New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3792154 = | 43 (0.830) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 7.4% | coding (1164/1755 nt) | PP_3354 | acyl‑CoA dehydrogenase |
? | NC_002947 | 3792203 = | 34 (0.700) | coding (1115/1755 nt) | PP_3354 | acyl‑CoA dehydrogenase |
TCCTGGGTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGACGCATGGCCGGGTGCAGGTGGATCGGGTCGGCGCCCTGGGCGCCCCCCTTGGC > NC_002947/3792056‑3792339 | tCCTGGGTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTc > 7:294856/1‑149 (MQ=255) catccggccatgcgtcgggtcttgctggagttgcgggtgcgtaccgaggggatgcgcgcgctggcctactggacggcccagtggctggatatcgccgaCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGt > 2:99284‑M1/99‑148 (MQ=255) acccggccatgcgtcgggtcttgctggagttgcgggtgcgtaccgaggggatgcgcgcgctggcctactggacggcccagtggctggatatcgccgaCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCg > 5:264327‑M1/98‑149 (MQ=255) cTGGGTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCgg > 4:77840/1‑149 (MQ=255) tGGGTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGc > 6:69689/1‑149 (MQ=255) ggTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGc < 8:294856/147‑1 (MQ=255) ccatagccaCCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAg > 1:184671/1‑149 (MQ=255) ccatagccaCCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAg > 3:37471/1‑149 (MQ=255) caCCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTgg < 7:234142/149‑1 (MQ=255) aaCACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGt > 1:162300/1‑149 (MQ=255) ccTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAg < 1:8576/149‑1 (MQ=255) cTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGACCCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAg > 5:61447/1‑148 (MQ=255) cTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGt < 3:77840/149‑1 (MQ=255) cTGCAAGCCCTTGATTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGATGTGCAGGCTAGACGGCTGCGTCGCCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAg > 2:247956/1‑148 (MQ=255) cAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAgg > 5:56576/1‑149 (MQ=255) cAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAgg > 1:57787/1‑149 (MQ=255) ggCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTTCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTc < 6:154815/139‑1 (MQ=255) ggCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTTCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTc > 5:154815/1‑139 (MQ=255) gCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAg > 2:257331/1‑149 (MQ=255) tgcCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCCGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGGG‑ATCTCCAGCCACGGGGCCGGCCAGTAGGCCAGCGCGCGCa > 2:248478/1‑149 (MQ=255) cAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCgg < 6:292644/104‑1 (MQ=255) aGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAACGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTCTGCAGGCTCCACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCAAGAGCGCGCATacc > 8:302052/1‑149 (MQ=255) gAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGc < 2:281515/109‑1 (MQ=255) gAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGc > 1:281515/1‑109 (MQ=255) aaCCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCgg < 7:302052/148‑1 (MQ=255) ggCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCa < 5:69689/149‑1 (MQ=255) ccgccTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGc < 6:129717/149‑1 (MQ=255) ccgccTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGc < 4:37471/149‑1 (MQ=255) cGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGa < 2:184671/149‑1 (MQ=255) gATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCTAGCGCGCGCATCCCCTCGGTCCGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGAc < 1:247956/149‑1 (MQ=255) tCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGACGCATGGcc > 1:51915/1‑149 (MQ=255) cAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGACGCATGGCCg > 4:215214/1‑149 (MQ=255) aaCAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGACCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGACGCATGGCCgg > 7:159513/1‑149 (MQ=255) cgacgccgccgtcgagcctgcacaacgggcgaaggctgcgacattggcggcgTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGACGCATGGCCGGGt > 5:264327‑M2/53‑149 (MQ=255) acgccgccgtcgagcctgcacaacgggcgaaggctgcgacattggcggcgTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGACGCATGGCCGGATg > 2:99284‑M2/51‑148 (MQ=255) gccgccgtcgagcctgcacaacgggcgaaggctgcgacattggcggcgTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGACGCATGGCCGGGTGCAg < 6:264327‑M2/101‑1 (MQ=255) CCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAACGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGACGCATGGCCGGGTGCAgg < 4:68965‑M1/149‑1 (MQ=255) cGCAGCCTGCGCCCGTTGGGCAGGCTCGCCGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGACGCATGGCCGGGTGCAGGTGGATCGGGt < 2:162300/149‑1 (MQ=255) gCATCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGACGCATGGCCGGGTGCAGGTGGATCGGGTc < 6:133307/149‑1 (MQ=255) gCCTTCGCCCGTTGTCCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGACGCATGGCCGGGTGCAGGTGGATCGGGTCGgc < 7:272135/149‑1 (MQ=255) ccGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGACGCATGGCCGGGTGCAGGTGGATCGGGTCGGCGCCCTggg < 8:43717/149‑1 (MQ=255) cGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCGAATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTc > 1:35551/1‑96 (MQ=255) cGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTc < 2:35551/95‑1 (MQ=255) ggCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGACGCATGGCCGGGTGCAGGTGGATCGGGTCGGCGCCCTGGGCGCCCCCCtt > 7:253807/1‑149 (MQ=255) ggCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAACGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGACGCATGGCCGGGTGCAGGTGGATCGGGTCGGCGCCCTGGGCGCCCCCCtt < 3:68965/149‑1 (MQ=255) tCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGACGCATGGCCGGGTGCAGGTGGATCGGGTCGGCGCCCTGGGCGCCCCCCTTGgc > 3:99122/1‑149 (MQ=255) gACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGACGCATGGCCGGGTGCAGGTGGATCGGGTCGGCGCCCTgg < 2:121828/133‑1 (MQ=255) gACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGACGCATGGCCGGGTGCAGGTGGATCGGGTCGGCGCCCTgg > 1:121828/1‑133 (MQ=255) | TCCTGGGTGTAGCCATAGCCACCCAACACCTGCAAGGCCTTGCTTGCCAGGCTGAACCCCTGCTCGGTGAAGGCCGCCTTGACGATGGGGGTCAACAGCGCCGCCAATGTCGCAGCCTTCGCCCGTTGTGCAGGCTCGACGGCGGCGTCGGCG‑ATATCCAGCCACTGGGCCGTCCAGTAGGCCAGCGCGCGCATCCCCTCGGTACGCACCCGCAACTCCAGCAAGACCCGACGCATGGCCGGGTGCAGGTGGATCGGGTCGGCGCCCTGGGCGCCCCCCTTGGC > NC_002947/3792056‑3792339 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |