgtggcagcacggcgagcacaTGATGATCGc > 6:234742‑M1/139‑148 (MQ=255) acacacaGGTCACCGGCGTGGAGCTGCGCCAGGACATGGTCGACCTGTGCAACGCCGCGGCCGCACGCCTCGACCACCCAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTg < 7:282182/146‑1 (MQ=255) acaGGTCACCGGCGTGGAGCTGCGCCAGGACATGGTCGACCTGTGCAACGCCGCGGCCGCACGCCTCGACCACCCAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATg > 3:235735/1‑149 (MQ=255) gcgcacgcaggctgtcggtcagcatttcggcctgctggcccaggtgcaggccgtactgcagcatgggttgcagcaaccccgggctgtgcagttgcgggcggatctgcttgtggcagcacggcgagcacaTGATGATCGCCTTGCATGcc < 5:41451‑M1/20‑1 (MQ=255) aGGTCACCGGCGTGGAGCTGCGCCAGGACATGGTCGACCTGTGCAACGCCGCGGCCGCACGCCTCGACCACCCAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGcc > 6:28560/1‑149 (MQ=255) gcACCGGCGTGGAGCTGCGCCAGGACATGGTCGACCTGTGCAACGCCGCGGCCGCACGCCTCGACCACCCAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCtgt < 4:29315/148‑1 (MQ=255) aCCGGCGTGGAGCTGCGCCAGGACATGGTCGACCTGTGCAACGCCGCGGCCGCACGCCTCGACCACCCAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGa > 3:292436/1‑149 (MQ=255) caGCTGCGCCAGGACATGGTCGACCTGTGCAACGCCGCGGCCGCACGCCTCGACCACACAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGAGCGCAGCGTGGTGCAGGAGGCCATCGAGGTGATGCTCGCCTAGCATCCCTGTGACATCGCCAc > 8:113369/2‑149 (MQ=255) cggcctgctggcccaggtgcaggccgtactgcagcatgggttgcagcaaccccgggctgtgcagttgcgggcggatctgcttgtggcagcacggcgagcacatgatg > 2:200399‑M1/103‑107 (MQ=255) cggcctgctggcccaggtgcaggccgtactgcagcatgggttgcagcaaccccgggctgtgcagttgcgggcggatctgcttgtggcagcacggcgagcacatgatg < 1:200399‑M1/5‑1 (MQ=255) aCCTGTGCAACGCCGCGGCCGCACGCCTCGACCACCCAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTgg > 1:52988/1‑148 (MQ=255) ccaggtgcaggccgtactgcagcatgggttgcagcaaccccgggctgtgcagttgcgggcggatctgcttgtggcagcacggcgagcacaTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATc < 6:26246‑M1/59‑1 (MQ=255) aaCGCCGCGGCCGCACGCCTCGACCACCCAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCcaca > 3:149027/1‑136 (MQ=255) aaCGCCGCGGCCGCACGCCTCGACCACCCAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCcaca > 5:110590/1‑136 (MQ=255) aaCGCCGCGGCCGCACGCCTCGACCACCCAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCcaca < 4:149027/136‑1 (MQ=255) aaCGCCGCGGCCGCACGCCTCGACCACCCAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCcaca < 6:110590/136‑1 (MQ=255) gccgcGGCCGCACGCCTCGACCACCCAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCTGCaa > 8:124947/1‑149 (MQ=255) ccgcGGCCGCACGCCTCGACCACCCAGGCCACCAGTTCCAGTGAGCTGATGTGCGCAGCGTGGTTCCTGAGGCCATCGAGGAGATGATCCCCAAGCATGCCAGTCACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCAACCGCTGCAAc > 8:91040/1‑149 (MQ=255) cgcgGCCGCACGCCTCGACCACCCAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCt < 5:153859/143‑1 (MQ=255) cgcgGCCGCACGCCTCGACCACCCAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCt > 6:153859/1‑143 (MQ=255) ctgcagcatgggttgcagcaaccccgggctgtgcagttgcgggcggatctgcttgtggcagcacggcgagcacaTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCTGCAACGCCGCGa > 5:26246‑M1/75‑149 (MQ=255) gCACGCCTCGACCACCCAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTg < 1:316848/127‑1 (MQ=255) gCACGCCTCGACCACCCAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTg > 2:316848/1‑127 (MQ=255) gcatgggttgcagcaaccccgggctgtgcagttgcgggcggatctgcttgtggcagcacggcgagcacaTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCTGCAACGCCGCGatcatc > 6:41451‑M1/70‑149 (MQ=255) ccAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCTGc > 1:222068/1‑123 (MQ=255) ccAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCTGc < 2:222068/123‑1 (MQ=255) ccAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCTGCAACGCCGCGATCATCATGTGCTCGcc > 5:291217/1‑149 (MQ=255) ggCCTTGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGGGATGATCGCCTTGCATGCCTGGGACATCGCGACCGACTACGCCATGCACACTGGCATCCGCTGCAACGCCGCGATCATCATGTGCTCGCCGtg < 7:113369/149‑1 (MQ=255) cTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCTGCAACGCCGCGATCATCATGTGCTCGCCGtgctg > 1:178735/1‑149 (MQ=255) gAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCTGCAACGCCGCGATCATCATGTGCTCGCCGtgctgc < 5:39530/147‑1 (MQ=255) cAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCTGCAACGCCGCGATCATCATGTGCTCGCCGTGCTGCCACAAGc < 4:292436/148‑1 (MQ=255) cAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCTGCAACGCCGCGATCATCATGTGCTCGCCGTGCTGCCACAAGCa < 7:124947/149‑1 (MQ=255) cAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCTGCAACGCCGCGAGCATCATGTGCTCGCCGTGCTGCCACAAg > 6:24798/1‑147 (MQ=255) gtgtGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCTGCAACGCCGCGATCATCATGTGCTCGCCGTGCTGCCACAAGCAGa < 5:28560/149‑1 (MQ=255) tgATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCTGCAACGCCGCGATCATCATGTGCTCGCCGtgctgc > 2:285718/1‑133 (MQ=255) tgATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCTGCAACGCCGCGATCATCATGTGCTCGCCGtgctgc < 1:285718/133‑1 (MQ=255) aTGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCTGCAACGCCGCGATCATCATGTGCTCGCCGTGCTGCCACAAGCAGATccgcccg > 1:324476/1‑149 (MQ=255) aTGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCTGCAACGCCGCGATCATCATGTGCTCGCCGTGCTGCCACAAGCAGATccgccc < 6:291217/148‑1 (MQ=255) gcAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCTGCAACGCCGCGATCATCATGTGCTCGCCGTGCTGCCACAAGCAGATCCGCCCGCAACTg > 6:24021/1‑149 (MQ=255) aGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGATGTGATGCTCGCCTTGGATGCCTGTGACTTCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCTGCAACGCCGCGATCATCATGTGCTCGCCGTGCTGCCACAAGCAGATCCGCCCGCAACTGca < 7:91040/149‑1 (MQ=255) gtggtgCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCTTCCACACTGGCATCCGCTGCAACGCCGCGATCATCATGTGCTCGCCGTGCTGCCACAAGCAGATCCGCCCGCAACTGCACAg > 5:249639/1‑149 (MQ=255) gCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCTGCAACGCCGCGATcatcat > 2:169992/1‑99 (MQ=255) tGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCTGCAACGCCGCGATCATCATGTGCTCGCCGTGCTGCCACAAGCAGATCCGCCCGCAACTGCACAGCCCGGGGt > 6:44334/1‑149 (MQ=255) | TTTGGGCCGCGACGCACAGGTCACCGGCGTGGAGCTGCGCCAGGACATGGTCGACCTGTGCAACGCCGCGGCCGCACGCCTCGACCACCCAGGCCTGGAGTTCCAGTGTGGTGATGTGCGCAGCGTGGTGCCTGAGGCCATCGAGGTGATGATCGCCTTGCATGCCTGTGACATCGCCACCGACTACGCCATCCACACTGGCATCCGCTGCAACGCCGCGATCATCATGTGCTCGCCGTGCTGCCACAAGCAGATCCGCCCGCAACTGCACAGCCCGGGGT > NC_002947/1602804‑1603084 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |