| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 2394741 = | 101 (1.960) | 5 (0.100) | 4/246 | NT | 5.2% | coding (652/1413 nt) | dacB | D‑alanyl‑D‑alanine carboxypeptidase |
| ? | NC_002947 | 2394771 = | 87 (1.780) | coding (622/1413 nt) | dacB | D‑alanyl‑D‑alanine carboxypeptidase | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
CCTGGATGTTGCCACCCAGTTCGTTCCAGATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGG > NC_002947/2394594‑2394889 | ctggtcaagcccgactcgctgctggtcaacctcaaggccctgcgcttcgtggcgcgcaatgatggtggcaaggtcaccgtcgccgtcgagccaccgattgcccgcatccgcatcgacaaccaggtcaagccggtagcctctaagaaatg > 6:326974‑M1/149‑149 (MQ=255)ccTGGATGTTGCCACCCAGTTCGTTCCAGATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑Gc > 7:234153/1‑149 (MQ=255)ccTGGATGTTGCCACCCAGTTCGTTCCAGATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑Gc < 1:286036/149‑1 (MQ=255) cTGGATGTTGCCACCCAGTTCGTTCCAGATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCa > 6:138929/1‑149 (MQ=255) cTGGATGTTGCCACCCAGTTCGTTCCAGATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCa > 8:164745/1‑149 (MQ=255) gATGTTGCCACCCAGTTCGTTCCAGATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCg > 1:138197/1‑149 (MQ=255) gATGTTGCCACCCAGTTCGTTCCAGATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGAGGAATCGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTTCCCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCg > 7:126987/1‑149 (MQ=255) caagcccgactcgctgctggtcaacctcaaggccctgcgcttcgtggcgcgcaatgatggtggcaaggtcaccgtcgccgtcgagccaccgattgcccgcatccgcatcgacaaccaggtcaagccggtagcctctaagaaatGCACCg < 5:193655‑M1/6‑1 (MQ=255) aggTTGCCACCCAGGTCCTTCCAGATAGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTGTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCgg < 5:132271/147‑1 (MQ=255) gTTGCCACCCAGTTCGTTCCAGATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑Gt > 4:78656/1‑149 (MQ=255) gTTGCCACCCAGTTCGTTCCAGATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑Gt > 2:300828/1‑149 (MQ=255) ttGCCACCCAGTTCGTTCCAGATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTCTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑Gtt < 2:75070/149‑1 (MQ=255) cccgactcgctgctggtcaacctcaaggccctgcgcttcgtggcgcgcaatgatggtggcaaggtcaccgtcgccgtcgagccaccgattgcccgcatccgcatcgacaaccaggtcaagccggtagcctctaagaaatGCAc < 7:139403‑M1/4‑1 (MQ=255) cccgactcgctgctggtcaacctcaaggccctgcgcttcgtggcgcgcaatgatggtggcaaggtcaccgtcgccgtcgagccaccgattgcccgcatccgcatcgacaaccaggtcaagccggtagcctctaagaaatGCAc > 8:139403‑M1/140‑143 (MQ=255) cACCCAGTTCGTTCCAGATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAg < 5:139869/149‑1 (MQ=255) cccAGTTCGTTCCAGATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAgcg < 6:328567/149‑1 (MQ=255) aGTTCGTTCCAGATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGc‑ac < 3:78656/149‑1 (MQ=255) ttcgttcCAGATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACAt > 1:58337/1‑149 (MQ=255) 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ttGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCAt < 2:31629/149‑1 (MQ=255) gcgcgcACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCAtt < 5:303583/148‑1 (MQ=255) gcgcACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCt > 2:10777/1‑149 (MQ=255) gcACGGCACCGGCTGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTa < 5:11633/149‑1 (MQ=255) gcACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTa < 1:190347/149‑1 (MQ=255) 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ttGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGc < 1:10777/149‑1 (MQ=255) ggCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGcca > 8:197293/1‑149 (MQ=255) ggCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGcca > 3:3099/1‑149 (MQ=255) gCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTcgacggcgacg > 1:245424/1‑133 (MQ=255) gCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTcgacggcgacg < 2:245424/133‑1 (MQ=255) 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acTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCa > 5:163661/1‑149 (MQ=255) acTGATGCCGTCGGACTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGAATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGAGGATGCGGGCAATCGCTGGCACGACGGCGACGGAGACCTTGACAACATCATTGCGCCCCa > 6:271112/1‑149 (MQ=255) cTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCAc < 8:252637/149‑1 (MQ=255) tGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGCGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCAc > 3:279033/1‑148 (MQ=255) tGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCAc > 4:72669/1‑148 (MQ=255) tGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCAc > 6:220080/1‑148 (MQ=255) tGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCAc > 6:313757/1‑148 (MQ=255) ctctaagaaatGCACCGGTGATGT‑GCGCTACAAC‑CCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAgcg < 2:29060‑M1/136‑1 (MQ=255) tctaagaaatGCACCGGTGATGT‑GCGCTACAAC‑CCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGc < 3:284412‑M1/111‑1 (MQ=255) gCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGc > 4:217569/1‑149 (MQ=255) ccTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGcc > 8:124898/1‑149 (MQ=255) ggg‑gCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCtt < 4:3099/148‑1 (MQ=255) gg‑gCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTg < 5:314739/148‑1 (MQ=255) g‑gCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAg < 4:279033/149‑1 (MQ=255) GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAgg > 4:230197‑M1/1‑149 (MQ=255) GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAgg > 1:300828‑M1/1‑149 (MQ=255) | CCTGGATGTTGCCACCCAGTTCGTTCCAGATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCATTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGG > NC_002947/2394594‑2394889 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |