| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2403799 = | 73 (1.410) | 5 (0.100) | 4/240 | NT | 6.6% | coding (426/1209 nt) | PP_2106 | ammonium transporter |
| ? | NC_002947 | 2403860 = | 75 (1.570) | coding (487/1209 nt) | PP_2106 | ammonium transporter | |||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
CATTGCCGAGCGGGCGCGGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCATTCCCTTTCTGGCGCTGGGCTC > NC_002947/2403712‑2404008 | ccgcccacggcgcgcgcccagcaacagcaccgccgccagcgccagccagccccccatggcgtgtaccaccacagacccgacaaagtcGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACg > 8:195469‑M1/88‑149 (MQ=255) aTTGCCGAGCGGGCGCGGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACg > 6:111336/1‑148 (MQ=255) cccacggcgcgcgcccagcaacagcaccgccgccagcgccagccagccccccatggcgtgtaccaccacagacccggcaaagtcGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACg < 1:154704‑M1/62‑1 (MQ=255) gCCGAGCAGGCGCGGTTCGTGCCGCATTTGTGCGCTACGGCGGTGATGGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTTGAAAGGTAATCCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGAc < 1:81960/148‑1 (MQ=255) ccGAGCGGGCGCGGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CCGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACttt > 5:141693/1‑149 (MQ=255) ccGAGCGGGCGCGGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGCGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACttt < 6:269768/149‑1 (MQ=255) gAGCGGGCGCGGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGTTCGTGGCGTTCGGCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGc < 7:201902/149‑1 (MQ=255) gCGGGCGCGGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCg < 5:111336/149‑1 (MQ=255) gggCGCGGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCggg < 8:93491/149‑1 (MQ=255) ggCGCGGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGt < 2:310035/149‑1 (MQ=255) ggTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCtgtg > 5:183775/1‑149 (MQ=255) gTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTgtgg < 6:320563/149‑1 (MQ=255) gTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTggtggt < 4:277414/149‑1 (MQ=255) gTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTggtggt < 6:40908/149‑1 (MQ=255) gCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTa > 6:1993/1‑148 (MQ=255) tgCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑ggg < 5:1993/149‑1 (MQ=255) tgCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑ggg < 2:84237/149‑1 (MQ=255) gcTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑gggggg > 4:94512/1‑149 (MQ=255) cTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTggtggt > 2:300296/1‑133 (MQ=255) cTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTggtggt < 1:300296/133‑1 (MQ=255) tACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGCCTTTGCCGGGTCTgtggtg > 8:222720/1‑130 (MQ=255) tACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTgtggtg < 7:222720/130‑1 (MQ=255) tACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGggct > 8:84769/1‑149 (MQ=255) aTCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑‑GGGGGCTGgctggcgctg > 4:81676/1‑149 (MQ=255) gCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTggtggt < 2:269445/116‑1 (MQ=255) ttCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGGGTGGTTGGGAACGGTAAT‑CTGGTCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCGTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGt < 7:287315/149‑1 (MQ=255) cTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGgctggcg > 1:55358/1‑133 (MQ=255) cTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGgctggcg < 2:55358/133‑1 (MQ=255) cTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTg < 6:198651/148‑1 (MQ=255) tATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGtt > 6:3199/1‑149 (MQ=255) tATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTC‑GCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTg > 4:174671/1‑149 (MQ=255) tCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGATGCTGTTGc > 4:223483/1‑149 (MQ=255) cGTTCTTCGAGGTGGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCAGGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCt < 6:33639/148‑1 (MQ=255) gTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTac < 8:171375/104‑1 (MQ=255) gTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTgg > 3:114873/1‑149 (MQ=255) gTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCAGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGAGCTTGCGGCGGTGCTGTTGATgg > 7:132128/1‑149 (MQ=255) ttcttcGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTgtgg < 4:310189/97‑1 (MQ=255) ttcGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGgcgc > 3:260194/1‑149 (MQ=255) cGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGgcgcgc > 5:111797/1‑149 (MQ=255) cGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGgcgcgc > 5:260401/1‑149 (MQ=255) gAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGgcgcgcg > 1:199861/1‑149 (MQ=255) aGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTgtggtg < 1:281616/92‑1 (MQ=255) 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gtgtggAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCg > 2:264997/1‑149 (MQ=255) gtgtggAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGATGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCg < 3:223483/149‑1 (MQ=255) cgtggaacggtgcgccgaagcgtgcctgcagccaagcctgtaggcccagattaccgttccacGACTTTGTCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCgg > 8:195469‑M2/63‑149 (MQ=255) cgtggaacggtgcgccgaagcgtgcctgcagccaagcctgtaggcccagattaccgttccacGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTggg < 1:154704‑M2/84‑1 (MQ=255) cgtggaacggtgcgccgaagcgtgcctgcagccaagcctgtaggcccagattaccgttccacGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTggg > 2:154704‑M2/63‑146 (MQ=255) gtggaacggtgcgccgaagcgtgcctgcagccaagcctgtaggcccagattaccgttccacGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTg > 3:297368‑M2/62‑121 (MQ=255) GAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTAcc < 4:138491‑M1/149‑1 (MQ=255) GGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGa < 6:180389‑M1/149‑1 (MQ=255) GTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGAt < 4:293371‑M1/149‑1 (MQ=255) GTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGAt < 3:294600‑M1/149‑1 (MQ=255) aT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATgg < 4:114873/148‑1 (MQ=255) gggCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGtt > 6:185688/1‑149 (MQ=255) ggCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGttt > 5:278012/1‑149 (MQ=255) ggCCTACAGGCTTGGCTGCAGGAACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACATTGCCGGTTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGTGGCCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGAGCTGTAGCTGGGCGCGCGCCTTCGGCCGTACCGCGATGGCCGttt > 2:66032/1‑149 (MQ=255) ccTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTtgg > 6:60805/1‑149 (MQ=255) 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gCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCAtt > 4:88795/1‑149 (MQ=255) gCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTGGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCAtt < 5:231363/149‑1 (MQ=255) ttCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCATTcc > 6:255377/1‑149 (MQ=255) gcgcACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCATGGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCATTCCCtt > 5:303915/1‑149 (MQ=255) gcgcACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCATTCCCttt < 3:13879/149‑1 (MQ=255) gcACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGACGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCATTCCCTTTCt > 6:148679/1‑149 (MQ=255) cACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCATTCCCTTTCTg < 4:294600/149‑1 (MQ=255) cACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCATTCCCTTTCTg < 3:138491/149‑1 (MQ=255) cACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCATTCCCTTTCTg < 3:293371/149‑1 (MQ=255) cACCGAACCACGACTTTGCCGGGTCTCTCGTGCTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCAGGCGCTGGCGGCGGTGCAGTTCCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGCGCGTTAGGTGCCTTTTGCGCCATCGAGCATTCCCTTTCTg > 8:28591/1‑149 (MQ=255) gttccacGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCATTCCCTTTCTGgcgc > 2:263942‑M2/8‑149 (MQ=255) ttccacGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCATTCCCTTTCTGGCGCt < 4:260194‑M2/143‑1 (MQ=255) ccacGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCATTCCCTTTCTGGCGCTgg > 6:222064‑M2/5‑149 (MQ=255) ccacGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCATTCCCTTTCTGGCGCTg < 5:60805‑M2/144‑1 (MQ=255) cacGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCATTCCCTTTCTgg > 5:132183‑M2/4‑142 (MQ=255) cacGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCATTCCCTTTCTgg < 6:132183‑M2/139‑1 (MQ=255) acGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGcggcgg < 8:151194‑M2/58‑1 (MQ=255) acGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGcggcgg > 7:151194‑M2/3‑60 (MQ=255) gACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCATTCCCTTTCTGGCGCTGGGCTc > 3:45773/1‑149 (MQ=255) gACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCATTCCCTTTCTGGCGCTGGGCTc < 1:326107/149‑1 (MQ=255) | CATTGCCGAGCGGGCGCGGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAAT‑CTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCAT‑GGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCATTCCCTTTCTGGCGCTGGGCTC > NC_002947/2403712‑2404008 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |