| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 2357050 = | 97 (1.880) | 5 (0.100) | 4/240 | NT | 5.2% | coding (328/387 nt) | PP_2071 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 2357122 = | 91 (1.910) | coding (256/387 nt) | PP_2071 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
AAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCACGACCTTGAACTGG > NC_002947/2356976‑2357267 | aaGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCC‑GCGGGGcacca < 8:15702/149‑1 (MQ=255) tgAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCC‑GCGGGGCACCACATaga < 2:2601/149‑1 (MQ=255) gtgtTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCAGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGtt < 7:207829/149‑1 (MQ=255) ttgttAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGTTccc > 7:87961/1‑149 (MQ=255) ttAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGTGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATCCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCATGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCgg > 5:246868/1‑149 (MQ=255) aaTCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGCCCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGCCGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCgtgg > 5:281394/1‑148 (MQ=255) aaTCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCC‑GCGGGGCACCACATagag > 4:40961/1‑138 (MQ=255) aaTCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCgggg < 6:203590/148‑1 (MQ=255) aaTCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCgggg < 7:65463/148‑1 (MQ=255) tCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGtt > 8:27959/1‑148 (MQ=255) tCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGtt > 2:113661/1‑148 (MQ=255) ccAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTca > 1:239433/1‑149 (MQ=255) cAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTca > 4:152290/1‑148 (MQ=255) 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ttcgcCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTtcgtc > 4:231123/1‑129 (MQ=255) cgcCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCa < 4:221721/148‑1 (MQ=255) gcCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTc > 3:95416/1‑105 (MQ=255) gcCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTc < 4:95416/105‑1 (MQ=255) gcCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGTTCCCC‑GGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGAt < 3:226986/149‑1 (MQ=255) ccTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTc > 3:285673/1‑104 (MQ=255) 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8:163378/148‑1 (MQ=255) cAGCGGTCCGGTGCTCGACGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCg < 3:121480/149‑1 (MQ=255) ggTGCTCGACGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATg < 5:241808/149‑1 (MQ=255) ggTGCTCGACGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATg < 1:183568/149‑1 (MQ=255) cTCGACGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATgcgc < 7:15471/148‑1 (MQ=255) aCGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCACGAc > 6:179833/1‑149 (MQ=255) aCGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCACGAc < 8:183063/149‑1 (MQ=255) cgcc‑gcGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCACGAcc < 7:91595/149‑1 (MQ=255) ccgcggggcaCCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCACGACCtt < 4:33997‑M2/139‑1 (MQ=255) cgcggggcaCCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGAt > 4:290369‑M2/10‑136 (MQ=255) cgcggggcaCCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGAt < 3:290369‑M2/127‑1 (MQ=255) gcaCCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCACGACCTTGAACTgg < 3:220896‑M2/146‑1 (MQ=255) | AAGTGGTGAGTGTTGTTAAATCCAGACATCGCTCTCTGCTGTGCGATTCCCCCCTTCATGACCGGTATTCAGAATGCCCCGCGGTTCGATCATCATCAGTTTCGCTTCGCCTTGCGCAGCGGTCCGGTGCTCGACGCC‑GCGGGGCACCACATAGAGTTCCCCGGGGTTCACATGCACGCAGCCATCCGGCAGGTCGATACGCAGGGTGCCTTCCAGCACCAGGAATGCTTCGTCGGTCTCCGGGTGCGCGTGCCAGATGAATTCGCCTTCGATGCGCACGACCTTGAACTGG > NC_002947/2356976‑2357267 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |