New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4699089 | 61 (1.180) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 6.4% | coding (1599/2655 nt) | kdpD | sensor protein |
? | NC_002947 | = 4699105 | 59 (1.210) | coding (1583/2655 nt) | kdpD | sensor protein |
GGCAGGGTATCGCTGCCGTGACCGGCGGCCTGCCCATGCTGCCAGGCCCAATCGGCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAACTGGCTGGTCTGTGCCTGGGTCTCGCGCAGCGCCTGCAACTGGCGACGCTGGCGC > NC_002947/4698943‑4699236 | ggCAGGGTATCGCTGCCGTGACCGGCGGCCTGCCCATGCTGCCAGGCCCAATCGGCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGc < 6:84713/149‑1 (MQ=255) gggTATCGCTGCCGTGACCGGCGGCCTGCCCATGCTGCCAGGCCCAATCGGCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTcc > 8:111418/1‑149 (MQ=255) tATCGCTGCCGTGACCGGCGGCCTGCCCATGCTGCCAGGCCCAATCGGCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGc < 5:146482/149‑1 (MQ=255) tATCGCTGCCGTGACCGGCGGCCTGCCCATGCTGCCAGGCCCAATCGGCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGc < 2:142448/149‑1 (MQ=255) tATCGCTGCCGTGACCGGCGGCCTGCCCATGCTGCCAGGCCCAATCGGCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGc > 7:165015/1‑149 (MQ=255) gCTGCCGTGACCGGCGGCCTGCCCATGCTGCCAGGCCCAATCGGCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCAc < 5:205380/148‑1 (MQ=255) cGTGACCGGCGGCCTGCCCATGCTGCCAGGCCCAATCGGCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTc < 1:217404‑M2/148‑2 (MQ=255) cggcggCCTGCCCATGCTGCCAGGCCCAATCGGCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGc > 3:43316/1‑149 (MQ=255) cTGCCCATGCTGCCAGGCCCAATCGGCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGacgggtggcaggacgcccaggtgtgcttgct > 4:271484‑M1/1‑118 (MQ=255) tGCCCATGCTGCCAGGCCCAATCGGCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGc > 2:246666/1‑149 (MQ=255) ccATGCTGCCAGGCCCAATCGGCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGacgggtggcaggacgcccaggtgtgcttgctggag < 3:271484‑M1/149‑36 (MQ=255) ccATGCTGCCAGGCCCAATCGGCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGc < 2:218477/149‑1 (MQ=255) tgcCAGGCCCAATCGGCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCAc < 4:259697/120‑1 (MQ=255) tgcCAGGCCCAATCGGCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCAc > 3:259697/1‑120 (MQ=255) ccAGGCCCAATCGGCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTGCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCTACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGaa < 6:246858/147‑1 (MQ=255) aGGCCCAATCGGCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACTCCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATg < 1:246666/149‑1 (MQ=255) ggCCCAATCGGCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGa > 7:78211/1‑143 (MQ=255) ggCCCAATCGGCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGa < 8:78211/143‑1 (MQ=255) ccAATCGGCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCtt < 8:165015/149‑1 (MQ=255) aaTCGGCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGc > 6:143784/1‑133 (MQ=255) aaTCGGCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGc < 5:143784/133‑1 (MQ=255) gCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGcggtc < 8:35578/149‑1 (MQ=255) gccgccCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGcggtcggt < 8:55507/149‑1 (MQ=255) ccgccCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATgg > 7:159222/1‑135 (MQ=255) ccgccCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATgg < 8:159222/135‑1 (MQ=255) cgccCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGacgggtggcaggacgcccaggtgtgcttgctg < 6:283665‑M1/120‑33 (MQ=255) cgccCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGacgggtggcaggacgcccaggtgtgcttgctg > 5:283665‑M1/1‑88 (MQ=255) gccCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCCCCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTgg > 3:168497/1‑148 (MQ=255) cccGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTccagg < 6:13686‑M2/107‑6 (MQ=255) cccGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTccagg > 5:13686‑M2/1‑102 (MQ=255) cGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTAc < 6:50411/149‑1 (MQ=255) gTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGCCGGTCGGTGGCTAcc > 2:60272/1‑149 (MQ=255) tgtCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCa > 8:95229/1‑88 (MQ=255) tCGCTGAAGGTGCAGGCGTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCg < 4:63619/149‑1 (MQ=255) cTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCg < 2:217404/149‑1 (MQ=255) tGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTCGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCCGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCCGCga > 4:73007/1‑149 (MQ=255) ggTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGcggtcgg < 7:193049/125‑1 (MQ=255) ggTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGcggtcgg > 8:193049/1‑125 (MQ=255) ggTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCgaga > 5:85173/1‑147 (MQ=255) cAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTc > 4:255230/1‑149 (MQ=255) aGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCg < 3:180495/149‑1 (MQ=255) ttCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTg < 5:216823/84‑1 (MQ=255) ttCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTg > 6:216823/1‑84 (MQ=255) ttCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGcggtcg < 4:103603/115‑1 (MQ=255) ttCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGcggtcg > 3:103603/1‑115 (MQ=255) ttCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGc > 7:111358/1‑148 (MQ=255) ccGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCTAGACAGGTCGAGCAActg > 8:67978/1‑149 (MQ=255) cGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAActgg > 3:250617/1‑149 (MQ=255) gCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAActggc < 7:111418/149‑1 (MQ=255) cACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAACTGGCTGGTCt > 1:252028/1‑149 (MQ=255) cACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAACTGGCTGGTCt > 6:157049/1‑149 (MQ=255) gCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAACTGGCTGGTCTGTGc < 4:43316/148‑1 (MQ=255) aaCTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAACTGGCTGGTCTGTGCCt < 1:231111/148‑1 (MQ=255) aaCTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAACTGGCTGGTCTGTGCCTg > 7:157054/1‑149 (MQ=255) cTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAACTGGCTGGTCTGTGCCTggg > 2:95706/1‑149 (MQ=255) tGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAACTGGCTGGTCTGTGCCTGGGt > 8:288525/1‑149 (MQ=255) ttCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAActggc < 2:75115/128‑1 (MQ=255) ttCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAActggc > 1:75115/1‑128 (MQ=255) cGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAACTGGCTGGTCTGTGCCTGGGTCTcgcg > 2:152611/1‑148 (MQ=255) gTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAACTGGCTGGTCTGTGCCTGGGTCTCGCGCAgcg > 1:149082/1‑149 (MQ=255) cgcTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAACTGGCTGGTCTGTGCCTGGGTCTCGCGCAGCGCCt < 7:288525/148‑1 (MQ=255) gcTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAACTGGCTGGTCTGTGCCTGGGTCTCGCGCAGCGCCTg > 7:120652/1‑148 (MQ=255) cTCCCGCAATCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCCGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAACTGGCTGGTCtgtg < 8:204886/125‑1 (MQ=255) cTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTccaggtgtgcttgctggagcgcaacgccgaaggccagttgcaagtggccagcggggaagcctgcaccttcagcgacaccgaacgggcggctgccgattgggcctggcagcatgg < 3:271484‑M2/149‑115 (MQ=255) cAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTccaggtgtgcttgctggagcgcaacgccgaaggccagttgcaagtggccagcggggaagcctgcaccttcagcgacaccgaacgggcg < 6:283665‑M2/120‑89 (MQ=255) cAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTccaggtgtgcttgctggagcgcaacgccgaaggccagttgcaagtggccagcggggaagcctgcaccttcagcgacaccgaacgggcg > 5:283665‑M2/1‑32 (MQ=255) cAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAACTGGCTGGTCTGTGCCTgg < 7:185897/127‑1 (MQ=255) cAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAACTGGCTGGTCTGTGCCTgg > 8:185897/1‑127 (MQ=255) cAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAACTGGCTGGTCTGTGCCTGGGTCTCGCGCAGCGCCTGCAACt < 3:255230/149‑1 (MQ=255) agcaagcaCACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTccaggtgtgcttgctggagcgcaacgccgaaggccagttgcaagtggccagcggggaagcctgcaccttcagcgacaccgaacgggcggctgccgattgggcctggcagcatgggcag > 4:271484‑M2/1‑31 (MQ=255) gcaagcaCACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGAGAGACAGGTCGAGCAACTGGCTGGTCTGTGCCTGGGTCTCGCGCAGCGCCTGCAACTgg > 2:44359/1‑149 (MQ=255) cacCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGATGGCCGGCATCCTAGAATATTCATTAACGATAACTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAACTGGCTGGTCTGTGCCTGGGTCTCGCGCAGCGCCTGCAACTGGCGACGCt > 6:64648/1‑149 (MQ=255) acCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAACTGGCTGGTCTGTGCCTGGGTCTCGCGCAGCGCCTGCAACTGGCGACGCTg > 5:196051/1‑149 (MQ=255) ccTGGacgggtggcaggacgcccaggtgtgcttgctggagcgcaacgccgaaggccagttgcaagtggccagcggggaagcctgcaccttcagcgacaccgaacggg < 6:13686‑M1/107‑103 (MQ=255) ccTGGacgggtggcaggacgcccaggtgtgcttgctggagcgcaacgccgaaggccagttgcaagtggccagcggggaagcctgcaccttcagcgacaccgaacggg > 5:13686‑M1/1‑5 (MQ=255) cTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAACTGGCTGGTCTGTGc < 4:112425/111‑1 (MQ=255) cTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAACTGGCTGGTCTGTGc > 3:112425/1‑111 (MQ=255) gacgggtggcaggacgcccaggtgtgcttgctggagcgcaacgccgaaggccagttgcaagtggccagcggggaagcctgcaccttcagcgacaccgaacgggcggctgccgattgggcctggcagcatgggcaggccgccggtcacg < 1:217404‑M1/148‑148 (MQ=255) | GGCAGGGTATCGCTGCCGTGACCGGCGGCCTGCCCATGCTGCCAGGCCCAATCGGCAGCCGCCCGTTCGGTGTCGCTGAAGGTGCAGGCTTCCCCGCTGGCCACTTGCAACTGGCCTTCGGCGTTGCGCTCCAGCAAGCACACCTGGGCGTCCTGCCACCCGTCCAGGTGCTGGCCGGCAGCCTTGAATATGGCTTGGCGGTCGGTGGCTACCGTCAACCGGCGAGACAGGTCGAGCAACTGGCTGGTCTGTGCCTGGGTCTCGCGCAGCGCCTGCAACTGGCGACGCTGGCGC > NC_002947/4698943‑4699236 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |