New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2394741 = | 101 (1.960) | 5 (0.100) | 4/246 | NT | 5.2% | coding (652/1413 nt) | dacB | D‑alanyl‑D‑alanine carboxypeptidase |
? | NC_002947 | 2394771 = | 87 (1.780) | coding (622/1413 nt) | dacB | D‑alanyl‑D‑alanine carboxypeptidase |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
ATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGACCAGCAGCGAGTCGGGCTTGACCAG > NC_002947/2394623‑2394918 | aTTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCa > 2:194387/1‑149 (MQ=255) ttGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑t < 2:31629/149‑1 (MQ=255) ttGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑t > 5:136293/1‑149 (MQ=255) gcgcgcACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑tt < 5:303583/148‑1 (MQ=255) gcgcACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCt > 2:10777/1‑149 (MQ=255) gcACGGCACCGGCTGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTa < 5:11633/149‑1 (MQ=255) gcACGGCACCGGCGGCGTAGGTTGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTa < 1:194387/149‑1 (MQ=255) gcACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTa < 1:190347/149‑1 (MQ=255) ctgcgcttcgtggcgcgcaatgatggtggcaaggtcaccgtcgccgtcgagccaccgattgcccgcatccgcatcgacaaccacgtcaagccggtagcctctaagaaatgcaccgggttgtagcgcacatcaccggtgcA‑TTTCTTaga < 1:57773‑M2/10‑1 (MQ=255) cggcgTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGc < 2:138197/149‑1 (MQ=255) gcgTAGGTGGAATGGTCGAGCCGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGcct < 4:243055/149‑3 (MQ=255) gcgTAGGGGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCtt < 8:234153/149‑1 (MQ=255) tAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGAc < 7:235964/149‑1 (MQ=255) tAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGAc > 8:11503/1‑149 (MQ=255) ggTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGAcc < 6:242570/148‑1 (MQ=255) tGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTgg > 2:233198/1‑149 (MQ=255) ggAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGt > 8:180024/1‑149 (MQ=255) gAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGGTACACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTgg < 1:94702/148‑1 (MQ=255) gAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGtt > 3:99703/1‑149 (MQ=255) gAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGtt < 6:136293/149‑1 (MQ=255) aTGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGt < 7:104513/149‑1 (MQ=255) ggTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTc > 2:250094/1‑148 (MQ=255) gAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCgatgc < 7:164745/149‑1 (MQ=255) gAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCgatgc > 6:77017/1‑149 (MQ=255) gAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCgatgc < 3:142358/149‑1 (MQ=255) gcaaggtcaccgtcgccgtcgagccaccgattgcccgcatccgcatcgacaaccaggtcaagccggtagcctctaagaaatgcaccgggttgtagcgcacatcaccggtgcA‑TTTCTTaga > 4:284412‑M2/112‑121 (MQ=255) gcaaggtcaccgtcgccgtcgagccaccgattgcccgcatccgcatcgacaaccaggtcaagccggtagcctctaagaaatgcaccgggttgtagcgcacatcaccggtgcA‑TTTCTTaga < 3:284412‑M2/10‑1 (MQ=255) gTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCgatgcggatg < 7:4134/149‑1 (MQ=255) gTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCgatgcggatg > 7:6698/1‑149 (MQ=255) gTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCgatgcggatg > 7:1913/1‑149 (MQ=255) aCAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGatgcggatgcgg < 1:250094/149‑1 (MQ=255) aCAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGatgcggatgcgg < 5:138929/149‑1 (MQ=255) cAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCggg < 4:99703/149‑1 (MQ=255) gtaggtTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCaa > 6:125745/1‑149 (MQ=255) gtaggtTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCaa > 2:289610/1‑149 (MQ=255) ggtTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATc < 7:256981/148‑1 (MQ=255) gtTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCgg < 1:149173/149‑1 (MQ=255) cGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCgatgcggatgcg < 7:161391/135‑1 (MQ=255) cGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCgatgcggatgcg > 8:161391/1‑135 (MQ=255) cGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCt < 2:58337/149‑1 (MQ=255) aGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCg < 8:111346/122‑1 (MQ=255) aGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCg > 7:111346/1‑122 (MQ=255) gCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTcgacgg > 7:252637/1‑149 (MQ=255) gCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTcgacg < 8:1913/148‑1 (MQ=255) gCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTcgacg < 8:6698/148‑1 (MQ=255) cAGCCGTCACCTATTTGGCCGATGACCTTTACAATTATGCGTTCGGCGTGGG‑GAACCGG‑GTTTTAGCGA‑ACATAACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGTCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCTATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTctacgg < 8:244359/148‑1 (MQ=255) gTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTcgacggcgacgg > 6:84633/1‑149 (MQ=255) tCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGt < 7:11503/149‑1 (MQ=255) aCCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGa > 5:287842/1‑149 (MQ=255) gTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTgg < 8:140467/127‑1 (MQ=255) gTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTgg > 7:140467/1‑127 (MQ=255) ttGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGc < 1:10777/149‑1 (MQ=255) ggCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGcca > 3:3099/1‑149 (MQ=255) ggCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGAGACGGTGACCTTGcca > 5:174639/1‑149 (MQ=255) gCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTcgacggcgacg < 2:245424/133‑1 (MQ=255) gCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTcgacggcgacg > 1:245424/1‑133 (MQ=255) cTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACcat > 4:58825/1‑148 (MQ=255) aCCGTTACTCAGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCTC‑ACATCACCGGTGCA‑TGTCTTAGAGGCTACCGGCTTTACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGTGGGTGACCTTGCCACcatcat < 8:116678/148‑1 (MQ=255) aCCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCAtt < 5:125745/149‑1 (MQ=255) cGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTgc > 5:192458/1‑149 (MQ=255) ttACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTgcgc < 5:31514/149‑1 (MQ=255) acTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCa > 5:163661/1‑149 (MQ=255) acTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCa > 1:161254/1‑149 (MQ=255) acTGATGCCGTCGGACTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGAA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGAGGATGCGGGCAATCGCTGGCACGACGGCGACGGAGACCTTGACAACATCATTGCGCCCCa > 6:271112/1‑149 (MQ=255) cTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCAc < 8:252637/149‑1 (MQ=255) tGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGCGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCAc > 3:279033/1‑148 (MQ=255) tGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCAc > 6:220080/1‑148 (MQ=255) tGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCAc > 6:313757/1‑148 (MQ=255) tGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCAc > 4:72669/1‑148 (MQ=255) gTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCgatgcggatgcg < 7:87103/87‑1 (MQ=255) ctctaagaaatGCACCGGTGATGT‑GCGCTACAAC‑CCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAgcg < 2:29060‑M1/136‑1 (MQ=255) tctaagaaatGCACCGGTGATGT‑GCGCTACAAC‑CCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGc < 3:284412‑M1/111‑1 (MQ=255) tctaagaaatGCACCGGTGATGT‑GCGCTACAAC‑CCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGc > 4:284412‑M1/11‑121 (MQ=255) ccTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGcc > 8:124898/1‑149 (MQ=255) gg‑gCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTg < 5:314739/148‑1 (MQ=255) g‑gCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAg < 4:279033/149‑1 (MQ=255) GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAgg > 1:300828‑M1/1‑149 (MQ=255) GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAgg > 4:230197‑M1/1‑149 (MQ=255) accggtgatgtgcgctacaacccggtgcAGTTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGt > 1:192322‑M2/29‑149 (MQ=255) G‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGAcc > 2:161254‑M1/1‑149 (MQ=255) gTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGACca < 5:220080/149‑1 (MQ=255) tAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGACcagca < 7:124898/148‑1 (MQ=255) tAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGACcagca < 6:287842/148‑1 (MQ=255) c‑acaTCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGACCAGCAGCGAGt > 5:301744/1‑149 (MQ=255) c‑acaTCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGACCAGCAGCGAGt < 5:77017/149‑1 (MQ=255) c‑acaTCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGACCAGCAGCGAGt < 6:174639/149‑1 (MQ=255) acaTCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGACCAGCAGCGAGTc < 1:289610/149‑1 (MQ=255) acaTCACCGGTGAA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGAAGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGACCAGCATCGAGTc > 8:17099/1‑149 (MQ=255) aTCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGACCAGCAGCGAGTCgg < 8:80063/149‑1 (MQ=255) cACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGACCAGCAGCGAGTCggg > 2:328763/1‑148 (MQ=255) cACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGACCAGCAGCGAGTCggg < 1:328763/148‑1 (MQ=255) aCCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGACCAGCAGCGAGTCGGGCt < 3:58825/149‑1 (MQ=255) gtgcA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGACCAGCAGCGAGTCggg > 8:139403‑M2/5‑143 (MQ=255) gtgcA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGACCAGCAGCGAGTCggg < 7:139403‑M2/139‑1 (MQ=255) cA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGACCAGCAGCGAGTCGGGCTTGACCAg > 6:326974‑M2/2‑149 (MQ=255) a‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGaa < 6:112944/103‑1 (MQ=255) a‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGaa > 5:112944/1‑103 (MQ=255) a‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGACCAGCAGCGAGTCGGGCTTGAc < 2:295039/145‑1 (MQ=255) a‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGACCAGCAGCGAGTCGGGCTTGAc > 1:295039/1‑145 (MQ=255) a‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCAGGCAATCGGTGGCTCGAAGGAGACGGTGACCTTGCAACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGAACAGCAGCGAGTCGGGCATGACCAg > 5:87683/1‑148 (MQ=255) | ATTGCGCGCACGGCACCGGCGGCGTAGGTGGAATGGTCGAGCAGTGACAGGTAGGTTTGCGAGTTGCAGCCGTCACCTAGTTGGCCGCTGACCGTTACACTGATGCCGTCGGCCTGGG‑GCACCGG‑GTTGTAGCGC‑ACATCACCGGTGCA‑TTTCTTAGAGGCTACCGGCTTGACCTGGTTGTCGATGCGGATGCGGGCAATCGGTGGCTCGACGGCGACGGTGACCTTGCCACCATCATTGCGCGCCACGAAGCGCAGGGCCTTGAGGTTGACCAGCAGCGAGTCGGGCTTGACCAG > NC_002947/2394623‑2394918 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |