New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5925467 | 46 (0.890) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 5.8% | coding (678/1083 nt) | gcvT‑II | aminomethyltransferase |
? | NC_002947 | = 5925506 | 54 (1.090) | coding (639/1083 nt) | gcvT‑II | aminomethyltransferase |
CGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTCCAGGCCGTCCTCACCGGTATAGCCGGTGCGGGCAATGAACCAGTCGCCGTCG > NC_002947/5925332‑5925614 | cGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCggg < 7:285713/149‑1 (MQ=255) gCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGccc < 8:285087/149‑1 (MQ=255) ggCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTggg < 2:39500/149‑1 (MQ=255) aGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTggg > 5:46037/1‑140 (MQ=255) aGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTggg < 6:46037/140‑1 (MQ=255) gTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGATGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCg < 7:260181/148‑1 (MQ=255) cgcTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTGCAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCcggtatcgccccaagcggcctgggcgcccgcgataccctgcgc < 3:78718‑M1/148‑44 (MQ=255) gCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAg < 5:82589/149‑1 (MQ=255) cGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGt > 7:274616/1‑149 (MQ=255) gTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCg > 2:250328/1‑149 (MQ=255) cccAGGCGATGGTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGTGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGtt < 5:56304/148‑1 (MQ=255) ccAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTg > 5:264848/1‑148 (MQ=255) ccAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTATGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTg < 7:143054/148‑1 (MQ=255) cAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCcggtatcgccccaagcggcctgggcgcccgcgataccctgcgcctg > 8:181196‑M1/1‑90 (MQ=255) cAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCcggtatcgccccaagcggcctgggcgcccgcgataccctgcgcctg < 7:181196‑M1/136‑47 (MQ=255) gCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTgaagaa < 6:264848/149‑1 (MQ=255) gATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAgg > 2:312150/1‑149 (MQ=255) tCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCAcc > 1:183301/1‑149 (MQ=255) tCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCAcc > 6:3658/1‑149 (MQ=255) tCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCAcc > 4:142209/1‑149 (MQ=255) tCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCAcc > 5:114725/1‑149 (MQ=255) tCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTACTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCTGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAATAAGGCCAcc > 1:230717/1‑149 (MQ=255) cAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGc > 2:277900/1‑149 (MQ=255) ccAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGa < 1:312150/149‑1 (MQ=255) aGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCggg < 6:114725/149‑1 (MQ=255) gCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAgatg < 2:183301/149‑1 (MQ=255) gCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAgatg < 1:151651/149‑1 (MQ=255) gtgtGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGAtctc > 2:309329/1‑149 (MQ=255) tgtgGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTcc < 2:79698/149‑1 (MQ=255) tgGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTCCa < 1:250328/148‑1 (MQ=255) tgGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTCCAg < 6:217056/149‑1 (MQ=255) gTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTCCAGGc > 5:35717/1‑149 (MQ=255) tttCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTCCAGGCCg > 8:6170/1‑149 (MQ=255) gATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCACGGGAAGAAGCTCTCCAGGCCGTCCTCAc > 8:82704/1‑149 (MQ=255) gTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTCCAGGCCGTCCTCACCgg > 4:128912/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTCCAGGCCGTc > 5:58997/1‑138 (MQ=255) cTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTCCAGGCCGTc < 6:58997/138‑1 (MQ=255) tACAGGTTCATGCCTGCTTCCAGGCTCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGTGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTCGATGCCGTCCTCACCGGTATAGCCGGt < 2:230717/149‑1 (MQ=255) cAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTCCAGGCCGTCCTCACCGGTATAGCCGGTGc < 7:6170/149‑1 (MQ=255) ggTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTCCAGGCCGTCCTCACCGGTATAGCCGGTGCgg < 3:142209/149‑1 (MQ=255) gTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTCCAGGCCGTCCTCACCGGTATAGc > 6:27846/1‑140 (MQ=255) gTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTCCAGGCCGTCCTCACCGGTATAGc < 5:27846/140‑1 (MQ=255) tGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTCCAGGCCGTCCTCACCGGTATAGCCGGTGCGGGCAAt > 5:331280/1‑148 (MQ=255) tGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTCCAGGCCGTCCTCACCGGTATAGCCGGTGCGGGCAATg < 1:309329/149‑1 (MQ=255) gCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTCCAGGCCGTCCTCACCGGTATAGCCGGTGCGGGCAATGAACCa < 6:35717/149‑1 (MQ=255) gCTTCAAGGCGCAGGGTATCGCGGGGGCGCAGGCCGGTTGGGGCGATTCCGGCGCGGTTCTTGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATGGCCCGGGAATTTGATCTCCAGGCCGTCATCACGGGTATATCGGGTGCGGGCTATGatgga < 4:132391/149‑5 (MQ=255) cAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGgcgcctggaagccggcatgaacctgtacggccaggacatcgacgaaaaccacaccccgctcacctccaacctgggctggagcatcgcctg < 7:181196‑M2/136‑91 (MQ=255) cAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGgcgcctggaagccggcatgaacctgtacggccaggacatcgacgaaaaccacaccccgctcacctccaacctgggctggagcatcgcctg > 8:181196‑M2/1‑46 (MQ=255) aGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTCCAGGCCGTCCTCACCGGTATAGCCGGTGCggg < 6:304054/133‑1 (MQ=255) aGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTCCAGGCCGTCCTCACCGGTATAGCCGGTGCggg > 5:304054/1‑133 (MQ=255) aGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTCCAGGCCGTCCTCACCGGTATAGCCGGTGCGGGCAATGAACCAGTCGcc > 8:234309/1‑149 (MQ=255) gcgcAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGgcgcctggaagccggcatgaacctgcacggccaggacatcgacgaaaaccacaccccgctcacctccaacctgggctggagcatcgcctgggaaccggccgagcg < 3:78718‑M2/148‑106 (MQ=255) gcAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTCCAGGCCGTCCTCACCGGTATAGCCGGTGCGGGCAATGAACCAGTCGCCGTCg < 8:274616/149‑1 (MQ=255) cAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTCCAGGCCGTCCTCACCGGTATAGCCGGTGCGGGCAATGAACCAGTCGCCGt > 4:10909/1‑146 (MQ=255) cAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTCCAGGCCGTCCTCACCGGTATAGCCGGTGCGGGCAATGAACCAGTCGCCGt < 3:10909/146‑1 (MQ=255) | CGCAAGCAGGCCGACACGGCCGATGAAGTTGCGCTCGGCCGGTTCCCAGGCGATGCTCCAGCCCAGGTTGGAGGTGAGCGGGGTGTGGTTTTCGTCGATGTCCTGGCCGTACAGGTTCATGCCGGCTTCCAGGCGCAGGGTATCGCGGGCGCCCAGGCCGCTTGGGGCGATACCGGCGCCGACCAGGTCGTTGAAGAAGGCCACCGCCTGATCGCCCGGGAAGATGATCTCCAGGCCGTCCTCACCGGTATAGCCGGTGCGGGCAATGAACCAGTCGCCGTCG > NC_002947/5925332‑5925614 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |