New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1607270 | 49 (0.950) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 5.9% | coding (264/888 nt) | PP_1408 | (R)‑3‑hydroxydecanoyl‑ACP:CoA transacylase |
? | NC_002947 | = 1607299 | 49 (1.000) | coding (235/888 nt) | PP_1408 | (R)‑3‑hydroxydecanoyl‑ACP:CoA transacylase |
GCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCACGTTGAACTGTGGGTGCAGGTTACGTACCGTCTGGGCGAACGAGGCCGTG > NC_002947/1607126‑1607417 | gcgcATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTc > 7:169026/1‑147 (MQ=255) cATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAagga < 8:169026/149‑1 (MQ=255) gCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTcc > 3:247903/1‑149 (MQ=255) cGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCt > 6:274202/1‑149 (MQ=255) cGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCt < 7:196940/149‑1 (MQ=255) gaacgaacTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTgc > 2:201095‑M2/1‑147 (MQ=255) cTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTTCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTTGTCTGCCTTGAAGTGCTCGATCAGGaaggagaccgaggcgcatatcctccttgagctgatcga < 8:11330‑M1/149‑39 (MQ=255) accacTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCaaggagaccgaggcgcatatcctccttgagctgatcgagca < 4:238032‑M1/149‑42 (MQ=255) accacTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCaaggagaccgaggcgcatatcctccttgagctgatcgagc < 3:192545‑M1/148‑41 (MQ=255) accacTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCg > 8:9843/1‑149 (MQ=255) ccTTCTTCCCGTACCTCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGa < 4:42845/149‑1 (MQ=255) ttcttcACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTc < 6:234951/143‑1 (MQ=255) ttcttcACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTc > 5:234951/1‑143 (MQ=255) ttcttcACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACg > 5:183108/1‑149 (MQ=255) tcACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTtg > 5:106617/1‑149 (MQ=255) aCGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGAGCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTtgtg > 7:88887/1‑149 (MQ=255) aCCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATgc > 2:234328/1‑104 (MQ=255) aCCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATgc < 1:234328/104‑1 (MQ=255) aCCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGc > 3:318712/1‑149 (MQ=255) ccGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCt > 2:268295/1‑149 (MQ=255) cgcgGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCtt > 6:181911/1‑149 (MQ=255) cgcgGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCtt > 6:263313/1‑149 (MQ=255) cgcgGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCtt < 4:318712/149‑1 (MQ=255) gcgGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTg > 1:251038/1‑149 (MQ=255) ggCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGa < 7:183127/149‑1 (MQ=255) gCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGtt < 1:153885/136‑1 (MQ=255) gCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGtt > 2:153885/1‑136 (MQ=255) cTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGATTGGACt > 8:64831/1‑149 (MQ=255) gTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACtt < 5:274202/147‑1 (MQ=255) gTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCCCCACCCCACGAAAAAGACATACCGTGGGCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGc < 4:247903/149‑1 (MQ=255) cgccagcgccagCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTg < 5:165974/123‑1 (MQ=255) cgccagcgccagCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTg > 6:165974/1‑123 (MQ=255) ccagcgccagcAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGaa < 3:260666/149‑1 (MQ=255) cagcgccagcAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGaa > 5:40512/1‑148 (MQ=255) agcgccagcAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATa < 2:251038/149‑1 (MQ=255) gccagcAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGc < 4:119498/139‑1 (MQ=255) gccagcAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGc > 3:119498/1‑139 (MQ=255) gccagcAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACgg < 6:183108/149‑1 (MQ=255) ccagcAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTACTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGc < 5:291782/149‑1 (MQ=255) tGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGaa > 5:249645/1‑148 (MQ=255) gcCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCa > 4:255952/1‑149 (MQ=255) ccACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTc > 2:271225/1‑95 (MQ=255) ccACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCAc < 8:259399/149‑1 (MQ=255) cccACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCACGTTg < 7:9843/149‑1 (MQ=255) cACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGGAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCACGTTGaa > 2:11594/1‑149 (MQ=255) cACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCTGTCTCCTTGCTGATCAGACGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTAGACTTGCCTGAATACGGATGGTCGAACAGAACAACGTTGa > 6:182129/1‑148 (MQ=255) aCGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTcc > 2:194409/1‑71 (MQ=255) aCGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTcc < 1:194409/71‑1 (MQ=255) aCGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTAGACTTGCCTGAATACGTCTGGTCGAACAGAACCACGTTGAACTGTTGGTGCAGGtt < 5:182129/149‑1 (MQ=255) ccTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCACGTTGAACTGTGGGTGCAGGTTACGTACCGt < 5:181911/148‑1 (MQ=255) cTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCACGTTGAACTGTGGGTGCAGGTTACGTACCGTCt < 5:263313/149‑1 (MQ=255) gAAGTGCTCGATCAGCTCACGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCACGTTGAACTGTGGGTGCAGGTTACGTACCGTCTg < 6:106617/147‑1 (MQ=255) tGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTgctgatcgagcacttccaggcagaccacgtgatgtctttttcgtggggtggcgcaagcacgctgctggcgctggcgcaccagccgcggtacgtgaagaaggcagtggt < 4:238032‑M2/149‑109 (MQ=255) gCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTgctgatcgagcacttccaggcagaccacgtgatgtctttttcgtggggtggcgcaagcacgctgctggcgctggcgcaccagccgcggtacgtgaagaaggcagtggt < 3:192545‑M2/148‑109 (MQ=255) tCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTcctgatcgagcacttcaaggcagacaacgtgatgtctttttcgtggggtggcgaaagcacgctgctggcgctggcgcaccagccgcggtacgtgaagaaggcagtggtgag < 8:11330‑M2/149‑112 (MQ=255) tCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCACGTTGAACTGTGGGTGCAGGTTACGTACCGTCTGGGCGAAc > 5:187521/1‑147 (MQ=255) gATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTCACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCACGTTGAACTGTGGGTGCAGGTTACGTACCGTCTGGGCGAACGAgg < 1:268295/149‑1 (MQ=255) gCaaggagaccgaggcgcatatcctccttgagctgatcgagcacttccaggcagaccacgtgatgtctttttcgtggggtggcgcaagcacgctgctggcgctggcgcaccagccgcggtacgtgaagaaggcagtggtgagttcgttc > 2:201095‑M1/1‑2 (MQ=255) gCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCACGTTGAACTGTGGGTGCAGGTTACGTACCGTCTGGGCGAACGAGGCCgtg < 8:88887/149‑1 (MQ=255) gCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCACGTTGAACTGTGGGTGCAGGTTACGTACCGTCTGGGCGAACGAGGCCgtg < 1:11594/149‑1 (MQ=255) | GCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGGCTGGTGCGCCAGCGCCAGCAGCGTGCTTGCGCCACCCCACGAAAAAGACATCACGTGGTCTGCCTGGAAGTGCTCGATCAGCTCAAGGAGGATATGCGCCTCGGTCTCCTTGCTGATCAGCCGTTCCTGACGGTTGTGCGGCTTGGACTTGCCTGAATACGGCTGGTCGAACAGAACCACGTTGAACTGTGGGTGCAGGTTACGTACCGTCTGGGCGAACGAGGCCGTG > NC_002947/1607126‑1607417 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |