New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1401051 = | 16 (0.310) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 14.5% | coding (46/648 nt) | queE | 7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase |
? | NC_002947 | 1401099 = | 20 (0.410) | coding (94/648 nt) | queE | 7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase |
GTGCCTGACGGAGGCGGACAGCCTGTTTAGCTGTCACGCCCGTGGCGAGCATGCAAGACACATTACGCATCACCGAAGTCTTTTACTCTTTGCAGGGTGAGACGCGAACGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTCGAACAAGTGGCCGGCTTCAAACCGCGCTACGTCTGTGTCACCGGTGGCGAACCACTGGCCCAGC > NC_002947/1400956‑1401243 | ccggccacttgttcgaggatcgaatcaagggtgcgtacggtaccgccactgaaggcataggcactgtcgcagtactggcaacgcagggggcaaccGGTGAGACGCGAACGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCg < 8:195710‑M1/49‑1 (MQ=255) ccggccacttgttcgaggatcgaatcaagggtgcgtacggtaccgccactgaaggcataggcactgtcgcagtactggcaacgcagggggcaaccGGTGAGACGCGAACGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCg > 7:195710‑M1/96‑144 (MQ=255) aCGGAGGCGGACAGCCTGTTTAGCTGTCACGCCCGTGGCGAGCATGCAAGACACATTACGCATCACCGAAGTCTTTTACTCTTTGCAGGGTGAGACGCGAACGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGTTGCCCCCt < 3:101968/147‑1 (MQ=255) gCTGTCACGCCCGTGGCGAGCATGCAAGACACATTACGCATCACCGAAGTCTTTTACTCTTTGCAGGGTGAGACGCGAACGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGc > 8:46026/1‑149 (MQ=255) cATGCAACACACATTACGCATCACCGAAGTCTTTTACTCTTTGCAGGGGGAGACGCGAACGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTa < 6:218358/149‑1 (MQ=255) aGACACATTACGCATCACCGAAGTCTTTTACTCTTTGCAGGGTGAGACGCGAACGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGtt < 3:151013/92‑1 (MQ=255) aGACACATTACGCATCACCGAAGTCTTTTACTCTTTGCAGGGTGAGACGCGAACGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGtt > 4:151013/1‑92 (MQ=255) cGCATCACCGAAGTCTTTTACTCTTTGCAGGGTGAGACGCGAACGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGa < 7:282738/149‑1 (MQ=255) aTCACCGAAGTCTTTTACTCTTTGCAGGGTGAGACGCGAACGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTc > 3:56305/1‑149 (MQ=255) cGAAGTCTTTTACTCTTTGCAGGGTGAGACGCGAACGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATcc < 4:75610/149‑1 (MQ=255) ttttACTCTTTGCAGGGTGAGACGCGAACGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTCGAAc > 5:122801/1‑148 (MQ=255) ttttACTCTTTGCAGGGTGAGACGCGAACGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTCGAAc > 8:12097/1‑148 (MQ=255) aCTCTTTGCAGGGTGAGACGCGAACGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTCGAACAAGt < 7:46026/148‑1 (MQ=255) tttGCAGGGTGAGACGCGAACGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTCGAACAAGTGGCCg > 1:327013/1‑149 (MQ=255) tGCAGGGTGAGACGCGAACGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTCGAACAAGTGGcc < 8:178535/146‑1 (MQ=255) tGCAGGGTGAGACGCGAACGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTCGAACAAGTGGCCgg < 4:56305/148‑1 (MQ=255) cggtgaggcgcacaaataccgtgggcagcccggccgttcgcgtctcaccGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTCGAACAAGTGGCCgg < 8:195710‑M2/95‑1 (MQ=255) cggtgaggcgcacaaataccgtgggcagcccggccgttcgcgtctcaccGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTCGAACAAGTGGCCgg > 7:195710‑M2/50‑144 (MQ=255) ggtgaggcgcacaaataccgtgggcagcccggccgttcgcgtctcaccGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTCGAACAAGTGGCCGGCTTCa > 3:188483‑M2/49‑148 (MQ=255) GGTGAGACGCGAACGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTCGAACAAGTGGCCGGCTTCa < 7:303075‑M1/148‑1 (MQ=255) aCGCGAACGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTCGAACAAGTGGCCGGCTTCAAACcgcg > 4:192573/1‑149 (MQ=255) gcgAACGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTc > 1:171577/1‑121 (MQ=255) gcgAACGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTc < 2:171577/121‑1 (MQ=255) gAACGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTCGAACAAGTGGCCGGCTTCAAACCGCGCTAc > 1:230372/1‑149 (MQ=255) cGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTCGAACAAGTGGCCGGCTTCAAACCGCGCTACGTc < 7:12097/149‑1 (MQ=255) ccGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTCGAACAAGTGGCCGGCTTCAAACCGCGCTACGTCtgt > 3:102857/1‑149 (MQ=255) cGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTCGAACAAGTGGCCGGCTTCAAACCGCGCTACGTCtgtg > 3:161879/1‑149 (MQ=255) cACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGCCAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTCGAACAAGTGGCCGGCTTCAAACCGCGCTACGTCTGTGTCACCGGTg > 2:208743/1‑149 (MQ=255) tgCGCCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTCGAACAAGTGGCCGGCTTCAAACCGCGCTACGTCTGTGTCACCGGTGGCGAACCACTg < 6:122801/149‑1 (MQ=255) cgcCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCATTGGCGGTACCGTACCCACACtt > 4:205432/1‑78 (MQ=255) cgcCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCtt < 3:205432/78‑1 (MQ=255) gcCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTCGAACAAGTGGCCGGCTTCAAACCGCGCTACGTCTGTGTCACCGGTGGCGAACCACTGgcc > 3:67196/1‑149 (MQ=255) tcaccGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTCGAATAAGTGGCCGGCTTCAAACCGCGCTACGTCTGTGTCACCGGTGGCGAACCACTGgcccag > 6:281529‑M2/6‑149 (MQ=255) caccGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTCGAACAAGTGGCCGGCTTCAAACCGCGCTACGTCTGTGTCACCGGTGGCGAACCACTGgcccagc > 5:86552‑M2/5‑149 (MQ=255) accGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTCGAACAAGTGGCCGGCTTCAAACcgcg > 8:152106‑M2/4‑110 (MQ=255) | GTGCCTGACGGAGGCGGACAGCCTGTTTAGCTGTCACGCCCGTGGCGAGCATGCAAGACACATTACGCATCACCGAAGTCTTTTACTCTTTGCAGGGTGAGACGCGAACGGCCGGGCTGCCCACGGTATTTGTGCGCCTCACCGGTTGCCCCCTGCGTTGCCAGTACTGCGACAGTGCCTATGCCTTCAGTGGCGGTACCGTACGCACCCTTGATTCGATCCTCGAACAAGTGGCCGGCTTCAAACCGCGCTACGTCTGTGTCACCGGTGGCGAACCACTGGCCCAGC > NC_002947/1400956‑1401243 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |