New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4012716 | 33 (0.640) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 9.9% | coding (552/900 nt) | mvaB | hydroxymethylglutaryl‑CoA lyase |
? | NC_002947 | = 4012757 | 42 (0.860) | coding (593/900 nt) | mvaB | hydroxymethylglutaryl‑CoA lyase |
ATGCGCGTGCGCGGGTATGTGTCGTGTGTGCTTGGCTGCCCTTACGAGGGCAAGGTCAGCGCCGAGCA‑GGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTCGACAGCTCGG > NC_002947/4012570‑4012864 | aTGCGCGTGCGCGGGTATGTGTCGTGTGTGCTTGGCTGCCCTTACGAGGGCAAGGTCAGCGCCGAGCA‑GGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGc < 7:92708/149‑1 (MQ=255) cgcgGGTATGTGTCGTGTGTGCTTGGCTGCCCTTACGAGGGCAAGGTCAGCGCCGAGCA‑GGTGGCCCGGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGacac < 7:70906/149‑1 (MQ=255) tgtgTCGTGTGTGCTTGGCTGCCCTTACGAGGGCAAGGTCAGCGCCGAGCA‑GGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGcc < 3:221102/149‑1 (MQ=255) tgtCGTGTGTGCTTGGCTGCCCTTACGAGGGCAAGGTCAGCGCCGAGCA‑GGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCt < 3:88484/148‑1 (MQ=255) tCGTGTGTGCTTGGCTGCCCTTACGAGGGCAAGGTCAGCGCCGAGCAGGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGt > 1:73463/1‑149 (MQ=255) gtgtgtGCTTGGCTGCCCTTACGAGGGCAAGGTCAGCGCCGCGCA‑GGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTc > 1:16957/1‑148 (MQ=255) tgtgCTTGGCTGCCCTTACGAGGGCAATGTCAGCGCCGTGCA‑TGTGGCCCCGGGTGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGGTACCCGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGa < 1:98913/149‑1 (MQ=255) gtgCTTGGCTGCCCTTACGAGGGCAAGGTCAGCGCCGAGCA‑GGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACTCGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGa < 1:94932/148‑1 (MQ=255) tgCTTGGCTGCCCTTACGAGGGCAAGGTCAGCGCCGAGCA‑GGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAggtg < 2:73463/149‑1 (MQ=255) cTTGGCTGCCCTTACGAGGGCAAGGTCAGCGCCGAGCA‑GGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAggtggt > 7:3840/1‑149 (MQ=255) ttGGCTGCCCTTACGAGGGCAAGGTCAGCGCCGAGCA‑GGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCtgggccgacaccacctcgaacaggcgtcgggtg > 5:333969‑M1/1‑116 (MQ=255) cTTACGAGGGCAAGGTCAGCGCCGAGCA‑GGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTTCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAg > 2:16957‑M2/1‑148 (MQ=255) cTTACGAGGGCAAGGTCAGCGCCGAGCA‑GGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAg > 8:3840‑M2/1‑148 (MQ=255) cTTACGAGGGCAAGGTCAGCGCCGAGCA‑GGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCCCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAg < 5:281858‑M2/149‑2 (MQ=255) ttACGAGGGCAAGGTCAGCGCCGAGCA‑GGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCCCGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGCCACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAgg < 7:199663‑M2/149‑3 (MQ=255) ccgAGGGCAAGGTCAGCGCCGTGCA‑GGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAg > 8:199663‑M2/2‑145 (MQ=255) cAAGGTCAGCGCCGAGCA‑GGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCtgggccgacaccacctcgaacaggcgtcgggtgtcgcctgcggtaccggtgc < 6:333969‑M1/149‑53 (MQ=255) ggTCAGCGCCGAGCA‑GGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCtgggccgacaccacctcgaacaggcgtcgggtgtcgcctgcggtaccggtgccga > 6:91869‑M1/1‑94 (MQ=255) ggTCAGCGCCGAGCA‑GGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGc < 5:183428/149‑1 (MQ=255) tCAGCGCCGAGCA‑GGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCtgggccgacaccacctcgaacaggcgtcgggtgtcgcctgcggtaccggtgccgatg < 5:91869‑M1/149‑58 (MQ=255) ccGAGCA‑GGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGcc > 5:87761/1‑149 (MQ=255) ccGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGa < 8:107391/149‑1 (MQ=255) ccGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGa < 4:269896/149‑1 (MQ=255) ccGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACg > 2:51594/1‑149 (MQ=255) cTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGc < 7:410/149‑1 (MQ=255) cTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGc > 8:226919/1‑149 (MQ=255) tGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGcc > 4:305539/1‑149 (MQ=255) cGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTgg < 5:82866/149‑1 (MQ=255) aTGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTaa > 1:223698/1‑149 (MQ=255) gggCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCtt < 3:201868/141‑1 (MQ=255) gggCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCtt > 4:201868/1‑141 (MQ=255) tgctA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTa > 5:262335/1‑149 (MQ=255) tA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCtt > 5:42891/1‑134 (MQ=255) tA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCtt < 6:42891/134‑1 (MQ=255) tA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGc > 3:35114/1‑149 (MQ=255) cggTCTCGCCGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCCGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGc < 4:45596/148‑1 (MQ=255) tctcGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACGTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTg > 7:160211/1‑149 (MQ=255) ctcGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTcc < 3:281362/104‑1 (MQ=255) ctcGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTcc > 4:281362/1‑104 (MQ=255) gCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCt < 6:87761/147‑1 (MQ=255) ggTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAggg < 7:226919/149‑1 (MQ=255) ccATCGGCACCGGTACCTCAGGCGACACCCGACTCCTTTTCGATGTGGTGTCGGCCCAGGTAACTCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTAAGGACAGGCATTGGATAACGTCTATGCCATCCTGCTCGAGGGAATCAGc < 6:281858/149‑1 (MQ=255) cATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAggtaccggtgccgatggtgtcacccagcgagacctcgtagcagcccatgtcgtgcagggcgcgggccaccggggccacctgctcggcgctga < 5:91869‑M2/149‑93 (MQ=255) tCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAggtaccggtgccgatggtgtcacccagcgagacctcgtagcagcccatgtcgtgcagggcgcgggccaccggggccacctgctcggcgctgacc > 6:91869‑M2/1‑55 (MQ=255) gCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAggtaccggtgccgatggtgtcacccagcgagacctcgtagcagcccatgtcgtgcagggcgcgggccaccggggccacctgctcggcgctgaccttg < 6:333969‑M2/149‑98 (MQ=255) gCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTc > 2:71723/1‑149 (MQ=255) cctgggccgacaccacctcgaacaggcgtcgggtggcgcctgcggtaccggtgccgatggtgtcacccagcgagacctcgtagcagcccatgtcgggcagggcgcgggccaccggggccacctgctcggcgctgaccttgccctcgtaa < 7:199663‑M1/149‑148 (MQ=255) ctgggccgacaccacctcgaacaggcgtcgggtgtcgcctggggtaccggtgccgatggtgtcacccagcgagacctcgtagcagcccatgtcgtgcagggcgcgggccaccggggccacctgctcggcgctgaccttgccctcgtaag < 5:281858‑M1/149‑149 (MQ=255) ctgggccgacaccacctcgaacaggcgtcgggtgtcgcctgcggtaccggtgccgatggtgtcacccagcgagacctcgtagcagcccatgtcgtgcagggcgcgggccaccggggccacctgctcggcgctgaccttgccctcgtaag > 8:3840‑M1/1‑1 (MQ=255) ctgggccgacaccacctcgaacaggcgtcgggtgtcgcctgcggtaccggtgccgatggtgtcacccagcgagacctcgtagcagcccatgtcgtgcagggcgcgggccaccggggccacctgcacggcgctgaccttgccctcgg > 8:199663‑M1/1‑1 (MQ=255) ctgggccgacaccacctcgaacaggcgtcgggtgtcgcctgcggtaccggtgccgatggtgtcacccagcgagacctcgtagaagcccatgtcgtgcagggcgcgggccaccggggccacctgctcggcgctgaccttgccctcgtaag > 2:16957‑M1/1‑1 (MQ=255) | ATGCGCGTGCGCGGGTATGTGTCGTGTGTGCTTGGCTGCCCTTACGAGGGCAAGGTCAGCGCCGAGCA‑GGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTA‑‑CGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTGTTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTCGACAGCTCGG > NC_002947/4012570‑4012864 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |