New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3792154 = | 43 (0.830) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 7.4% | coding (1164/1755 nt) | PP_3354 | acyl‑CoA dehydrogenase |
? | NC_002947 | 3792203 = | 34 (0.700) | coding (1115/1755 nt) | PP_3354 | acyl‑CoA dehydrogenase |
GTAGATCATCGCGATGCGGCTGTCGCGCAAGGTCTGCTCGATGGCAAACTCCTGGGTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGACGCATGGCCGG > NC_002947/3792007‑3792297 | gTAGATCATCGCGATGCGGCTGTCGCGCAAGGTCTGCTCGATGGCAAACTCCTGGGTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAgcg > 7:43717/1‑149 (MQ=255) gTAGATCATCGCGATGCGGCTGTCGCGCAAGGTCTGCTCGATGGCAAACTCCTGGGTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAgcg > 6:336507/1‑149 (MQ=255) tAGATCATCGCGATGCGGCTGTCGCGCAAGGTCTGCTCGATGGCAAACTCCTGGGTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAgcgc > 6:71933/1‑149 (MQ=255) gcgATGCGGCTGTCGCGCAAGGTCTGCTCGATGGCAAACTCCTGGGTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGt > 4:106430/1‑149 (MQ=255) gcgATGCGGCTGTCGCGCAAGGTCTGCTCGATGGCAAACTCCTGGGTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGt < 2:314242/149‑1 (MQ=255) tCGCGCAAGGTCTGCTCGATGGCAAACTCCTGGGTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCg < 3:146219/148‑1 (MQ=255) tGCTCGATGGCAAACTCCTGGGTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAgg > 2:14720/1‑149 (MQ=255) cTCGATGGCAAACTCCTGGGTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGc < 5:71933/148‑1 (MQ=255) gATGGCAAACTCCTGGGTCTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGGGAAGGCCGCGTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTc < 3:287755/147‑1 (MQ=255) aTGGCAAACTCCTGGGTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGa < 1:14720/149‑1 (MQ=255) gCAAACTCCTGGGTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGt > 7:242849/1‑132 (MQ=255) gCAAACTCCTGGGTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGt < 8:242849/132‑1 (MQ=255) ctgcacccggccatgcgtcgggtcttgctggagttgcgggtgcgtaccgaggggatgcgcgcgctggcctactggacggcccagtggctggatatcgccgaCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACggcggc < 6:264327‑M1/48‑1 (MQ=255) tCCTGGGTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGtt > 6:236700/1‑127 (MQ=255) tCCTGGGTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGtt < 5:236700/127‑1 (MQ=255) tCCTGGGTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTc > 7:294856/1‑149 (MQ=255) catccggccatgcgtcgggtcttgctggagttgcgggtgcgtaccgaggggatgcgcgcgctggcctactggacggcccagtggctggatatcgccgaCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGt > 2:99284‑M1/99‑148 (MQ=255) acccggccatgcgtcgggtcttgctggagttgcgggtgcgtaccgaggggatgcgcgcgctggcctactggacggcccagtggctggatatcgccgaCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCg > 5:264327‑M1/98‑149 (MQ=255) cTGGGTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCgg > 4:77840/1‑149 (MQ=255) tGGGTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGc > 6:69689/1‑149 (MQ=255) ggTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGc < 8:294856/147‑1 (MQ=255) ccatagccaCCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAg > 1:184671/1‑149 (MQ=255) ccatagccaCCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAg > 3:37471/1‑149 (MQ=255) caCCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGCCACTgg < 7:234142/149‑1 (MQ=255) aaCACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGCCACTGGGCCGt > 1:162300/1‑149 (MQ=255) ccTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAg < 1:8576/149‑1 (MQ=255) cTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGACCCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAg > 5:61447/1‑148 (MQ=255) cTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGAcggcg > 1:17852/1‑115 (MQ=255) cTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGAcggcg < 2:17852/115‑1 (MQ=255) cTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGt < 3:77840/149‑1 (MQ=255) cTGCAAGCCCTTGATTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGATGTGCAGGCTAGACGGCTGCGTCGCCGATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAg > 2:247956/1‑148 (MQ=255) cAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAgg > 5:56576/1‑149 (MQ=255) cAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAgg > 1:57787/1‑149 (MQ=255) ggCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTTCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGCCACTGGGCCGTc > 5:154815/1‑139 (MQ=255) ggCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTTCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGCCACTGGGCCGTc < 6:154815/139‑1 (MQ=255) gCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAg > 2:257331/1‑149 (MQ=255) tgcCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CCGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGGGATCTCCAGCCACGGGGCCGGCCAGTAGGCCAGCGCGCGCa > 2:248478/1‑149 (MQ=255) cAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCgg < 6:292644/104‑1 (MQ=255) aGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAACGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTCTGCAGGCTCCACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCAAGAGCGCGCATacc > 8:302052/1‑149 (MQ=255) gAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGc < 2:281515/109‑1 (MQ=255) gAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGc > 1:281515/1‑109 (MQ=255) aaCCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCgg < 7:302052/148‑1 (MQ=255) ggCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCa < 5:69689/149‑1 (MQ=255) ccgccTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGc < 4:37471/149‑1 (MQ=255) ccgccTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGc < 6:129717/149‑1 (MQ=255) cGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGa < 2:184671/149‑1 (MQ=255) gATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCTAGCGCGCGCATCCCCTCGGTCCGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGAc < 1:247956/149‑1 (MQ=255) tCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGACGCATGGcc > 1:51915/1‑149 (MQ=255) cAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGACGCATGGCCg > 4:215214/1‑149 (MQ=255) aaCAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGCCACTGGACCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGACGCATGGCCgg > 7:159513/1‑149 (MQ=255) | GTAGATCATCGCGATGCGGCTGTCGCGCAAGGTCTGCTCGATGGCAAACTCCTGGGTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCG‑CAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGACGCATGGCCGG > NC_002947/3792007‑3792297 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |