| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2472140 | 36 (0.700) | 8 (0.220) | 6/182 | NT | 20.7% | intergenic (+44/+105) | PP_2166/PP_2167 | anti‑anti‑sigma factor/PhoD‑like phosphatase |
| ? | NC_002947 | = 2472186 | 36 (1.000) | intergenic (+90/+59) | PP_2166/PP_2167 | anti‑anti‑sigma factor/PhoD‑like phosphatase | |||||
TGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCG‑AAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAG > NC_002947/2471993‑2472285 | tggtgCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC < 5:56980‑M1/148‑1 (MQ=255)tggtgCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC > 6:56980‑M1/1‑148 (MQ=255) cTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCt > 2:263933/1‑149 (MQ=255) tCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattg > 7:5175‑M1/1‑140 (MQ=255) tCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTg > 5:71792/1‑149 (MQ=255) aaGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTgcgc > 5:187926/1‑149 (MQ=255) aaGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTgcgc < 5:120331/149‑1 (MQ=255) tggtggCGCAAAATATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGGGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGTTCCCTCAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCaaa < 1:103003/149‑1 (MQ=37) gAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACAcc < 5:173617/149‑1 (MQ=255) ggCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCaa < 2:302147/149‑1 (MQ=255) ggCGCACAAGATCCTACTGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCaa < 6:163351/149‑1 (MQ=255) gcgcACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAAt < 6:145202/149‑1 (MQ=255) gcgcACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAAt < 2:18538/149‑1 (MQ=255) gcgcACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAAt < 3:24536/149‑1 (MQ=255) gcgcACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAAt > 7:106183/1‑149 (MQ=255) gcACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAAtgt < 3:263110/149‑1 (MQ=255) acaAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAAtgtgt < 6:71792/149‑1 (MQ=255) acaAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAAtgtgt < 1:263933/149‑1 (MQ=255) caAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtg > 7:88250‑M1/1‑120 (MQ=255) cTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCAccc > 7:141997/1‑149 (MQ=255) tCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTacga > 3:281469/1‑114 (MQ=255) tCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTacga < 4:281469/114‑1 (MQ=255) gCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAAtgt < 5:73179/132‑1 (MQ=255) gCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAAtgt > 6:73179/1‑132 (MQ=255) ccTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAg < 6:187926/149‑1 (MQ=255) aTGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgta > 4:95925‑M2/1‑146 (MQ=255) tGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtag > 7:104734‑M2/1‑145 (MQ=255) aCTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtag < 5:305092‑M2/147‑5 (MQ=255) cAACCGGGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagc > 7:46938‑M2/1‑139 (MQ=255) cAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgg < 8:5175‑M1/149‑57 (MQ=255) cAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgg < 5:125669‑M1/149‑57 (MQ=255) cAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgg > 6:125669‑M1/1‑93 (MQ=255) cAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgg < 7:232092‑M1/149‑57 (MQ=255) cAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcg < 2:199060‑M1/148‑56 (MQ=255) cAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgg > 8:149047‑M2/1‑139 (MQ=255) aaCCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAAtgt < 4:103692/118‑1 (MQ=255) aaCCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAAtgt > 3:103692/1‑118 (MQ=255) aaCCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcggg > 8:106183‑M2/1‑138 (MQ=255) aaCCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTg > 7:137840‑M2/1‑138 (MQ=255) aaCCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGAGTGTCCACCCCCAATCAGGTg < 8:137840‑M2/139‑2 (MQ=255) aCCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAGGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCGCCAATCAGGTgtaggagcgggt > 1:227126‑M2/1‑137 (MQ=255) cgAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttac > 8:141997‑M2/1‑133 (MQ=255) gAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAAtgtgt > 7:137838/1‑114 (MQ=255) gAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAAtgtgt < 8:137838/114‑1 (MQ=255) gAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttacc > 6:305092‑M2/1‑132 (MQ=255) cTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttacccgcga < 8:88250‑M1/149‑69 (MQ=255) tCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCAc < 5:279958/113‑1 (MQ=255) tCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCAc > 6:279958/1‑113 (MQ=255) ggTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCa < 3:58294/91‑1 (MQ=255) ggTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCa > 4:58294/1‑91 (MQ=255) taGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC < 7:169039‑M1/40‑1 (MQ=255) taGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC > 8:169039‑M1/1‑40 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGaa < 1:206462/123‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCG‑AAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGaa > 2:206462/1‑122 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCACCTACGCCGGGCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGGAGGAGCGGGTTTACACGCG‑AAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAATCTGAGAATCTCACTAGGCGCGGTTTGTacaggcg > 6:151740/1‑143 (MQ=255) tCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaag < 8:88250‑M2/149‑82 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaaggcttc > 6:305092‑M1/1‑17 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcg > 1:314667‑M1/1‑17 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcg < 2:314667‑M1/64‑48 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaaggcttcg > 8:141997‑M1/1‑16 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCGCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCG‑AAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCt > 7:177319/1‑149 (MQ=255) tAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCG‑AAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCt > 4:235373/1‑148 (MQ=255) aCCCGCTCCTACacctgattggcggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcctaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaaggcttcgcggt > 1:227126‑M1/1‑12 (MQ=255) cccGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaaggcttcgcggtt > 8:106183‑M1/1‑11 (MQ=255) cccGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCG‑AAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCAccc > 7:60088/1‑149 (MQ=255) 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ccGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaaggcttcgcggttg > 6:125669‑M2/1‑56 (MQ=255) ccGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCG‑AAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAGACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCAcccc > 8:62653/1‑149 (MQ=255) cGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaaggcttcgcggttg < 2:199060‑M2/148‑94 (MQ=255) gCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaaggcttcccggttg > 7:46938‑M1/1‑8 (MQ=255) gCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCG‑AAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCg > 4:59288/1‑149 (MQ=255) cTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaaggcttcgcggttggagtca > 7:104734‑M1/1‑4 (MQ=255) cTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaaggcttcgcggttggagt < 5:305092‑M1/147‑144 (MQ=255) cTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCG‑AAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAg > 3:944/1‑149 (MQ=255) tACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaaggcttcgcggttggagtcat > 4:95925‑M1/1‑3 (MQ=255) tACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTATCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCG‑AAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCAGTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAg > 5:282881/1‑148 (MQ=255) cgacgGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttacc < 2:314667‑M2/64‑18 (MQ=255) cgacgGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttacc > 1:314667‑M2/1‑47 (MQ=255) cacctgattgggggtggacactcattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaaggcttcgcggtt < 8:137840‑M1/139‑139 (MQ=255) cacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatagatcagctccgctccagcgcattgaccagatcatggaaggcttcgcggtt > 7:137840‑M1/1‑1 (MQ=255) | TGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGG‑‑AGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCG‑AAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAG > NC_002947/2471993‑2472285 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |