New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 113621 = | 54 (1.050) | 4 (0.080) | 4/248 | NT | 7.3% | coding (285/738 nt) | PP_0107 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 113680 = | 50 (1.020) | coding (344/738 nt) | PP_0107 | hypothetical protein |
TGCACCTGTATGGCCGCTTCGACGCCGAGCACAGCGTGCTGCTGGACAACCGCATGCGCGACGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCGGTAGCACCTTCCAACTGCACCCGGACCCCATCGGCGGGCAATGGCCGCATCTGTTGACCGCTATC > NC_002947/113536‑113828 | ccgggcgcgacatacacagaggcatccagcgccaaggcctgggcaggggtttcgaagtgcaccggcacccggcggtccagccatgGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCAt > 4:295047‑M1/86‑147 (MQ=255) cACCTGTATGGCCGCTTCGACGCCGAGCACAGCGTGCTGCTGGACAACCGCATGCGCGACGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGc < 2:22682/148‑1 (MQ=255) cACCTGTATGGCCGCTTCGACGCCGAGCACAGCGTGCTGCTGGACAACCGCATGCGCGACGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCt > 3:312008/1‑149 (MQ=255) aCCTGTATGGCCGCTTCGACGCCGAGCACAGCGTGCTGCTGGACAACCGCATGCGCGATGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTg < 1:210163/149‑1 (MQ=255) aCCTGTATGGCCGCTTCGACGCCGAGCACAGCGTGCTGCTGGACAACCGCATGCGCGATGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAAACGTGGCTGGCTGCCATGGCTg < 5:126196/149‑1 (MQ=255) aCCTGTATGGCCGCTTCGACGCCGAGCACAGCGTGCTGCTGGACAACCGCATGCGCGACGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTg > 1:25610/1‑149 (MQ=255) cTGTATGGCCGCTTCGACGCCGAGCACAGCGTGCTGCTGGACAACCGCATGCGCGACGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGa < 7:232340/149‑1 (MQ=255) gaggcatccagcgccaaggcctgggcaggggtttcgaagtgcaccggcacccggcggtccagccatgGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCa < 1:237988‑M1/61‑1 (MQ=255) gaggcatccagcgccaaggcctgggcaggggtttcgaagtgcaccggcacccggcggtccagccatgGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCa > 2:237988‑M1/68‑128 (MQ=255) gACGCCGAGCACAGCGTGCTGCTGGACAACCGCATGCGCGACGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCgg < 4:109329/148‑1 (MQ=255) gACGCCGAGCACAGCGTGCTGCTGGACAACCGCATGCGCGACGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGt < 6:160088/149‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCTGGACAACCGCATGCGCGACGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAAcc < 6:169884/149‑1 (MQ=255) cGTGCTGCTGGACAACCGCATGCGCGACGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAAccc > 1:193296/1‑149 (MQ=255) tgctgcTGGACAACCGCATGCGCGACGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCt < 4:97513/149‑1 (MQ=255) tgGACAACCGCATGCGCGACGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAg > 2:34585/1‑149 (MQ=255) gACAACCGCATGCGCGACGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTTCCGGTTCAC‑TTCGAAACACCTGCCCAGGc < 4:312008/149‑1 (MQ=255) gACAACCGCATGCGCGACGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAg < 6:155362/147‑1 (MQ=255) ccGCATGCGCGACGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTgg > 7:112853/1‑149 (MQ=255) ccGCATGCGCGACGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCAGCCCAGGCCTTgg > 6:18702/1‑149 (MQ=255) cATGCGCGACGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGgcgc > 5:83859/1‑149 (MQ=255) aTGCGCGACGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCt < 1:281705/149‑1 (MQ=255) aTGCGCGACGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCt < 1:286271/149‑1 (MQ=255) gcgACGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCACTTTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGa < 1:34585/149‑1 (MQ=255) gcgACGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAgg < 7:166123/135‑1 (MQ=255) gcgACGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAgg > 8:166123/1‑135 (MQ=255) ggCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCctc > 1:57824/1‑149 (MQ=255) aGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTT‑CACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTa < 2:56940/149‑1 (MQ=255) ccGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTAt < 3:97435/149‑1 (MQ=255) ggTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGt < 8:112853/149‑1 (MQ=255) gtgtCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTc < 2:82435/149‑1 (MQ=255) atggcagccagccacgattgatcagcaaccacaggccgctggcttggtcgtggaagggctgcCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCgg > 4:295047‑M2/63‑147 (MQ=255) tggcagccagccacgattgatcagcaaccacaggccgctggcttggtcgtggaagggctgcCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCctc < 1:237988‑M2/67‑1 (MQ=255) tggcagccagccacgattgatcagcaaccacaggccgctggcttggtcgtggaagggctgcCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCctc > 2:237988‑M2/62‑128 (MQ=255) ctgcAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCGGTa < 6:83859/148‑1 (MQ=255) tgcAGCCCTTCAACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCGGTAGc > 6:335655/1‑149 (MQ=255) GCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCGGTAGCACCt < 8:58908‑M1/149‑1 (MQ=255) ccACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCg > 8:239208/1‑134 (MQ=255) ccACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCg < 7:239208/134‑1 (MQ=255) cACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCGGTAGCACCTTCCAACt > 4:303626/1‑149 (MQ=255) aCGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTgtgt > 4:119080/1‑120 (MQ=255) aCGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTgtgt < 3:119080/120‑1 (MQ=255) aCGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCGGTAGCACCTTCCAACTg > 2:258118/1‑149 (MQ=255) aCGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCGGTAGCACCTTCCAACTg > 3:101680/1‑149 (MQ=255) cAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCGGTAGCACCTTCCAACTGCAccc > 6:23955/1‑149 (MQ=255) cAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTAGCGCCCGGTAGCACCTTCAAACTGCAccc > 1:139298/1‑149 (MQ=255) aaGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCGGTAGCACCTTCCAACTGCACCCg > 5:294088/1‑149 (MQ=255) ccAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCGGTAGCACCTTCCAACTGCACCCGGAc < 1:258118/149‑1 (MQ=255) aGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCGGTAGCACCTTCCAACTGCACCCGGAccc > 3:296534/1‑149 (MQ=255) tgGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCGGTAGCACCTTCCAACTGCACCCGGACCCCATcggcgg < 5:23955/149‑1 (MQ=255) cggTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTg > 2:45708/2‑87 (MQ=255) cggTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTg < 1:45708/86‑1 (MQ=255) gTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCGGTAGCACCTTCCAACTGCACCCGGACCCCATCGGCggg > 6:46107/1‑148 (MQ=255) gTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCGGTAGCACCTTCCAACTGCACCCGGACCCCATCGGCGGGc < 4:101680/149‑1 (MQ=255) cgctggcttggtcgtggaagggctgcCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCGGTAGCACCTTCCAACTGCACCCGGACCCCATCGGCGGGc < 3:295047‑M2/123‑1 (MQ=255) cTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCGGTAGCACCTTCCAACTGCACCTGGACCCCATCGGCGGGCAAt < 2:57824/148‑1 (MQ=255) cTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCGGTAGCACCTTCCAACTGCACCCGGACCCCATCGGCGGGCAAt < 7:62648/148‑1 (MQ=255) tGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCGGTAGCACCTTCCAACTGCACCCGGACCCCATCGGCGGGCAATgg > 7:170865/1‑149 (MQ=255) aTCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCGGTAGCACCTTCCAACTGCACCCGGACCCCATCGGCGGGCAATGGCCGCAt < 4:296534/149‑1 (MQ=255) cATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCGGTAGCACCTTCCAACTGCACCCGGACCCCATCGGCGGGCAATGGCCGCATCTGTTGACCGCTATc < 7:58908/149‑1 (MQ=255) | TGCACCTGTATGGCCGCTTCGACGCCGAGCACAGCGTGCTGCTGGACAACCGCATGCGCGACGGCAAAGCCGGTGTCGAGCTGCTGCAGCCCTTCCACGACCAAGCCAGCGGCCTGTGGTTGCTGATCAATCGTGGCTGGCTGCCATGGCTGGACCGCCGGGTGCCGGTGCAC‑TTCGAAACCCCTGCCCAGGCCTTGGCGCTGGATGCCTCTGTGTATGTCGCGCCCGGTAGCACCTTCCAACTGCACCCGGACCCCATCGGCGGGCAATGGCCGCATCTGTTGACCGCTATC > NC_002947/113536‑113828 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |