New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2944810 = | 60 (1.160) | 4 (0.080) | 3/244 | NT | 6.3% | coding (1239/1641 nt) | PP_2577 | paraquat‑inducible protein B |
? | NC_002947 | 2944851 = | 63 (1.300) | coding (1280/1641 nt) | PP_2577 | paraquat‑inducible protein B |
GAACATGGGCTGCGGGCCCAGGCGCGTAGCGGCAACCTGATCACCGGGCAGATGTTCATTTCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTGCGCGCCAGCCTCAGGCAGTTCAATGGCCAGACGCTGCCGGAGGTG > NC_002947/2944706‑2944996 | gAACATGGGCTGCGGGCCCAGGCGCGTAGCGGCAACCTGATCACCGGGCAGATGTTCATTTCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGa < 1:31817/149‑1 (MQ=255) aaCATGGGCTGCGGGCCCAGGCGCGTAGCGGCAACCTGATCACCGGGCAGATGTTCATTTCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAg > 1:71728/1‑149 (MQ=255) aCATGGGCTGCGGGCCCAGGCGCGTAGCGGCAACCTGATCACCGGGCAGATGTTCATTTCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAg > 3:285114/1‑148 (MQ=255) tcacgcaagctaccgtccaggttaccggcgatgctttccagcggcagcttggcaatgcgctccatcacccgctgcagctgttcctgcaactgctcaaGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCt < 6:180308‑M1/42‑1 (MQ=255) tcacgcaagctaccgtccaggttaccggcgatgctttccagcggcagcttggcaatgcgctccatcacccgctgcagctgttcctgcaactgctcaaGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCt > 5:180308‑M1/98‑139 (MQ=255) cTGCGGGCCCAGGCGCGTAGCGGCAACCTGATCACCGGGCAGATGTTCATTTCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCa < 1:194997/149‑1 (MQ=255) cGGGCCCAGGCGCGTAGCGGCAACCTGATCACCGGGCAGATGTTCATTTCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAgg > 5:103102/1‑148 (MQ=255) gggCCCAGGCGCGTAGCGGCAACCTGATCACCGGGCAGATGTTCATTTCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGaa > 5:167409/1‑149 (MQ=255) ggCCCAGGCGCGTAGCGGCAACCTGATCACCGGGCAGATGTTCATTTCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGaa > 7:159811/1‑148 (MQ=255) gCCCAGGCGCGTAGCGGCAACCTGATCACCGGGCAGATGTTCATTTCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACa < 3:2349/149‑1 (MQ=255) cccAGGCGCGTAGCGGCAACCTGATCACCGGGCAGATGTTCATTTCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTAGCAGGAACAg > 4:196750/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGCGTAGCGGCAACCTGATCACCGGGCAGATGTTCATTTCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGATGCAGGAACAGc > 8:174179/1‑149 (MQ=255) gcgcGTAGCGGCAACCTGATCACCGGGCAGATGTTCATTTCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTg > 6:59262/1‑147 (MQ=255) gcgcGTAGCGGCAACCTGATCACCGGGCAGATGTTCATTTCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTg > 1:98117/1‑147 (MQ=255) cgTAGCGGCAACCTGATCACCGGGCAGATGTTCATTTCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCg < 7:174179/149‑1 (MQ=255) cGGCAACCTGATCACCGGGCAGATGTTCTTTTCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGa < 3:7378/149‑1 (MQ=255) cGGCAACCTGATCACCGGGCAGATCTGCATTGCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGCTCCCG‑CCGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGa < 6:150029/149‑1 (MQ=255) ggCAACCTGATCACCGGTCCGAGGTTCATTTCGCTGGACTTTTACGCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCGTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGAt < 7:217962/149‑1 (MQ=255) gCAACCTGATCACCGGGCAGATGTTCATTTCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGAGGGTGATg > 5:1842/1‑149 (MQ=255) aCCTGATCACCGGGCAGATGTTCATTTCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAg < 5:59262/149‑1 (MQ=255) ccTGATCACCGGGCAGATGTTCATTTCGCTGGACTATTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGACAAGCTGCAGCGGGTGATGGAgc > 8:88003/1‑149 (MQ=255) gATCACCGGGCAGATGTTCATTTCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCa > 4:161331/1‑149 (MQ=255) aTCACCGGGCAGATGTTCATTTCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCAt > 4:81425/1‑149 (MQ=255) cATTTCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCtt < 4:252713/91‑1 (MQ=255) cATTTCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCtt > 3:252713/1‑91 (MQ=255) cATTTCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTg < 4:76179/148‑1 (MQ=255) tCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGaaa < 6:167409/148‑1 (MQ=255) gCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGc < 7:73679/148‑1 (MQ=255) gCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCa > 1:11738/1‑149 (MQ=255) gACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGc > 8:264402/1‑149 (MQ=255) cTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCg < 2:98117/149‑1 (MQ=255) ttttACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCGGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCgg > 3:298656/1‑149 (MQ=255) ttttACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCg > 6:214592/1‑132 (MQ=255) ttttACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCg < 5:214592/132‑1 (MQ=255) ttttACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCgg > 2:125390/1‑149 (MQ=255) ccccGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAAc < 2:11738/148‑1 (MQ=255) cccGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCt > 3:231954/1‑149 (MQ=255) cccGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCt < 7:264402/149‑1 (MQ=255) cccGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCt > 8:240126/1‑149 (MQ=255) ccGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTg < 8:159811/149‑1 (MQ=255) ccccAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACgg > 1:36241/1‑147 (MQ=255) ccccAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTa < 1:35714/149‑1 (MQ=255) cccAAGGTGGCCTTCGACGTGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAg > 2:83722/1‑149 (MQ=255) cccAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCGAACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACgg > 1:73684/1‑147 (MQ=255) ccAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATg < 3:215495/95‑1 (MQ=255) ccAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATg > 4:215495/1‑95 (MQ=255) 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5:17512/125‑1 (MQ=255) aCATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCTTTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTgcgc < 7:88003/149‑1 (MQ=255) aggctgccgggcagcgtcgggatcatgatggggtcggcagccTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGa < 6:180308‑M2/97‑1 (MQ=255) aggctgccgggcagcgtcgggatcatgatggggtcggcagccTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGa > 5:180308‑M2/43‑139 (MQ=255) GGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGa > 1:94222‑M1/1‑57 (MQ=255) GGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGa < 2:94222‑M1/57‑1 (MQ=255) ggctgccgggcagcgtcgggatcatgatggggtcggcagccTTGCGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGCGCGGATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTgcgcgc > 8:219402‑M2/42‑147 (MQ=255) ggctgccgggcagcgtcgggatcatgatggggtcggcagccTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTgcgcgc > 3:88509‑M2/42‑147 (MQ=255) GCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTGCGCGCCa > 2:36241‑M1/1‑148 (MQ=255) CTGCCGAACCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGAGAGCTGCGCGCCAGc < 5:233379‑M1/149‑1 (MQ=255) aCCCCATCATGATGCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTGCGCGCCAGCCTCAgg < 6:103102/149‑1 (MQ=255) cccATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCtt < 8:144863/122‑1 (MQ=255) cccATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCtt > 7:144863/1‑122 (MQ=255) cccATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAACTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTGCGCGCCAGCCTCAgg > 8:154326/1‑147 (MQ=255) atcatGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGcc < 4:153315/99‑1 (MQ=255) atcatGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGcc > 3:153315/1‑99 (MQ=255) atcatGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTGCGCGCCAGCCTCAGGCAGtt < 2:73684/149‑1 (MQ=255) tGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTGCGCGCCAGCCTCAGGCAGTTCAAt > 4:307227/1‑149 (MQ=255) tGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTGCGCGCCAGCCTCAGGCAGTTCAAt < 3:307227/149‑1 (MQ=255) aTCCCG‑ACGCTGCCCGGCGGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTGCGCGCCAGCCTCAGGCAGTTCAATg < 4:298656/148‑1 (MQ=255) aTCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCATCCGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTGCGCGCCAGCCTCAGGCAGTTCAAt < 1:90761/148‑1 (MQ=255) aTCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTGCGCGCCAGCCTCAGGCAGTTCAATgg > 5:104340/1‑149 (MQ=255) ccG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTGCGCGCCAGCCTCAGGCAGTTCAATGGcc < 1:269009/148‑1 (MQ=255) ccG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTGCGCGCCAGCCTCAGGCAGTTCAATGGcc > 2:269009/1‑148 (MQ=255) ccG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTGCGCGCCAGCCTCAGGCAGTTCAATGGc > 1:36900/1‑147 (MQ=255) ccG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTGCGCGCCAGCCTCAGGCAGTTCAATGGc < 2:36900/147‑1 (MQ=255) aCGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTGCGCGCCAGCCTCAGGCAGTTCAATGGCCAGAc < 4:231954/149‑1 (MQ=255) cTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGATGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTGCGCGCCAGCCTCAGGCAGTTCAATGGCCAGACGCt > 4:79138/1‑149 (MQ=255) gCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTACCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTa > 6:145861/1‑98 (MQ=255) gCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTACCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTa < 5:145861/98‑1 (MQ=255) cccGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTGCGCGCCAGCCTCAGGCAGTTCAATGGCCAGACGCTGcc < 1:83722/149‑1 (MQ=255) cggcagccTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTGCGCGCCAGCCTCAGGCAGTTCAATGGCCAGACGCTGCCgg < 3:161331‑M2/141‑1 (MQ=255) gctgCCTTGAGCAGTTGACGGAACTGCTGATGGGGTTGATGTCGCGATTTGCCATGATGCCGGTGTAATGAAT‑GGCCGGTAACCTGGCCGGTTGCTTGGGTTTGTTGGGGGCAAGCCTCAGGCTGTT‑AATGGCCAGACGCTGCCGGAgg < 6:233379/146‑1 (MQ=255) agccTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTGCGCGCCAGCCTCAGGCAGTTCAATGGCCAGACGCTGCCGGAGGt > 6:225780‑M2/5‑149 (MQ=255) gccTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTGCGCGCCAGCCTCAGGCAGTTCAATGGCCAGACGCTGCCGGAGGTg < 6:1842‑M2/146‑1 (MQ=255) ccTTGAGTAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTGCGCGCCAGCCTCAGGCAGTTCAATGGCCAGACGCTGCCGGAGGTg > 8:143980‑M2/3‑148 (MQ=255) ttGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTgcgcgc > 3:128827/1‑106 (MQ=255) ttGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTgcgcgc < 4:128827/106‑1 (MQ=255) | GAACATGGGCTGCGGGCCCAGGCGCGTAGCGGCAACCTGATCACCGGGCAGATGTTCATTTCGCTGGACTTTTACCCCGATGCCCCCAAGGTGGCCTTCGACATGGCTGCCGACCCCATCATGATCCCG‑ACGCTGCCCGGCAGCCTTGAGCAGTTGCAGGAACAGCTGCAGCGGGTGATGGAGCGCATTGCCAAGCTGCCGCTGGAAAGCAT‑CGCCGGTAACCTGGACGGTAGCTTGCGTGAGCTGCGCGCCAGCCTCAGGCAGTTCAATGGCCAGACGCTGCCGGAGGTG > NC_002947/2944706‑2944996 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |