New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
CCATGATTAGAAATGGCTGTAAAGCGATTTTTTATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCT‑TGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAG > NC_002947/2356903‑2357197 | ccATGATTAGAAATGGCTGTAAAGCGATTTTTTATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCT‑TGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATg > 5:177477/1‑149 (MQ=255) cATGATTAGAAATGGCTGTAAAGCGATTTTTTATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCT‑TGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGc > 7:255045/1‑149 (MQ=255) ccagttcaaggtcgtgcgcatcgaaggcgaattcatctggcacgcgcacccggagaccgacgaagcattcctggtgctggaaggcaccctgcgtatcgacctgccggatggctgcgtgcatgtgaaccccggggaactctatgtggTGc < 3:220896‑M1/3‑1 (MQ=255) aTGATTAGAAATGGCTGTAAAGCGATTTTTTATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCT‑TGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATAGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGcc > 7:11124/1‑149 (MQ=255) aaggtcgtgcgcatcgaaggcgaattcatctggcacgcgcacccggagaccgacgaagcattcctggtgctggaaggcaccctgcgtatcgacctgccggatggctgcgtgcatgtgaaccccggggaactctatgtggTGCCCCGCgg < 4:33997‑M1/10‑1 (MQ=255) aaaTGGCTGTAAAGCGATTTTTTATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCT‑TGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGtt > 4:62126/1‑149 (MQ=255) tGGCTGTAAAGCGATTTTTTATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCT‑TGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGa > 8:112832/1‑149 (MQ=255) tGGCTGTAAAGCGATTTTTTATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCT‑TGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGa < 1:154427/149‑1 (MQ=255) gCTGTAAAGCGATTTTTTATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCT‑TGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCTGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGat > 7:125692/1‑148 (MQ=255) gCTGTAAAGCGATTTTTTATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCT‑TGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGat > 8:163525/1‑148 (MQ=255) tAAAGCGATTTTTTATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCT‑TGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGatcatca > 6:14147/1‑149 (MQ=255) atcgaaggcgaattcatctggcacgcgcacccggagaccgacgaagcattcctggtgctggaaggcaccctgcgtatcgacctgccggatggctgcgtgcatgtgaaccccggggaactctatgtggTGCCCcgcg < 3:290369‑M1/9‑1 (MQ=255) atcgaaggcgaattcatctggcacgcgcacccggagaccgacgaagcattcctggtgctggaaggcaccctgcgtatcgacctgccggatggctgcgtgcatgtgaaccccggggaactctatgtggTGCCCcgcg > 4:290369‑M1/128‑136 (MQ=255) aGCGATTTTTTATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCTGTGAAAGTGGTCAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGATCTCTCCTTTGCGATACCCCCATTCATGACCGGTATTATCAATCCCCCGCGTTTCGatcatcat > 1:243063/1‑148 (MQ=255) gATTTTTTATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCT‑TGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCTGAATGCCCCGCGGTTAGATCATCATCAGtt > 4:222734/1‑149 (MQ=255) aTTTTTTATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCT‑TGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACAGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGttt > 5:150410/1‑149 (MQ=255) ttttttATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCT‑TGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTttc < 5:14147/149‑1 (MQ=255) tATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCT‑TGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTttcgctt < 7:163525/148‑1 (MQ=255) gTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCT‑TGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCcg 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ttCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGt > 2:157099/1‑148 (MQ=255) ttCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTc > 1:48833/1‑149 (MQ=255) cccccTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGTTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTGCACATGCCCGCAGCCATCCGGCAGGTc > 8:278199/1‑146 (MQ=255) cccccTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGAt < 8:87961/149‑1 (MQ=255) ccccTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATa < 2:205028/149‑1 (MQ=255) cccTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATAc > 1:114986/1‑149 (MQ=255) ccTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATAc > 6:324851/1‑148 (MQ=255) cATGACGGGTATTCAGAAGGCCCGGGGGTTCGTTCTTAATCTGTTTCGCTTGGCTTGGGGCTGGGGTCCGGTGGTGGAGGCCGCGTGGCACCACATCGTGTTAACC‑GGGTTCACATGCACGCAGCCATCCTGCAGGTCGATACGCAgg < 6:281394/148‑1 (MQ=255) aTGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCTCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACAt < 5:243557/116‑1 (MQ=255) aTGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGCCGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTcccag > 6:243557/1‑115 (MQ=255) gACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCa > 6:148634/1‑59 (MQ=255) gACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCa < 5:148634/59‑1 (MQ=255) aTTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTc > 4:121480/1‑147 (MQ=255) ttCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCa < 2:48833/148‑1 (MQ=255) tCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAg > 3:125599/1‑148 (MQ=255) tCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGc > 3:229287/1‑149 (MQ=255) aGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCa > 8:130214/1‑145 (MQ=255) aGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCa < 7:130214/145‑1 (MQ=255) aGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCAc > 7:183063/1‑149 (MQ=255) aaTGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCAc > 8:15471/1‑147 (MQ=255) aTGCCCCGCGGTTCGATCCTCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAg < 6:246868/149‑1 (MQ=255) | CCATGATTAGAAATGGCTGTAAAGCGATTTTTTATGGTTAATTATTGCTGTGAAGTCAGCGACTACAGCT‑TGAAAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCCGCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAG > NC_002947/2356903‑2357197 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |